-
BSA
Lielapjoma segregantās analīzes platforma sastāv no vienpakāpes standarta analīzes un uzlabotas analīzes ar pielāgotu parametru iestatījumu.BSA ir metode, ko izmanto, lai ātri identificētu ar fenotipu saistītos ģenētiskos marķierus.Galvenā BSA darbplūsma ietver: 1. divu indivīdu grupu atlasi ar izteikti pretējiem fenotipiem;2. visu indivīdu DNS, RNS vai SLAF-seq (izstrādāts ar Biomarķieri) apvienošana, lai izveidotu divas DNS masas;3. diferenciālo sekvenču identificēšana attiecībā pret atsauces genomu vai starp tām, 4. kandidātu saistīto reģionu prognozēšana ar ED un SNP indeksa algoritmu;5. Funkcionālā analīze un gēnu bagātināšana kandidātreģionos utt. Ir pieejama arī progresīvāka datu ieguve, tostarp ģenētisko marķieru skrīnings un primer dizains.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platforma ir izstrādāta ar daudzu gadu pieredzi mikrobu daudzveidības projektu analīzē, kas ietver standartizētu pamata analīzi un personalizētu analīzi: pamata analīze aptver pašreizējo mikrobu pētījumu galveno analīzes saturu, analīzes saturs ir bagātīgs un visaptverošs, un analīzes rezultāti tiek prezentēti projektu atskaišu veidā;Personalizētās analīzes saturs ir daudzveidīgs.Paraugus var atlasīt un parametrus var elastīgi iestatīt atbilstoši pamata analīzes ziņojumam un pētījuma mērķim, lai realizētu personalizētas prasības.Windows operētājsistēma, vienkārša un ātra.
-
Evolūcijas ģenētika
Evolucionārā ģenētika ir komplekss sekvencēšanas pakalpojums, kas paredzēts, lai sniegtu visaptverošu interpretāciju par doto materiālu evolūcijas informāciju, pamatojoties uz ģenētiskām variācijām, tostarp SNP, InDels, SV un CNV.Tas nodrošina visu fundamentālo analīzi, kas nepieciešama, lai aprakstītu evolucionārās izmaiņas un populāciju ģenētiskās iezīmes, piemēram, populācijas struktūru, ģenētisko daudzveidību, filoģenēzes attiecības utt. Tajā ir arī pētījumi par gēnu plūsmu, kas dod iespēju novērtēt efektīvo populācijas lielumu, novirzes laiku.
-
Salīdzinošā genomika
Salīdzinošā genomika burtiski nozīmē dažādu sugu visu genomu secību un struktūru salīdzināšanu.Šīs disciplīnas mērķis ir atklāt sugu evolūciju, gēnu funkcijas, gēnu regulēšanas mehānismu genoma līmenī, identificējot secību struktūras un elementus, kas saglabājās vai diferencējās dažādās sugās.Tipisks salīdzinošais genomikas pētījums ietver analīzi gēnu ģimenē, evolūcijas attīstību, visa genoma dublēšanos, selektīvo spiedienu utt.
-
Evolūcijas ģenētika
Populācijas un evolūcijas ģenētiskās analīzes platforma ir izveidota, pamatojoties uz BMK R&D komandā gadiem ilgi uzkrāto pieredzi.Tas ir lietotājam draudzīgs rīks, īpaši pētniekiem, kuri nav specializējušies bioinformātikā.Šī platforma nodrošina pamata evolūcijas ģenētiku pamata analīzi, tostarp filoģenētisko koku konstrukciju, saišu līdzsvara analīzi, ģenētiskās daudzveidības novērtējumu, selektīvo slaucīšanas analīzi, radniecības analīzi, PCA, populācijas struktūras analīzi utt.
-
Hi-C balstīta genoma montāža
Hi-C ir metode, kas paredzēta hromosomu konfigurācijas uztveršanai, apvienojot uz tuvumu balstītas mijiedarbības un augstas caurlaidspējas sekvencēšanu.Tiek uzskatīts, ka šīs mijiedarbības intensitāte ir negatīvi saistīta ar fizisko attālumu hromosomās.Tāpēc Hi-C dati varētu vadīt salikto secību klasterizāciju, kārtošanu un orientāciju genoma uzmetumā un noenkurot tās noteiktā skaitā hromosomu.Šī tehnoloģija nodrošina hromosomu līmeņa genoma komplektu, ja nav uz populāciju balstītas ģenētiskās kartes.Katram genomam ir nepieciešams Hi-C.
Platforma: Illumina NovaSeq platforma / DNBSEQ
-
Augu/dzīvnieku de Novo genoma sekvencēšana
De Novosekvencēšana attiecas uz sugas visa genoma konstruēšanu, izmantojot sekvencēšanas tehnoloģijas, piemēram, PacBio, Nanopore, NGS utt., ja nav atsauces genoma.Ievērojamais trešās paaudzes sekvencēšanas tehnoloģiju lasīšanas garuma uzlabojums ir radījis jaunas iespējas sarežģītu genomu komplektēšanā, piemēram, genomu ar augstu heterozigotiskumu, augstu atkārtojošos reģionu attiecību, poliploīdiem utt. Tā kā nolasīšanas garums ir desmitiem kilobāzu līmenī, šie sekvencēšanas nolasījumi ļauj atkārtotu elementu, reģionu ar neparastu GC saturu un citu ļoti sarežģītu reģionu atrisināšana.
Platforma: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq platforma
-
Visa cilvēka eksoma sekvencēšana
Visa eksoma sekvencēšana (WES) tiek uzskatīta par rentablu sekvencēšanas stratēģiju slimību izraisošo mutāciju identificēšanai.Lai gan eksoni aizņem tikai aptuveni 1, 7% no visa genoma, tie tieši atspoguļo kopējo olbaltumvielu funkciju profilu.Cilvēka genomā ir ziņots, ka vairāk nekā 85% ar slimību saistīto mutāciju notiek proteīnu kodēšanas reģionā.
BMKGENE piedāvā visaptverošus un elastīgus cilvēka visa eksoma sekvencēšanas pakalpojumus ar dažādām eksonu uztveršanas stratēģijām, kas pieejamas dažādu pētniecības mērķu sasniegšanai.
Platforma: Illumina NovaSeq platforma
-
Specifiska lokusa pastiprinātā fragmentu secība (SLAF-Seq)
Augstas caurlaidības genotipēšana, īpaši liela mēroga populācijā, ir būtisks solis ģenētisko asociāciju pētījumos, kas nodrošina ģenētisko pamatu funkcionālu gēnu atklāšanai, evolūcijas analīzei utt. Tā vietā, lai veiktu dziļu visa genoma atkārtotu sekvencēšanu, samazināta reprezentācijas genoma sekvencēšana (RRGS) ) tiek ieviests, lai samazinātu sekvencēšanas izmaksas vienam paraugam, vienlaikus saglabājot saprātīgu efektivitāti ģenētisko marķieru atklāšanā.To parasti panāk, ekstrahējot restrikcijas fragmentu noteiktā lieluma diapazonā, ko sauc par samazinātu reprezentācijas bibliotēku (RRL).Specifiska lokusa pastiprināta fragmentu sekvencēšana (SLAF-Seq) ir pašu izstrādāta stratēģija SNP genotipēšanai ar vai bez atsauces genoma.
Platforma: Illumina NovaSeq platforma -
Illumina un BGI
Illumina sekvencēšanas tehnoloģija, kuras pamatā ir Sequencing by Synthesis (SBS), ir globāli pieņemta NGS inovācija, kas ir atbildīga par vairāk nekā 90% pasaules sekvencēšanas datu.SBS princips ietver fluorescējoši marķētu atgriezenisko terminatoru attēlveidošanu, kad tiek pievienots katrs dNTP, un pēc tam tiek sadalīts, lai varētu iekļaut nākamo bāzi.Tā kā katrā sekvencēšanas ciklā ir visi četri atgriezeniski terminatora piesaistītie dNTP, dabiskā konkurence samazina iekļaušanas novirzi.Šī daudzpusīgā tehnoloģija atbalsta gan vienas lasīšanas, gan pāru bibliotēkas, nodrošinot virkni genoma lietojumu.Illumina sekvencēšanas augstas caurlaidspējas iespējas un precizitāte pozicionē to kā stūrakmeni genomikas pētniecībā, dodot zinātniekiem iespēju atklāt genomu sarežģījumus ar nepārspējamu detalizāciju un efektivitāti.
BGI izstrādātā DNBSEQ ir vēl viena novatoriska NGS tehnoloģija, kurai ir izdevies vēl vairāk samazināt secības izmaksas un palielināt caurlaidspēju.DNBSEQ bibliotēku sagatavošana ietver DNS fragmentāciju, ssDNS sagatavošanu un ritošā apļa amplifikāciju, lai iegūtu DNS nanobumbiņas (DNB).Pēc tam tos uzlādē uz cietas virsmas un pēc tam sekvencē ar kombinatorisko zondes-enkura sintēzi (cPAS).
Mūsu iepriekš sagatavotais bibliotēku sekvencēšanas pakalpojums atvieglo klientiem savu sekvencēšanas bibliotēku sagatavošanu no dažādiem avotiem (cita starpā mRNS, visa genoma, amplikona).Pēc tam šīs bibliotēkas var nosūtīt uz mūsu sekvencēšanas centriem kvalitātes kontrolei un secības noteikšanai Illumina vai BGI platformās.
