MIKROBI
Baktēriju saderība un imobilizācija ar biooglēm uzlaboja tebukonazola noārdīšanos, augsnes mikrobioma sastāvu un darbību
Pilna garuma 16S amplikonu sekvencēšana |PacBio HiFi |Alfa daudzveidība |Beta daudzveidība
Šajā pētījumā pilna garuma 16S amplikonu sekvencēšanu ar PacBio un bioinformātisko analīzi nodrošināja Biomarker Technologies.
Izceļ
Bioloģiskās ogles imobilizētās tebukonazolu noārdošās baktērijas Alcaligenes faecalis WZ-2 tika pētītas attiecībā uz biodegradācijas efektivitāti un ietekmi uz tebukonazolu piesārņotu augsni, salīdzinot ar brīvi noārdošo celmu WZ-2.
1. Bioogles imobilizētais WZ-2 uzrādīja efektīvāku noārdīšanos tebukonazolā salīdzinājumā ar brīvo WZ-2, samazinot tebukonazola pussabrukšanas periodu augsnē no 18,7 dienām līdz 13,3 dienām.
2. Bioogles imobilizētie WZ-2 spēja atjaunot dabisko augsnes mikrobu enzīmu aktivitātes, tostarp ureāzi, dehidrogenāzi un invertāzi utt.
3. Mikrobu profils ar biooglēm imobilizētā WZ-2 apstrādātā augsnē, kas noteikts ar pilna garuma 16S sekvencēšanu, stingri apstiprināja, ka šī sistēma varētu atjaunot augsnes veselību, uzlabojot baktēriju kopienas struktūru tebukonazola piesārņojuma apstākļos.
Eksperiments (saistīts ar secību)
Grupēšana: CK: dabiska augsne;T: augsne ar tebukonazolu;S: Tebukonazols saturēja augsni ar brīvu celmu WZ-2;BC: Tebukonazols saturēja augsni ar biooglēm;BCS: Tebukonazols saturēja augsni ar imobilizētu WZ-2 biooglēm.
Paraugu ņemšana: kopējā augsnes DNS ekstrakcija, kas pastiprināta ar 16S rDNS praimeriem
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) un 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),atspoguļo pilna garuma 16S rDNS
Sekvences platforma: PacBio RS II
Sekvences stratēģija: CCS HIFI nolasa
Datu analīze:BMKCloudBioinformātiskā platforma padara zelta zivtiņu par lielisku zivju fizioloģijas un evolūcijas ģenētisko modeļu sistēmu.
Rezultāts
Augsnes mikrobu kopienas struktūra tika noteikta ar 16S rDNS sekvencēšanu.Tika novērtēts OTU bagātības un alfa daudzveidības indekss, ieskaitot Chao1, Ace, Shannon un Simpson indeksus, lai atklātu sugu daudzveidību katrā sistēmā.Pēc 60 dienu inkubācijas visiem rādītājiem bija līdzīga tendence, ti, tebukonazols var izraisīt sugu bagātības un daudzveidības samazināšanos augsnē.Tomēr, pievienojot celmu WZ-2, augsnes baktēriju kopiena tika daļēji atjaunota gan bagātības, gan daudzveidības ziņā.Tika novērota ierobežota atšķirība starp BC, BCS un CK, norādot, ka bioogles un bioogles imobilizētais WZ-2 varētu efektīvi atjaunot augsnes bioloģisko veselību.
Šajā pētījumā tika izmantota nesvērtā pāru grupu metode ar vidējiem aritmētiskiem (UPGMA), lai parādītu beta daudzveidību starp grupām.Kā parādīts nākamajā attēlā, BC, BSC un CK bija līdzīgāks mikrobu sastāva modelis, salīdzinot ar grupu T un S, kas vēl vairāk norādīja, ka bioogles ievadīšana ar tebukonazolu piesārņotās augsnes bioremediācijā varētu lielā mērā atvieglot mikrobu kopienas atjaunošanos augsnē.
attēls.Baktēriju kopienas UPGMA klasterizācija patvēruma līmenī ar atšķirīgu ārstēšanu
Atsauce
Sun, Tong u.c."Baktēriju saderība un imobilizācija ar biooglēm uzlaboja tebukonazola noārdīšanos, augsnes mikrobioma sastāvu un darbību."Bīstamo materiālu žurnāls398 (2020): 122941.
Jaunumi un svarīgākie notikumi mērķis ir dalīties ar jaunākajiem veiksmīgajiem gadījumiem ar Biomarker Technologies, tverot jaunus zinātnes sasniegumus, kā arī ievērojamas metodes, kas izmantotas pētījuma laikā.
Publicēšanas laiks: 08.01.2022