-
Metagenomic Sequencing (NGS)
Ny metagenome dia manondro ny fitambarana akora fototarazo manontolo amin'ny vondrom-piarahamonina mifangaro zavamananaina, toy ny metagôneôma ara-tontolo iainana, ny metagônôma olombelona, sns. Izy io dia misy fototarazon'ny zavamiaina bitika azo ambolena sy tsy azo ambolena.Ny filaharana metagenomika dia fitaovana molekiola ampiasaina hamakafaka ireo akora génomika mifangaro nalaina avy amin'ny santionany momba ny tontolo iainana, izay manome fampahalalana amin'ny antsipiriany momba ny fahasamihafan'ny karazana sy ny habetsahana, ny firafitry ny mponina, ny fifandraisan'ny phylogenetic, ny fototarazo miasa ary ny tambajotra mifandray amin'ny anton-javatra ara-tontolo iainana.
Platform:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics dia fitaovana molekiola ampiasaina hamakafaka ireo akora génomika mifangaro nalaina avy amin'ny santionany momba ny tontolo iainana, izay manome fampahalalana amin'ny antsipiriany momba ny fahasamihafan'ny karazana sy ny habetsahana, ny firafitry ny mponina, ny fifandraisan'ny phylogenetic, ny fototarazo miasa ary ny tamba-jotra mifandraika amin'ny tontolo iainana, sns. Nanopore sequencing platforms dia nampiditra vao haingana amin'ny fandalinana metagenomic.Ny fahombiazany miavaka amin'ny halavan'ny famakiana dia nanatsara ny famakafakana metagenomika midina, indrindra fa ny fivorian'ny metagenome.Manararaotra ny halavan'ny famakiana, ny fandalinana metagenomika mifototra amin'ny Nanopore dia afaka manatontosa fivoriambe mitohy kokoa raha ampitahaina amin'ny metagenomika voatifitra.Navoaka fa ny metagenomika mifototra amin'ny Nanopore dia nahomby tamin'ny famoronana fototarazo bakteria feno sy mihidy avy amin'ny microbiome (Moss, EL, et. al,Nature Biotech, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Ny subunit amin'ny 16S sy 18S rRNA izay misy faritra tena voatahiry sy hyper-variable dia fanondro molekiola tonga lafatra ho an'ny famantarana ny zavamananaina prokaryotic sy eukaryotic.Manararaotra ny filaharana, ireo amplicons ireo dia azo lasibatra mifototra amin'ny ampahany voatahiry ary ny faritra hyper-variable dia azo faritana tanteraka ho an'ny famantarana mikraoba mandray anjara amin'ny fandalinana momba ny fanadihadiana momba ny fahasamihafana mikraoba, taxonomy, phylogeny, sns. ) ny filaharana amin'ny sehatra PacBio dia ahafahana mahazo famakiana lava be marina, izay mety handrakotra amplicons lava lava (eo ho eo amin'ny 1.5 Kb).Ny fomba fijery mivelatra amin'ny sehatry ny fototarazo dia nanatsara ny famahana ny famaritana ny karazana ao amin'ny vondrom-piarahamonina bakteria na holatra.
Platform:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Ny 16S/18S/ITS amplicon sequencing dia mikendry ny hanehoana ny phylogeny, taxonomy ary ny karazana karazana ao amin'ny vondrom-piarahamonina mikraoba amin'ny alalan'ny fanadihadiana ny vokatra PCR amin'ny marika fototarazo fitahirizana trano izay misy ampahany be resaka sy hypervariable.Ny fampidirana ireo dian-tanana molekiola tonga lafatra nataon'i Woeses et al, (1977) dia manome hery ny fametahana microbiome tsy misy fitokana-monina.Ny filaharan'ny 16S (bakteria), 18S (holatra) ary ny spacer transcribed anatiny (ITS, holatra) dia ahafahana mamantatra ireo karazana be dia be ary ireo karazana tsy fahita firy sy tsy fantatra.Ity teknolojia ity dia lasa fitaovana ampiasaina betsaka sy lehibe amin'ny famantarana ny firafitry ny mikraoba samihafa amin'ny tontolo isan-karazany, toy ny vavan'ny olombelona, ny tsinainy, ny diky, sns.
Platform:Illumina NovaSeq6000
-
Famerenana ny Genome manontolo bakteria sy holatra
Ny famerimberenan'ny génome manontolo ny bakteria sy ny holatra dia fitaovana tena ilaina hamenoana ny fototarazon'ny bakteria sy holatra fantatra, ary koa ny fampitahana ireo fototarazo maromaro na ny fanaovana sari-tany ny fototarazon'ny zavamananaina vaovao.Tena zava-dehibe ny filaharan'ny génome manontolon'ny bakteria sy holatra mba hamokarana génome reference marina, hanaovana famantarana mikraoba sy fandalinana génome fampitahana hafa.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Genome holatra
Ny Biomarker Technologies dia manome fanadihadiana momba ny génome, génome tsara ary génome feno holatra miankina amin'ny tanjona fikarohana manokana.Ny filaharan'ny genome, ny fivoriam-be ary ny fanamarihan'ny asa dia azo atao amin'ny fampifangaroana ny filaharan'ny taranaka manaraka + ny filaharana amin'ny taranaka fahatelo mba hahatratrarana ny fivorian'ny genome avo lenta.Ny teknôlôjia Hi-C dia azo ampiasaina ihany koa mba hanamora ny fivorian'ny génome amin'ny haavon'ny chromosome.
Platform:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Genome feno bakteria
Ny Biomarker Technologies dia manome serivisy filaharana amin'ny fananganana fototarazo feno bakteria miaraka amin'ny elanelana aotra.Ny fizotry ny fiasan'ny bakteria feno ny fananganana génome dia ahitana ny filaharana taranaka fahatelo, ny fivoriambe, ny fanoritsoritana fiasa ary ny famakafakana bioinformatic mandroso manatanteraka tanjona fikarohana manokana.Ny famaritana feno kokoa momba ny génome bakteria dia manome hery ny fanehoana ny mekanika fototra ao ambadiky ny fizotry ny biôlôjia, izay mety hanome fanondro manan-danja ho an'ny fikarohana génomika amin'ny karazana eukaryotic ambony.
Platform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
