Mazā RNS sekvencēšana-Illumina
Iespējas
● RNS izmēra izvēle pirms bibliotēkas sagatavošanas
● Bioinformātiskā analīze, kuras centrā ir miRNS prognozēšana un to mērķi
Pakalpojuma priekšrocības
●Visaptveroša bioinformātikas analīze:ļauj identificēt gan zināmās, gan jaunās miRNS, identificēt miRNS mērķus un atbilstošu funkcionālo anotāciju un bagātināšanu ar vairākām datu bāzēm (KEGG, GO)
●Stingra kvalitātes kontrole: mēs ieviešam galvenos kontroles punktus visos posmos, sākot no paraugu un bibliotēkas sagatavošanas līdz sekvencēšanai un bioinformātikai.Šī rūpīgā uzraudzība nodrošina nemainīgi augstas kvalitātes rezultātu piegādi.
●Pēcpārdošanas atbalsts: Mūsu saistības sniedzas tālāk par projekta pabeigšanu ar 3 mēnešu pēcpārdošanas servisa periodu.Šajā laikā mēs piedāvājam projekta pārraudzību, problēmu novēršanas palīdzību un jautājumu un atbilžu sesijas, lai risinātu visus ar rezultātiem saistītus vaicājumus.
●Plaša ekspertīze: ar panākumiem sekmīgi noslēdzot vairākus sRNS projektus, kas aptver vairāk nekā 100 sugas dažādās pētniecības jomās, mūsu komanda sniedz bagātīgu pieredzi katrā projektā.
Prasību paraugs un piegāde
| Bibliotēka | Platforma | Ieteicamie dati | Datu kvalitātes kontrole |
| Izmērs izvēlēts | Illumina SE50 | 10–20 miljoni nolasījumu | Q30≥85% |
Prasību paraugs:
Nukleotīdi:
| Konc. (ng/μl) | Daudzums (μg) | Tīrība | Integritāte |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Uz gēla parādīts ierobežots proteīnu vai DNS piesārņojums vai tā nav. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; ierobežots vai vispār nav bāzes līmeņa pacēluma |
● Augi:
Sakne, stublājs vai ziedlapa: 450 mg
Lapa vai sēklas: 300 mg
Augļi: 1,2 g
● Dzīvnieks:
Sirds vai zarnas: 450 mg
Iekšējie orgāni vai smadzenes: 240 mg
Muskuļi: 600 mg
Kauli, mati vai āda: 1,5 g
● Posmkāji:
Kukaiņi: 9g
Vēžveidīgie: 450 mg
● Pilnas asinis: 2 caurules
● Šūnas: 106 šūnas
● Serums un plazma:6 ml
Ieteicamā paraugu piegāde
Konteiners:
2 ml centrifūgas caurule (skārda folija nav ieteicama)
Marķējuma paraugs: grupa + atkārtojums, piemēram, A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Sūtījums:
1. Sausais ledus: paraugi jāiepako maisos un jāierok sausajā ledū.
2.RNAstable caurules: RNS paraugus var žāvēt RNS stabilizācijas mēģenē (piemēram, RNAstable®) un nosūtīt istabas temperatūrā.
Pakalpojuma darba plūsma
Eksperimenta dizains
Paraugu piegāde
RNS ekstrakcija
Bibliotēkas celtniecība
Secība
Datu analīze
Pēcpārdošanas pakalpojumi
Bioinformātika
MiRNS identifikācija: struktūra un dziļums
MiRNS diferenciālā izteiksme – hiearhiskā klasterizācija
Atšķirīgi izteiktu miRNS mērķa funkcionālā anotācija
Izpētiet pētniecības sasniegumus, ko veicina BMKGene sRNS sekvencēšanas pakalpojumi, izmantojot apkopotu publikāciju kolekciju.
Chen, H. et al.(2023) “Vīrusu infekcijas inhibē saponīnu biosintēzi un fotosintēzi Panax notoginseng”, Plant Physiology and Biochemistry, 203. lpp.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) "Augu FYVE domēnu saturošais proteīns FREE1 asociējas ar mikroprocesora komponentiem, lai apspiestu miRNS bioģenēzi", ziņo EMBO, 24 (1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) “MicroRNA Ame-Bantam-3p kontrolē kāpuru zīlīšu attīstību, mērķējot uz vairākiem epidermas augšanas faktoram līdzīgiem domēniem 8 gēnu (megf8) medus bitē, Apis mellifera”, International Journal of Molecular Sciences, 24(6), lpp. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Džans, M. et al.(2018) “Integrētā MiRNS un ar gaļas kvalitāti saistīto gēnu analīze atklāj, ka Gga-MiR-140-5p ietekmē intramuskulāru tauku nogulsnēšanos cāļos”, Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), 2421–2433 lpp.doi: 10.1159/000489649.
