Telpiskā transkriptomika ir zinātnisko jauninājumu priekšgalā, dodot pētniekiem iespēju iedziļināties sarežģītos gēnu ekspresijas modeļos audos, vienlaikus saglabājot to telpisko kontekstu.Dažādās platformās uzņēmums BMKGene ir izstrādājis BMKManu S1000 telpisko transkripta mikroshēmu, kas lepojas aruzlabota izšķirtspēja5 µM, sasniedzot subcelulāro diapazonu un iespējojotdaudzlīmeņu izšķirtspējas iestatījumi.S1000 mikroshēmā, kurā ir aptuveni 2 miljoni plankumu, ir izmantotas mikroiedobes, kas slāņotas ar lodītēm, kas ir ielādētas ar telpiski svītrkodētām uztveršanas zondēm.cDNS bibliotēka, kas bagātināta ar telpiskajiem svītrkodiem, tiek sagatavota no S1000 mikroshēmas un pēc tam sekvencēta Illumina NovaSeq platformā.Telpiski svītrkodu paraugu un UMI kombinācija nodrošina ģenerēto datu precizitāti un specifiku.BMKManu S1000 mikroshēmas unikālais atribūts slēpjas tās daudzpusībā, piedāvājot daudzlīmeņu izšķirtspējas iestatījumus, kurus var precīzi pielāgot dažādiem audiem un detalizācijas līmeņiem.Šī pielāgošanās spēja pozicionē mikroshēmu kā izcilu izvēli dažādiem telpiskās transkriptomikas pētījumiem, nodrošinot precīzu telpisku klasterizāciju ar minimālu troksni.
Izmantojot BMKManu S1000 mikroshēmu un citas telpiskās transkriptomikas tehnoloģijas, pētnieki var iegūt labāku izpratni par šūnu telpisko organizāciju un sarežģīto molekulāro mijiedarbību, kas notiek audos, sniedzot nenovērtējamu ieskatu mehānismos, kas ir pamatā bioloģiskajiem procesiem daudzās jomās, tostarp onkoloģija, neirozinātne, attīstības bioloģija, imunoloģija un botāniskie pētījumi.
Platforma: BMKManu S1000 mikroshēma un Illumina NovaSeq