-
PacBio-pilna garuma 16S/18S/ITS amplikonu sekvencēšana
Amplicon (16S/18S/ITS) platforma ir izstrādāta ar daudzu gadu pieredzi mikrobu daudzveidības projektu analīzē, kas ietver standartizētu pamata analīzi un personalizētu analīzi: pamata analīze aptver pašreizējo mikrobu pētījumu galveno analīzes saturu, analīzes saturs ir bagātīgs un visaptverošs, un analīzes rezultāti tiek prezentēti projektu atskaišu veidā;Personalizētās analīzes saturs ir daudzveidīgs.Paraugus var atlasīt un parametrus var elastīgi iestatīt atbilstoši pamata analīzes ziņojumam un pētījuma mērķim, lai realizētu personalizētas prasības.Windows operētājsistēma, vienkārša un ātra.
-
PacBio-pilna garuma transkripts (nav atsauces)
Izmantojot Pacific Biosciences (PacBio) izoformu sekvencēšanas datus kā ievadi, šī lietotne spēj identificēt pilna garuma transkripta sekvences (bez montāžas).Kartējot pilna garuma sekvences pret atsauces genomu, transkriptus var optimizēt ar zināmiem gēniem, transkriptiem, kodējošiem reģioniem utt. Šādā gadījumā var panākt precīzāku mRNS struktūru identificēšanu, piemēram, alternatīvu splicēšanu utt.Kopīga analīze ar NGS transkripta sekvencēšanas datiem nodrošina visaptverošāku anotāciju un precīzāku izteiksmes kvantitatīvo noteikšanu transkripta līmenī, kas lielā mērā dod labumu pakārtotajai diferenciālajai izteiksmei un funkcionālajai analīzei.
-
Rīku komplekti
BMKCloud ir vadošā bioinformātiskā platforma, kas nodrošina vienas pieturas risinājumu genoma programmām, kurai plaši uzticas pētnieki dažādās jomās, tostarp medicīnas, lauksaimniecības, vides uc jomā. BMKCloud ir apņēmies nodrošināt integrētus, uzticamus un efektīvus pakalpojumus, tostarp bioinformātiskās analīzes platformas un rīkus. , skaitļošanas resursi, publiska datu bāze, bioinformātiskie tiešsaistes kursi uc analīze utt.
-
maza RNS
Mazās RNS ir īsas nekodējošas RNS ar vidējo garumu 18-30 nt, ieskaitot miRNS, siRNS un piRNS.Ir ziņots, ka šīs mazās RNS ir masveidā iesaistītas dažādos bioloģiskos procesos, piemēram, mRNS degradācijā, translācijas inhibīcijā, heterohromatīna veidošanā utt. Mazās RNS sekvencēšanas analīze ir plaši izmantota pētījumos par dzīvnieku/augu attīstību, slimībām, vīrusiem utt. Maza RNS sekvencēšanas analīzes platforma sastāv no standarta analīzes un uzlabotas datu ieguves.Pamatojoties uz RNS-seq datiem, standarta analīze var sasniegt miRNS identifikāciju un prognozēšanu, miRNS mērķa gēnu prognozēšanu, anotāciju un ekspresijas analīzi.Uzlabotā analīze nodrošina pielāgotu miRNS meklēšanu un ekstrakciju, Venna diagrammas ģenerēšanu, miRNS un mērķa gēnu tīkla izveidi.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS ir visa genoma atkārtotas sekvencēšanas analīzes platforma, kas izstrādāta, pamatojoties uz bagātīgo pieredzi Biomarker Technologies.Šī ērti lietojamā platforma ļauj ātri iesniegt integrētu analīzes darbplūsmu, vienkārši iestatot dažus pamata parametrus, kas ir piemēroti DNS sekvencēšanas datiem, kas ģenerēti gan no Illumina platformas, gan BGI sekvencēšanas platformas.Šī platforma ir izvietota augstas veiktspējas skaitļošanas serverī, kas nodrošina ļoti efektīvu datu analīzi ļoti ierobežotā laikā.Personalizēta datu ieguve ir pieejama, pamatojoties uz standarta analīzi, tostarp mutācijas gēnu vaicājumu, PCR primer dizainu utt.
-
mRNS (atsauce)
Transkripts ir saikne starp genoma ģenētisko informāciju un bioloģiskās funkcijas proteomu.Transkripcijas līmeņa regulēšana ir vissvarīgākais un visplašāk pētītais organismu regulēšanas veids.Transkripta sekvencēšana var sekvencēt transkriptu jebkurā brīdī vai jebkuros apstākļos ar izšķirtspēju, kas ir precīza vienam nukleotīdam. Tā var dinamiski atspoguļot gēnu transkripcijas līmeni, vienlaikus identificēt un kvantitatīvi noteikt retus un normālus transkriptus un sniegt strukturālo informāciju konkrētu atšifrējumu paraugs.
Pašlaik transkripta sekvencēšanas tehnoloģija ir plaši izmantota agronomijā, medicīnā un citās pētniecības jomās, tostarp dzīvnieku un augu attīstības regulēšanā, vides pielāgošanā, imūnās mijiedarbībā, gēnu lokalizācijā, sugu ģenētiskajā evolūcijā un audzēju un ģenētisko slimību noteikšanā.
-
Metagenomika (NGS)
Šī analīzes platforma ir paredzēta bises metagenomisko datu analīzei, pamatojoties uz gadu pieredzi.Tā sastāv no integrētas darbplūsmas, kas satur dažādas bieži nepieciešamas metagenomikas analīzes, tostarp datu apstrādi, sugu līmeņa pētījumus, gēnu funkciju līmeņa pētījumus, metagenomu grupēšanu utt. Turklāt standarta analīzes darbplūsmā ir pieejami pielāgoti datu ieguves rīki, tostarp gēnu un sugu vaicājumi. , parametru iestatīšana, personalizēta figūras ģenerēšana utt.
-
LncRNS
Garās nekodējošās RNS (lncRNS) ir tāda veida transkripti, kuru garums pārsniedz 200 nt un kas nespēj kodēt proteīnus.Uzkrātie pierādījumi liecina, ka lielākā daļa lncRNS, visticamāk, būs funkcionālas.Augstas caurlaidspējas sekvencēšanas tehnoloģijas un bioinformātiskās analīzes rīki ļauj mums efektīvāk atklāt lncRNS sekvences un pozicionēšanas informāciju un ļauj mums atklāt lncRNS ar būtiskām regulējošām funkcijām.BMKCloud lepojas ar iespēju saviem klientiem nodrošināt lncRNS sekvencēšanas analīzes platformu, lai panāktu ātru, uzticamu un elastīgu lncRNS analīzi.
-
GWAS
Genoma mēroga asociācijas pētījuma (GWAS) mērķis ir identificēt ģenētiskos variantus (genotipu), kas saistīti ar specifiskām iezīmēm (fenotipu).GWA pētījumos tiek pētīti ģenētiskie marķieri, kas šķērso visu genomu lielam skaitam indivīdu, un prognozē genotipa-fenotipa asociācijas, izmantojot statistisku analīzi populācijas līmenī.Visa genoma atkārtota sekvencēšana var potenciāli atklāt visus ģenētiskos variantus.Savienojumā ar fenotipiskajiem datiem GWAS var apstrādāt, lai identificētu ar fenotipu saistītus SNP, QTL un kandidātgēnus, kas spēcīgi atbalsta mūsdienu dzīvnieku/augu audzēšanu.SLAF ir pašu izstrādāta vienkāršota genoma sekvencēšanas stratēģija, kas atklāj genoma mēroga izplatītus marķierus, SNP.Šos SNP kā molekulāros ģenētiskos marķierus var apstrādāt asociācijas pētījumiem ar mērķtiecīgām iezīmēm.Tā ir rentabla stratēģija, lai identificētu sarežģītas iezīmes, kas saistītas ar ģenētiskajām variācijām.
-
Nanopore pilna garuma transkriptomika
Sarežģītas un mainīgas alternatīvas izoformas organismos ir svarīgi ģenētiski mehānismi gēnu ekspresijas un olbaltumvielu daudzveidības regulēšanai.Precīza transkripta struktūru identificēšana ir pamats padziļinātai gēnu ekspresijas regulēšanas modeļu izpētei.Nanoporu sekvencēšanas platforma ir veiksmīgi nogādājusi transkriptomisko pētījumu izoformas līmenī.Šī analīzes platforma ir paredzēta, lai analizētu RNA-Seq datus, kas ģenerēti Nanopore platformā, pamatojoties uz atsauces genomu, kas nodrošina kvalitatīvu un kvantitatīvu analīzi gan gēnu līmenī, gan transkriptu līmenī.
-
cir-RNS
Cirkulārā RNS (circRNS) ir nekodējošas RNS veids, kam nesen tika atklāts, ka tiem ir būtiska nozīme regulējošajos tīklos, kas saistīti ar attīstību, vides rezistenci utt. Atšķiras no lineārām RNS molekulām, piemēram, mRNS, lncRNS, 3′ un 5′. cirRNS gali ir savienoti kopā, veidojot apļveida struktūru, kas pasargā tos no eksonukleāzes sagremošanas un ir stabilākas nekā lielākā daļa lineārās RNS.Ir konstatēts, ka CircRNA gēnu ekspresijas regulēšanā ir dažādas funkcijas.CircRNA var darboties kā ceRNS, kas konkurētspējīgi saistās ar miRNS, kas pazīstams kā miRNS sūklis.CircRNA sekvencēšanas analīzes platforma nodrošina cirRNS struktūras un ekspresijas analīzi, mērķa prognozēšanu un kopīgu analīzi ar cita veida RNS molekulām
-
BSA
Lielapjoma segregantās analīzes platforma sastāv no vienpakāpes standarta analīzes un uzlabotas analīzes ar pielāgotu parametru iestatījumu.BSA ir metode, ko izmanto, lai ātri identificētu ar fenotipu saistītos ģenētiskos marķierus.Galvenā BSA darbplūsma ietver: 1. divu indivīdu grupu atlasi ar izteikti pretējiem fenotipiem;2. visu indivīdu DNS, RNS vai SLAF-seq (izstrādāts ar Biomarķieri) apvienošana, lai izveidotu divas DNS masas;3. diferenciālo sekvenču identificēšana attiecībā pret atsauces genomu vai starp tām, 4. kandidātu saistīto reģionu prognozēšana ar ED un SNP indeksa algoritmu;5. Funkcionālā analīze un gēnu bagātināšana kandidātreģionos utt. Ir pieejama arī progresīvāka datu ieguve, tostarp ģenētisko marķieru skrīnings un primer dizains.
