-
Metagenomic Sequencing -NGS
Ny metagenome dia manondro ny fitambaran'ny akora fototarazo amin'ny vondrom-piarahamonina mifangaro zavamananaina, toy ny metagôneôma ara-tontolo iainana, ny metagôneôma olombelona, sns. Izy io dia misy fototarazon'ny zavamiaina bitika azo ambolena sy tsy azo ambolena.Ny filaharana metagenomika dia fitaovana molekiola ampiasaina hamakafaka ireo akora génomika mifangaro nalaina avy amin'ny santionany momba ny tontolo iainana, izay manome fampahalalana amin'ny antsipiriany momba ny fahasamihafan'ny karazana sy ny habetsahana, ny firafitry ny mponina, ny fifandraisan'ny phylogenetika, ny fototarazo miasa ary ny tambajotra mifandray amin'ny anton-javatra ara-tontolo iainana.
Platform:Illumina NovaSeq Platform
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics dia fitaovana molekiola ampiasaina handinihana ireo akora génomika mifangaro nalaina avy amin'ny santionany momba ny tontolo iainana, izay manome fampahalalana amin'ny antsipiriany momba ny fahasamihafan'ny karazana sy ny habetsahana, ny firafitry ny mponina, ny fifandraisan'ny phylogenetic, ny fototarazo miasa ary ny tamba-jotra mifandraika amin'ny anton-tontolo iainana, sns. Nanopore sequencing platforms amin'ny fandalinana metagenomika.Ny fahombiazany miavaka amin'ny halavan'ny famakiana dia nanatsara ny famakafakana metagenomika midina, indrindra fa ny fivorian'ny metagenome.Manararaotra ny halavan'ny famakiana, ny fandalinana metagenomika miorina amin'ny Nanopore dia afaka manatontosa fivoriambe mitohy kokoa raha ampitahaina amin'ny metagenomika basy voatifitra.Navoaka fa ny metagenomika mifototra amin'ny Nanopore dia nahomby tamin'ny famoronana génome bakteria feno sy mihidy avy amin'ny microbiome (Moss, EL, et. al,Nature Biotech, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Ny subunit amin'ny 16S sy 18S rRNA izay misy faritra tena voatahiry sy hypervariable dia dian-tànana molekiola tonga lafatra ho an'ny famantarana ny zavamananaina prokaryotic sy eukaryotic.Manararaotra ny filaharana, ireo amplicons ireo dia azo lasibatra mifototra amin'ny ampahany voatahiry ary ny faritra hyper-variable dia azo faritana tanteraka ho an'ny famantarana mikraoba mandray anjara amin'ny fandalinana momba ny famakafakana ny fahasamihafana mikraoba, taxonomy, phylogeny, sns. ) ny filaharana amin'ny sehatra PacBio dia ahafahana mahazo vakiteny lava tena marina, izay mety handrakotra amplicons lava lava (eo ho eo amin'ny 1.5 Kb).Ny fomba fijery mivelatra amin'ny sehatry ny fototarazo dia nanatsara ny famahana ny famaritana ny karazana ao amin'ny vondrom-piarahamonina bakteria na holatra.
Platform:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Ny 16S/18S/ITS amplicon sequencing dia mikendry ny hanambara ny phylogeny, taxonomy ary karazana karazana ao amin'ny vondrom-piarahamonina mikraoba amin'ny alalan'ny fanadihadiana ny vokatra PCR amin'ny mari-pamantarana fototarazo fitahirizana trano izay misy ampahany be resaka sy hypervariable.Ny fampidirana ireo dian-tanana molekiola tonga lafatra nataon'i Woeses et al, (1977) dia manome hery ny fametahana microbiome tsy misy fitokana-monina.Ny filaharan'ny 16S (bakteria), 18S (holatra) ary ny spacer transcribed anatiny (ITS, holatra) dia ahafahana mamantatra ireo karazana be dia be ary ireo karazana tsy fahita firy sy tsy fantatra.Ity teknôlôjia ity dia lasa fitaovana ampiasaina betsaka sy lehibe amin'ny famantarana ny firafitry ny mikraoba samihafa amin'ny tontolo isan-karazany, toy ny vavan'ny olombelona, ny tsinainy, ny diky, sns.
Platform:Illumina NovaSeq Platform
-
Famerenana ny Genome manontolo amin'ny bakteria sy holatra
Ny famerimberenan'ny génome manontolo ny bakteria sy ny holatra dia fitaovana tena ilaina hamenoana ny fototarazon'ny bakteria sy holatra fantatra, ary koa ny fampitahana ireo fototarazo marobe na ny fanaovana sari-tany ny fototarazon'ny zavamananaina vaovao.Zava-dehibe tokoa ny filaharan'ny génome manontolon'ny bakteria sy ny holatra mba hamokarana génome reference marina, hanaovana famantarana ny mikraoba sy fandalinana génome fampitahana hafa.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Metatranscriptome Sequencing
Ny filaharan'ny metatranscriptome dia manondro ny firafitry ny mikraoba (na eukaryotes na prokaryotes) ao anatin'ny tontolo voajanahary (izany hoe tany, rano, ranomasina, diky, ary tsinay.). ny karazana, ny famakafakana fampitomboana asa ny fototarazo tsy mitovy, sy ny maro hafa.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Genome holatra
Ny Biomarker Technologies dia manome fanadihadiana momba ny génome, génome tsara ary génome feno holatra miankina amin'ny tanjona fikarohana manokana.Ny filaharan'ny genome, ny fivoriam-be ary ny fanamafisam-peo azo ampiasaina dia azo atao amin'ny fampifangaroana ny filaharan'ny taranaka manaraka + ny filaharana amin'ny taranaka fahatelo mba hahatratrarana ny fivorian'ny genome avo lenta.Ny teknôlôjia Hi-C dia azo ampiasaina ihany koa mba hanamorana ny fivorian'ny génome amin'ny haavon'ny chromosome.
Platform:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq Platform
-
Genome feno bakteria
Ny Biomarker Technologies dia manome serivisy filaharana amin'ny fananganana fototarazo feno bakteria miaraka amin'ny elanelana aotra.Ny fizotry ny fiasan'ny bakteria feno ny fananganana génétique dia ahitana ny filaharana taranaka fahatelo, ny fivoriambe, ny fanoritsoritana fiasa ary ny famakafakana bioinformatic mandroso manatanteraka tanjona fikarohana manokana.Ny famaritana feno kokoa momba ny génome bakteria dia manome hery ny fampiharihariana ny mekanika fototra mifototra amin'ny fizotry ny biôlôjia, izay mety hanome fanondro manan-danja ho an'ny fikarohana génomika amin'ny karazana eukaryotic ambony.
Platform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
