● Paikady filaharana maromaro azo ampiasaina ho an'ny tanjona fikarohana samihafa
● Genome feno bakteria miaraka amin'ny Gap 0 antoka.
● Tena za-draharaha amin'ny fivorian'ny génome bakteria miaraka amin'ny génome feno 10.000 mahery mitambatra.
● Ekipa mpanohana ara-teknika matihanina aorian'ny varotra manatanteraka filàna fikarohana manokana kokoa.
Sequencingtetika | -BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah | Miantoka ny kalitao | Tombanana ny fotoana fihodinana |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Gap | 30 andro |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● Fanaraha-maso ny kalitaon'ny angona manta
● Fivoriambe genome
● Famakafakana singa génome
● Famaritana momba ny asan'ny fototarazo
● Famakafakana génomika fampitahana
HO AN'NYADN nalaina:
Karazana santionany | vola | fifantohana | fahadiovana |
ADN nalaina | > 2 g ny | > 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Ho an'ny santionan'ny tissue:
Karazana santionany | Fitsaboana santionany soso-kevitra | Santionany fitahirizana sy fandefasana |
Bakteria | Diniho ny bakteria eo ambanin'ny mikraoskaopy ary manangona bakteria ao amin'ny dingan'ny fitomboany Alefaso ny kolontsaina bakteria (misy sela 3-4.5e9 eo ho eo) ao anaty eppendorf 1.5 na 2 ml.(Mitohy amin'ny gilasy) Atsofohy ny fantsona mandritra ny 1 minitra amin'ny 14000 g mba hanangonana bakteria sy hanala tsara ny supernatant Asio tombo-kase ny fantsona ary atsofohy ao anaty nitrogen ranon-javatra mandritra ny 30 minitra farafahakeliny ny bakteria.Tehirizo ao anaty vata fampangatsiahana -80 ℃ ny fantsona. | Afangaro ny santionany amin'ny azota ranoka mandritra ny 3-4 ora ary tehirizo ao anaty azota ranona na -80 degre ho famandrihana maharitra.Ilaina ny fandefasana santionany miaraka amin'ny gilasy maina. |
1.Circos genome bakteria
2. Faminanian'ny fototarazo kaody
3. Famakafakana génomika fampitahana: hazo filogenetika