Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
Tombontsoa amin'ny serivisy
● Platform: Illumina NovaSeq Platform, PE150
● Karazana tranomboky: 100-500bp ampidiro ny tranomboky ADN (miankina amin'ny fizarana faratampony)
● Paikady filaharana: 150 bp miaraka amin'ny farany
● Manoro hevitra ny famoahana angona: 6 Gb manta data/santionany.
Fepetra takiana
Habetsan'ny ADN: ≥ 70 ng, faratampony lehibe amin'ny 100 hatramin'ny 500 bp
Santionany boky: ≥ 10 μl
OD260/280 = 1.8 hatramin'ny 2.0 tsy misy fahasimbana na fandotoana ARN
Fomba fiasa andrana
Fizotry ny asa fanompoana
Fanaterana santionany
Fananganana tranomboky
Sequencing
Famakafakana angona
Serivisy aorian'ny varotra
1. Fitsinjaram-pahefana ambony indrindra
2. MA plot amin'ny tampon'isa differential
3.Fanamarihan'ny orinasa KEGG
4. Fanasokajiana GO
mahazo teny nalaina
Soraty eto ny hafatrao ary alefaso aminay
