-
BSA
Ny sehatra Famakafakana Segregant Bulked dia misy famakafakana manara-penitra iray dingana sy famakafakana mandroso miaraka amin'ny fametrahana paramètre namboarina.BSA dia teknika ampiasaina hamantarana haingana ireo marika fototarazo mifandraika amin'ny phenotype.Ny fizotran'ny asa lehibe ao amin'ny BSA dia ahitana: 1. fifantenana vondron'olona roa miaraka amin'ny phenotypes tena mifanohitra;2. fampivondronana ny ADN, RNA na SLAF-seq (Novolavolain'ny Biomarker) an'ny tsirairay mba hamoronana ADN roa;3. Famantarana ny filaharana tsy mitovy amin'ny génome reference na eo anelanelany, 4. maminavina ny faritra mifandray amin'ny kandidà amin'ny alàlan'ny algorithm ED sy SNP-index;5. Famakafakana sy fanatsarana ny fototarazo ao amin'ny faritra mpilatsaka hofidina, sns. Misy koa ny fitrandrahana harena an-kibon'ny tany mandroso kokoa ao anatin'izany ny fitiliana ny marika génétique sy ny famolavolana primer.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Ny sehatra Amplicon (16S/18S/ITS) dia novolavolaina tamin'ny traikefa an-taonany tamin'ny famakafakana tetikasa isan-karazany mikraoba, izay misy famakafakana fototra manara-penitra sy famakafakana manokana: ny famakafakana fototra dia mandrakotra ny votoatin'ny famakafakana mahazatra amin'ny fikarohana mikraoba ankehitriny, ny votoatin'ny fanadihadiana dia manankarena sy feno, ary ny valin'ny fanadihadiana dia aseho amin'ny endrika tatitra momba ny tetikasa;Ny votoatin'ny famakafakana manokana dia isan-karazany.Santionany dia azo voafantina sy masontsivana azo apetraka flexibly araka ny fanadihadiana fototra tatitra sy ny fikarohana tanjona, mba hahatakatra ny fepetra manokana.Windows rafitra fandidiana, tsotra sy haingana.
-
Genetika evolisiona
Ny génétika evolisiona dia serivisy filaharana feno feno natao hanomezana fanazavana feno momba ny fampahalalana momba ny evolisiona momba ny fitaovana nomena mifototra amin'ny fiovaovan'ny fototarazo, ao anatin'izany ny SNPs, InDels, SVs ary CNVs.Izy io dia manome ny famakafakana fototra rehetra ilaina amin'ny famaritana ny fiovan'ny evolisiona sy ny toetran'ny fototarazo amin'ny mponina, toy ny firafitry ny mponina, ny fahasamihafan'ny fototarazo, ny fifandraisana amin'ny phylogeny, sns. Izy io koa dia mirakitra fanadihadiana momba ny fikorianan'ny fototarazo, izay manome hery ny fanombanana ny haben'ny mponina mahomby, ny fotoana tsy fitoviana.
-
Génomika fampitahana
Ny génomika fampitahana dia midika ara-bakiteny ny fampitahana ny filaharan'ny fototarazo feno sy ny firafitry ny karazana samihafa.Ity taranja ity dia mikendry ny hampiseho ny fivoaran'ny karazana, ny fiasan'ny fototarazo, ny rafitra mifehy ny fototarazo amin'ny ambaratongan'ny génome amin'ny alàlan'ny famantarana ny firafitry ny filaharana sy ny singa izay nitahiry na nanavaka ny karazana samihafa.Ny fandalinana génomika fampitahana mahazatra dia ahitana ny famakafakana ao amin'ny fianakavian'ny fototarazo, ny fivoaran'ny evolisiona, ny dika mitovy amin'ny genome manontolo, ny tsindry mifantina, sns.
-
Genetika evolisiona
Ny sehatra famakafakana fototarazo momba ny mponina sy ny evolisiona dia miorina amin'ny fototry ny traikefa goavana voaangona tao anatin'ny ekipa BMK R&D nandritra ny taona maro.Izy io dia fitaovana mora ampiasaina indrindra ho an'ny mpikaroka izay tsy manana mari-pahaizana momba ny bioinformatics.Ity sehatra ity dia ahafahan'ny fanadihadiana fototra mifandraika amin'ny fototarazo evolisiona ao anatin'izany ny fananganana hazo phylogenetic, ny famakafakana ny tsy fitoviana amin'ny fifandraisana, ny fanombanana ny fahasamihafan'ny fototarazo, ny famakafakana famafazana voafantina, ny fanadihadiana momba ny fianakaviana, ny PCA, ny fanadihadiana momba ny firafitry ny mponina, sns.
-
Hi-C miorina amin'ny Genome Assembly
Ny Hi-C dia fomba iray natao hisamborana ny fandrindrana krômôzôma amin'ny alàlan'ny fampifangaroana ny fifandraisana mifototra amin'ny akaiky sy ny filaharana avo lenta.Ny hamafin'ireo fifandraisana ireo dia heverina fa misy ifandraisany amin'ny elanelana ara-batana amin'ny chromosome.Noho izany, ny angon-drakitra Hi-C dia afaka mitarika ny fivondronana, ny filaharana ary ny fandrindrana ny filaharana miangona ao amin'ny fototarazo iray ary ny fametrahana azy ireo amin'ny krômôzôma maromaro.Ity teknôlôjia ity dia manome hery ny fivorian'ny génomôma ambaratongan'ny krômôzôma raha tsy misy sarintany fototarazo mifototra amin'ny mponina.Ny génome tsirairay dia mila Hi-C.
Platform: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Zavamaniry/biby De Novo Genome Sequencing
De NovoNy sequencing dia manondro ny fananganana fototarazo iray manontolo amin'ny alàlan'ny teknolojian'ny filaharana, ohatra, PacBio, Nanopore, NGS, sns., raha tsy misy fototarazo reference.Ny fanatsarana miavaka amin'ny halavan'ny famakiana ny teknolojian'ny andiany fahatelo dia nitondra fahafahana vaovao amin'ny fanangonana génome sarotra, toy ireo manana heterozygosity avo, tahan'ny faritra miverimberina, polyploids, sns. famahana singa miverimberina, faritra misy atiny GC tsy ara-dalàna ary faritra hafa be pitsiny.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq Platform
-
Fizarana Exome manontolo olombelona
Ny sequencing exome manontolo (WES) dia raisina ho tetik'ady fandrefesana lafo vidy hamantarana ny fiovan'ny aretina.Na dia eo amin'ny 1.7% eo ho eo amin'ny génome iray manontolo aza ny exon, dia maneho mivantana ny mombamomba ny fiasan'ny proteinina manontolo izany.Ao amin'ny génome olombelona, voalaza fa mihoatra ny 85% ny fiovan'ny aretina mifandraika amin'ny aretina dia mitranga ao amin'ny faritra misy proteinina.
Ny BMKGENE dia manolotra serivisy fanaraha-maso exome manontolo ho an'ny olombelona feno sy malefaka miaraka amin'ny paikady fisamborana exon samihafa azo atao mba hahatratrarana tanjona fikarohana samihafa.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Fizarana sombintsombiny amplified-toerana manokana (SLAF-Seq)
Ny genotyping avo lenta, indrindra amin'ny mponina midadasika, dia dingana iray fototra amin'ny fandalinana ny fikambanan'ny génétique, izay manome fototra fototarazo ho an'ny fikarohana fototarazo miasa, fanadihadiana momba ny evolisiona, sns. ) dia nampidirina mba hanamaivanana ny vidin'ny filaharana isaky ny santionany, ary hitazonana ny fahombiazany amin'ny fahitana marika fototarazo.Mazàna no tratra izany amin'ny alalan'ny fakana ny sombintsombin'ny fameperana ao anatin'ny halehiben'ny habe nomena, izay antsoina hoe tranomboky famakafakana mihena (RRL).Ny sequencing fragment amplified specific-locus (SLAF-Seq) dia paikady novolavolain-tena ho an'ny genotyping SNP misy na tsy misy genome reference.
Platform: Illumina NovaSeq Platform -
Illumina sy BGI
Ny teknolojian'ny sequencing Illumina, mifototra amin'ny Sequencing by Synthesis (SBS), dia fanavaozana NGS eran'izao tontolo izao, tompon'andraikitra amin'ny famokarana mihoatra ny 90% amin'ny angon-drakitra momba ny filaharana manerantany.Ny foto-kevitry ny SBS dia ny fanaovana sary amin'ny terminator azo averina misy soratra fluorescently rehefa ampiana ny dNTP tsirairay, ary avy eo dia tapaka mba hamela ny fampidirana ny fototra manaraka.Miaraka amin'ireo dNTP mifamatotra amin'ny terminator efatra azo averina amin'ny tsingerin'ny sequence tsirairay, ny fifaninanana voajanahary dia manamaivana ny fitongilanana fampidirana.Ity teknôlôjia isan-karazany ity dia manohana ny tranomboky mamaky tokan-tena sy mifanandrify amin'ny farany, mamahana karazana fampiharana génomika.Ny fahaizan'ny Illumina sequencing dia mametraka azy io ho vato fehizoro amin'ny fikarohana génomika, manome hery ny mpahay siansa hamaha ny hasarotry ny fototarazo miaraka amin'ny antsipiriany sy ny fahombiazany tsy manam-paharoa.
DNBSEQ, novolavolain'ny BGI, dia teknolojia NGS vaovao iray hafa izay nahavita nampihena bebe kokoa ny vidin'ny filaharana ary nampitombo ny famokarana.Ny fanomanana ny trano famakiam-boky DNBSEQ dia misy ny fizarazaran'ny ADN, ny fanomanana ny ssDNA ary ny fanamafisana ny faribolana mihodinkodina hahazoana ny ADN nanoballs (DNB).Avy eo dia ampidirina eo amin'ny toerana mivaingana izy ireo ary avy eo atambatra amin'ny alàlan'ny combinatorial Probe-Anchor Synthesis (cPAS).
Ny serivisy famakiam-boky efa vita mialoha dia manamora ny mpanjifa amin'ny fanomanana ny fitehirizam-bokin'izy ireo avy amin'ny loharano samihafa (mRNA, genome manontolo, amplicon, sns).Aorian'izay, ireo tranomboky ireo dia azo alefa any amin'ny foibe filaharana ho an'ny fanaraha-maso ny kalitao sy ny filaharana amin'ny sehatra Illumina na BGI.
