-
PacBio-Full-length 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Ny sehatra Amplicon (16S/18S/ITS) dia novolavolaina tamin'ny traikefa an-taonany tamin'ny famakafakana tetikasa isan-karazany mikraoba, izay misy famakafakana fototra manara-penitra sy famakafakana manokana: ny famakafakana fototra dia mandrakotra ny votoatin'ny famakafakana mahazatra amin'ny fikarohana mikraoba ankehitriny, ny votoatin'ny fanadihadiana dia manankarena sy feno, ary ny valin'ny fanadihadiana dia aseho amin'ny endrika tatitra momba ny tetikasa;Ny votoatin'ny famakafakana manokana dia isan-karazany.Santionany dia azo voafantina sy masontsivana azo apetraka flexibly araka ny fanadihadiana fototra tatitra sy ny fikarohana tanjona, mba hahatakatra ny fepetra manokana.Windows rafitra fandidiana, tsotra sy haingana.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (Tsy misy Reference)
Mandray ny angon-drakitra fisehon'ny Pacific Biosciences (PacBio) Isoform ho fampidirana, ity App ity dia afaka hamantatra ny filaharan'ny transcript feno (tsy misy fivoriambe).Amin'ny alàlan'ny fanaovana sarintany ny filaharana feno amin'ny fototarazo reference, ny transcript dia azo amboarina amin'ny alàlan'ny fototarazo fantatra, transcript, faritra fanodinana, sns. Amin'ity tranga ity, azo atao ny mamantatra tsara kokoa ny rafitry ny mRNA, toy ny fifandimbiasana hafa, sns.Ny famakafakana iraisana miaraka amin'ny angon-drakitra fizotry ny transcriptome NGS dia ahafahan'ny fanamarihana feno kokoa sy ny fanombanana marina kokoa amin'ny fitenenana amin'ny ambaratonga transcript, izay mahasoa indrindra amin'ny fanehoan-kevitra sy ny famakafakana asa.
-
fitaovam
Ny BMKCloud dia sehatra bioinformatic malaza manome vahaolana tokana ho an'ny programa génomika, izay atokisan'ny mpikaroka amin'ny sehatra isan-karazany ao anatin'izany ny fitsaboana, ny fambolena, ny tontolo iainana, sns. , loharanon-karena informatika, angon-drakitra ho an'ny daholobe, fampianarana an-tserasera bioinformtic, sns. Ny BMKCloud dia manana fitaovana bioinformatika isan-karazany ampiasaina matetika amin'ny fanamarihan'ny fototarazo, fitaovana fototarazo evolisiona, ncRNA, fanaraha-maso ny kalitaon'ny data, fivoriambe, fampifanarahana, fitrandrahana data, fiovan'ny statistika, mpamorona tarehimarika, filaharana famakafakana, sns.
-
RNA kely
Ny RNA kely dia karazana RNA tsy misy kaody fohy miaraka amin'ny salan'isa 18-30 nt, anisan'izany ny miRNA, siRNA ary piRNA.Ireo RNA kely ireo dia voalaza fa tafiditra ao anatin'ny dingana biolojika isan-karazany toy ny fahasimban'ny mRNA, ny fandikana ny fandikana, ny fananganana heterochromatin, sns. sehatra famakafakana sequencing dia ahitana ny fanadihadiana manara-penitra sy ny fitrandrahana data mandroso.Amin'ny fototry ny angon-drakitra RNA-seq, ny famakafakana mahazatra dia afaka mahatratra ny famantarana sy ny faminaniana miRNA, ny faminavinan'ny fototarazo kendrena miRNA, ny fanamarihana ary ny famakafakana fanehoana.Ny famakafakana mandroso dia mamela ny fikarohana sy ny fitrandrahana miRNA namboarina, ny famoronana diagrama Venn, ny miRNA ary ny fananganana tamba-jotra kendrena.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS dia sehatra famakafakana famerenan'ny genome manontolo, izay novolavolaina tamin'ny traikefa manankarena amin'ny Biomarker Technologies.Ity sehatra mora ampiasaina ity dia mamela ny fandefasana haingana ny workflow famakafakana mitambatra amin'ny alàlan'ny fametrahana mari-pamantarana fototra vitsivitsy, izay mifanaraka amin'ny angon-drakitra momba ny filaharana ADN navoaka avy amin'ny sehatra Illumina sy ny sehatra filaharana BGI.Ity sehatra ity dia apetraka amin'ny mpizara informatika avo lenta, izay manome hery ny famakafakana angon-drakitra tena mahomby ao anatin'ny fotoana voafetra.Ny fitrandrahana angon-drakitra manokana dia azo alaina amin'ny alàlan'ny famakafakana mahazatra, ao anatin'izany ny fangatahana fototarazo mutated, famolavolana PCR primer, sns.
-
mRNA(Reference)
Ny Transcriptome dia ny fifandraisan'ny fampahalalana momba ny génomika sy ny proteome amin'ny fiasa biolojika.Ny fandrindrana ny haavon'ny transcriptional no fomba fandrindrana ny zavamananaina manan-danja indrindra sy be mpitia indrindra.Ny filaharan'ny transcriptome dia afaka mandrindra ny transcriptome amin'ny fotoana rehetra na amin'ny toe-javatra rehetra, miaraka amin'ny vahaolana marina amin'ny nucleotide tokana. santionany fandikana manokana.
Amin'izao fotoana izao, ny teknolojia sequencing transcriptome dia nampiasaina betsaka amin'ny agronomie, fitsaboana ary sehatra fikarohana hafa, ao anatin'izany ny fandrindrana ny fivoaran'ny biby sy ny zavamaniry, ny fampifanarahana ny tontolo iainana, ny fifandraisana amin'ny hery fiarovana, ny toerana misy ny fototarazo, ny fivoaran'ny fototarazo sy ny fivontosana ary ny fitsirihana ny aretina.
-
Metagenomics (NGS)
Ity sehatra famakafakana ity dia natao ho an'ny famakafakana angon-drakitra metagenomika amin'ny alàlan'ny traikefa an-taonany maro.Izy io dia ahitana workflow mitambatra ahitana famakafakana metagenomika isan-karazany ilaina indrindra ao anatin'izany ny fanodinana angon-drakitra, ny fandalinana ambaratonga karazana, ny fianarana ambaratongan'ny fototarazo, ny metagenome binning, sns. , fametrahana paramètre, famoronana tarehimarika manokana, sns.
-
LncRNA
Ny RNA tsy misy kaody lava (lncRNA) dia karazana transcript manana halavany mihoatra ny 200 nt, izay tsy afaka mandika proteinina.Ny porofo miangona dia milaza fa ny ankamaroan'ny lncRNAs dia tena azo ampiasaina.Ny teknolojian'ny sequence avo lenta sy ny fitaovana famakafakana bioinformatic dia manome hery antsika hanambara ny filaharan'ny lncRNA sy ny fampahafantarana toerana amin'ny fomba mahomby kokoa ary mitarika antsika hahita lncRNAs manana andraikitra manan-danja amin'ny fanaraha-maso.Ny BMKCloud dia mirehareha amin'ny fanomezana ny mpanjifanay lncRNA sequencing sequence platform mba hahatratrarana haingana, azo itokisana ary azo itokisana ny famakafakana lncRNA.
-
GWAS
Ny fandalinana ny fikambanan'ny genome-wide (GWAS) dia mikendry ny hamantatra ireo karazana fototarazo (genotype) izay mifandray amin'ny toetra manokana (phenotype).Ny fandalinana GWA dia manadihady ireo marika fototarazo mamakivaky ny génomie iray manontolo amin'ny olona marobe ary maminavina ny fikambanan'ny genotype-phenotype amin'ny alàlan'ny famakafakana statistika amin'ny haavon'ny mponina.Ny resequencing génome manontolo dia mety hahita ny variana fototarazo rehetra.Miaraka amin'ny angon-drakitra phenotypic, ny GWAS dia azo karakaraina mba hamantarana ireo SNP mifandraika amin'ny phenotype, QTL ary fototarazo kandida, izay manohana mafy ny fiompiana biby / zavamaniry maoderina.Ny SLAF dia paikady fandrindrana génome novolavolain'ny tena manokana, izay mahita marika miparitaka manerana ny genome, SNP.Ireo SNP ireo, amin'ny maha-marika fototarazo molekiola, dia azo karakaraina ho an'ny fianarana fikambanana miaraka amin'ny toetra kendrena.Paikady lafo vidy amin'ny famantarana ireo toetra sarotra mifandray amin'ny fiovaovan'ny fototarazo.
-
Nanopore transcriptomika feno
Ny isoforme saro-pady sy miovaova amin'ny zavamananaina dia mekanika fototarazo manan-danja amin'ny fifehezana ny fanehoana ny fototarazo sy ny fahasamihafan'ny proteinina.Ny famantarana marina ny firafitry ny transcript no fototry ny fandalinana lalina ny lamina mifehy ny fanehoana ny fototarazo.Ny sehatra sequencing Nanopore dia nahomby tamin'ny fandalinana transcriptomic ho amin'ny isoform-level.Ity sehatra famakafakana ity dia natao hamakafaka ny angon-drakitra RNA-Seq vokarina amin'ny sehatra Nanopore amin'ny fototry ny génome reference, izay mahatratra ny famakafakana qualitative sy quantitative amin'ny haavon'ny fototarazo sy ny transcripts.
-
circ-RNA
Circular RNA (circRNA) dia karazana RNA tsy misy kaody, izay hita vao haingana fa mitana anjara toerana lehibe amin'ny tambajotra mifehy ny fampandrosoana, ny fanoherana ny tontolo iainana, sns. Ny faran'ny circRNA dia mifamatotra mba hamorona rafitra boribory, izay mamonjy azy ireo amin'ny fandevonan-kanina exonuclease ary miorina kokoa noho ny ankamaroan'ny ARN linear.Ny CircRNA dia hita fa manana asa isan-karazany amin'ny fifehezana ny fanehoana ny fototarazo.Ny CircRNA dia afaka manao toy ny ceRNA, izay mamatotra ny miRNA amin'ny fifaninanana, fantatra amin'ny anarana hoe sponjy miRNA.Ny sehatra famakafakana sequencing CircRNA dia manome hery ny firafitry ny circRNA sy ny famakafakana fanehoana, ny vinavinan'ny kendrena ary ny famakafakana iombonana amin'ny karazana molekiola RNA hafa
-
BSA
Ny sehatra Famakafakana Segregant Bulked dia misy famakafakana manara-penitra iray dingana sy famakafakana mandroso miaraka amin'ny fametrahana paramètre namboarina.BSA dia teknika ampiasaina hamantarana haingana ireo marika fototarazo mifandraika amin'ny phenotype.Ny fizotran'ny asa lehibe ao amin'ny BSA dia ahitana: 1. fifantenana vondron'olona roa miaraka amin'ny phenotypes tena mifanohitra;2. fampivondronana ny ADN, RNA na SLAF-seq (Novolavolain'ny Biomarker) an'ny tsirairay mba hamoronana ADN roa;3. Famantarana ny filaharana tsy mitovy amin'ny génome reference na eo anelanelany, 4. maminavina ny faritra mifandray amin'ny kandidà amin'ny alàlan'ny algorithm ED sy SNP-index;5. Famakafakana sy fanatsarana ny fototarazo ao amin'ny faritra mpilatsaka hofidina, sns. Misy koa ny fitrandrahana harena an-kibon'ny tany mandroso kokoa ao anatin'izany ny fitiliana ny marika génétique sy ny famolavolana primer.
