● Faritra Fandrafetana Proteine Kendrena: amin'ny alalan'ny fisamborana sy fandrafetana ny faritra fandrafetana proteinina, ny hWES dia ampiasaina hanehoana ireo variana mifandraika amin'ny firafitry ny proteinina;
● High Accuracy: miaraka amin'ny halalin'ny filaharana avo lenta, ny hWES dia manamora ny fahitana ireo variana mahazatra sy ireo variana tsy fahita firy miaraka amin'ny frequences ambany noho ny 1%;
● Sarobidy: ny hWES dia mamokatra 85% eo ho eo amin'ny fiovan'ny aretin'olombelona avy amin'ny 1%-n'ny fototarazo;
● Fitsipika QC dimy henjana mandrakotra ny dingana manontolo miaraka amin'ny Q30> 85% azo antoka.
Platform
| -BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah
| Exon Capture Strategy
| Soso-kevitra ny Paikady Sequencing
|
Illumina NovaSeq Platform
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Karazana santionany
| vola(Qubit®)
| BOKY FAHA-
| fifantohana
| Purity(NanoDrop™) |
ADN génomika
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1.8-2.0 tsy misy fahasimbana, tsy misy loto
|
Ho an'ny aretina Mendelian / aretina tsy fahita firy: ny halalin'ny filaharana mahomby mihoatra ny 50 ×
Ho an'ny santionan'ny fivontosana: ny halalin'ny filaharana mahomby mihoatra ny 100×
1. Statistika fampifanarahana
Tabilao 1 Statistikan'ny valin'ny sari-tany
Tabilao 2 Statistikan'ny fisamborana exome
2. Fikarohana Variation
Sary 1 Statistikan'ny SNV sy InDel
3. Famakafakana mandroso
Figure 2 Circos plot of Genome-wide manimba SNV sy InDel
Tabilao 3 Fandinihana ny fototarazo miteraka aretina