Products

ADN/RNA Sequencing - Illumina Sequencer

Illumina sequencing technology, sequencing by synthesis (SBS), dia teknolojia manaraka ny taranaka manaraka (NGS) maneran-tany, tompon'andraikitra amin'ny famokarana mihoatra ny 90% amin'ny angon-drakitra momba ny filaharana manerantany.Ny terminator azo averina misy marika fluorescently dia alaina sary rehefa ampiana ny dNTP tsirairay, ary avy eo dia tapaka mba ahafahana mampiditra ny fototra manaraka.Koa satria ny dNTPs 4 azo averina mifamatotra amin'ny terminator dia misy mandritra ny tsingerin'ny sequence tsirairay, ny fifaninanana voajanahary dia manamaivana ny fitongilanana fampidirana.Ny fomba dia manafoana ny fahadisoana sy ny antso tsy hita mifandray amin'ny tadin'ny nucleotides miverimberina (homopolymers).Ny fizotry ny Illumina amin'ny alàlan'ny teknolojia synthesis dia manohana ny tranomboky mamaky tokan-tena sy mifamatotra.Ny haitao SBS dia manolotra fahafaha-miditra fohy miaraka amin'ny farany ho an'ny filaharan'ny génomika avo lenta, ary koa ny famakiana lava miaraka amin'ny farany ho an'ny fivorian'ny filaharana mahomby, ny filaharana de novo, sy ny maro hafa.Ny fampifangaroana ny fampidirana fohy sy ny famakiana lava kokoa dia mampitombo ny fahafahana manavaka tanteraka ny génome rehetra.

Mifandraisa aminay

Service Details

Vokatra Demo

Service Details Features

Platform

Sequencing Mode

Applications

Illumina Nova system

SE50

PE50

PE150

PE250

1. Afangaro haingana ny génome manontolo

2. Zoom in ho any amin'ny filaharana lalina faritra kendrena

3. Mampiasà filaharan'ny RNA (RNA-Seq) hahitana ireo variana RNA vaovao sy toerana misy splice, na hamantatra ny mRNA amin'ny famakafakana ny fanehoana ny fototarazo.

4. Famakafakana ireo anton-javatra epigenetika toy ny methylation ADN sy ny fifandraisan'ny ADN-proteinina.

5. Manaova santionan'ny homamiadana mba handinihana ny variana somatic tsy fahita firy, subclones tumor, ary bebe kokoa Halalino ny fahasamihafana mikraoba ao amin'ny olombelona na eo amin'ny tontolo

Tombontsoa amin'ny serivisy

● traikefa be dia be amin'ny sehatra filaharana Illumina miaraka amin'ny tetikasa mikatona an'arivony miaraka amin'ny karazana isan-karazany.
● Dingan'ny filaharana matotra miaraka amin'ny fotoana fohy fihodinana.
● Serivisy famakafakana momba ny bioinformatika any ambany.
● Rafitra fanaraha-maso kalitao henjana: fenitra QC hentitra momba ny angon-drakitra.

Santionany takiana*

Sequence platform & Strategy sequencing	Haben'ny data	fifantohana (Thermo Life Qubit 3.0)	BOKY FAHA-	vola	Vokatra QC
Novaseq system, 150bp miaraka amin'ny farany	X≤30Gb	≥1ng/μl	≥20 μl	≥20ng	mahay
	30Gb < X≤100Gb	≥1ng/μl	≥25 μl	≥30ng
	X>100Gb	≥2ng/μl	≥25 μl	≥50ng

Fanamarihana:

Ho fanampin'ny fifantohana sy ny totalin'ny vola, dia ilaina ihany koa ny lamina tampony mety.

Lalana tokana (Illumina)

Platform	fifantohana (qPCR nM)	BOKY FAHA-	Vokatra QC
HiseqXten	≥2.5nM	≥20μL	mahay
NovaSeq 6000 S4	≥2nM	≥30μL
NovaSeg 6000 SP	≥2nM	≥30μL

Azafady mba mifandraisa aminay raha tsy mahafeno ny fepetra takiana amin'ny fitaovana fanombohana ny santionany.

Mifandraisa aminay

Service Workflow

Fanaraha-maso ny kalitaon'ny tranomboky

Sequencing

Fanaraha-maso ny kalitaon'ny data

Fanaterana tetikasa

teo aloha: ADN/RNA filaharana -PacBio Sequencer

Manaraka: ADN/RNA Sequencing - Nanopore Sequencer

Fanombanana ny kalitaon'ny angona momba ny santionan'ny RNA

Tabilao 1. Statistika momba ny angona manaraka.

ID santionany	BMKID	Raw mamaky	Data manta (bp)	Mamaky madio (%)	Q20(%)	Q30(%)	GC(%)
C_01	BMK_01	22,870,120	6.861.036.000	96.48	99.14	94.85	36.67
C_02	BMK_02	14,717,867	4,415,360,100	96.00	98.95	93.89	37.08