Izceļ
Šajā divu stundu vebinārā mums ir liels gods uzaicināt sešus labības genomikas arēnas ekspertus.Mūsu runātāji sniegs padziļinātu interpretāciju par diviem Rudzu genoma pētījumiem, kas nesen tika publicētiDabas ģenētika:
1. Hromosomu mēroga genoma montāža sniedz ieskatu rudzu bioloģijā, evolūcijā un agronomiskajā potenciālā
2. Augstas kvalitātes genoma komplekts izceļ rudzu genoma īpašības un agronomiski svarīgus gēnus
Mēs arī priecājamies, ka Biomarķieru tehnoloģiju vecākais pētniecības un attīstības zinātnieks dalās savā pieredzē de novo genoma montāžā.
Darba kārtība
09:00 CET
Apsveicamības piezīmes
Džens Honkuns
Uzņēmuma Biomarker Technologies dibinātājs un izpilddirektors
Dens Sjvans
Pekinas universitātes Augstāko lauksaimniecības zinātņu skolas prezidents
09:15
Rudzu, tritikāles un kviešu kvalitātes uzlabošana, izmantojot augstas kvalitātes atsauces genoma secību
Šajā tīmekļseminārā prof. Vans sniedza mums vispārīgu informāciju par pašreizējo triticejas genoma pētījumu stāvokli un demonstrēja divu izcilu darbu par rudzu genoma pētījumiem panākumus un sasniegumus, kas nesen tika publicēti vietnē Nature Genetics un iepazīstina ar visu pētījumu. grupas, kas vada darbus un piedalās tajos.
09:25
Graudaugu genomika @ IPK Gatersleben
Triticeae cilts graudaugu stiebrzāles ir bijis nozīmīgs pārtikas avots mērenajos reģionos, kas jau sen tiek uzskatīti par ražas uzlabošanas un audzēšanas karsto vietu.No visām kultivētajām sugām šī cilts ir slavena ar savām ārkārtīgi sarežģītajām genoma iezīmēm, tostarp lieliem genoma izmēriem, augstu TE saturu, poliploīdiju utt. Šajā sesijā prof. Nils Steins sniedza mums vispārīgu ievadu par IPK Gatersleben un pašreizējo labības stāvokli. genomic research@IPK Gatersleben.
09:35
Hromosomu mēroga genoma montāža sniedz ieskatu rudzu bioloģijā, evolūcijā un agronomiskajā potenciālā
Dr. M Timotijs Rabanuss-Volss, Leibnicas Augu ģenētikas un kultūraugu plānu pētniecības institūts (IPK)Rudzi (Secale cereale L.) ir īpaši klimata noturīga labības kultūra, ko plaši izmanto, lai ražotu uzlabotas kviešu šķirnes, izmantojot introgresīvu hibridizāciju, un kam ir viss gēnu repertuārs, kas nepieciešams, lai nodrošinātu hibrīdu selekciju.Rudzi ir alogāmi un tikai nesen pieradināti, kas nodrošina kultivētajiem rudziem piekļuvi daudzveidīgam un izmantojamam savvaļas genofondam.Lai vēl vairāk uzlabotu rudzu agronomisko potenciālu, mēs izveidojām hromosomu mēroga anotētu 7, 9 Mbp rudzu genoma komplektu un plaši apstiprinājām tā kvalitāti, izmantojot molekulāro ģenētisko resursu komplektu.Mēs demonstrējam šī resursa pielietojumu ar plašu pētījumu klāstu.Mēs piedāvājam atklājumus par kultivēto rudzu nepilnīgo ģenētisko izolāciju no savvaļas radiniekiem, genoma strukturālās evolūcijas mehānismiem, patogēnu rezistenci, zemas temperatūras toleranci, auglības kontroles sistēmām hibrīdu audzēšanai un rudzu-kviešu introgresiju ražas ieguvumiem.
10:05
Augstas kvalitātes genoma komplekts izceļ rudzu genoma īpašības un agronomiski svarīgus gēnus
Rudzi ir vērtīga pārtikas un lopbarības kultūra, nozīmīgs ģenētiskais resurss kviešu un tritikāles uzlabošanai un neaizstājams materiāls efektīviem salīdzinošajiem genomikas pētījumiem stiebrzālēm.Šeit mēs sekvencējām Weining rudzu, elites Ķīnas rudzu šķirnes, genomu.Samontētie kontigi (7, 74 Gb) veidoja 98, 47% no aplēstā genoma lieluma (7, 86 Gb), un 93, 67% kontigu (7, 25 Gb) tika piešķirti septiņām hromosomām.Atkārtoti elementi veidoja 90, 31% no samontētā genoma.Salīdzinot ar iepriekš sekvencētiem Triticeae genomiem, Daniela, Sumaya un Sumana retrotransposoni uzrādīja spēcīgu rudzu izplešanos.Turpmākās Weining montāžas analīzes atklāja jaunu informāciju par genoma mēroga gēnu dublēšanos un to ietekmi uz cietes biosintēzes gēniem, sarežģītu prolamīna lokusu fiziskajām organizācijām, gēnu ekspresijas iezīmēm, kas ir pamatā agrīnas virziena iezīmei, un domājamiem ar pieradināšanu saistītiem hromosomu reģioniem un lokusiem rudzos.Šī genoma secība sola paātrināt rudzu un saistīto labības kultūru genomiku un selekcijas pētījumus.
10:35
Genoma de novo montāžas izaicinājumi, risinājumi un nākotne
Augstas kvalitātes genoms ir genoma pētījuma pamatā.Lai gan straujā sekvencēšanas un algoritmu attīstība ir devusi iespēju daudz vienkāršākai un efektīvākai genoma montāžai, prasības montāžas precizitātei un pilnīgumam pieaug arī līdz ar pētniecības mērķu padziļināšanu.Šajā sarunā es apspriedīšu pašreizējās populārās tehnoloģijas genoma montāžā ar vairākiem veiksmīgiem gadījumiem un sniegšu ieskatu turpmākajā attīstībā.
Publicēšanas laiks: 08.01.2022