Genoma mēroga asociācijas pētījuma (GWAS) mērķis ir identificēt ģenētiskos variantus (genotipu), kas saistīti ar specifiskām iezīmēm (fenotipu).GWA pētījumos tiek pētīti ģenētiskie marķieri, kas šķērso visu genomu lielam skaitam indivīdu, un prognozē genotipa-fenotipa asociācijas, izmantojot statistisku analīzi populācijas līmenī.Visa genoma atkārtota sekvencēšana var potenciāli atklāt visus ģenētiskos variantus.Savienojumā ar fenotipiskajiem datiem GWAS var apstrādāt, lai identificētu ar fenotipu saistītus SNP, QTL un kandidātgēnus, kas spēcīgi atbalsta mūsdienu dzīvnieku/augu audzēšanu.SLAF ir pašu izstrādāta vienkāršota genoma sekvencēšanas stratēģija, kas atklāj genoma mēroga izplatītus marķierus, SNP.Šos SNP kā molekulāros ģenētiskos marķierus var apstrādāt asociācijas pētījumiem ar mērķtiecīgām iezīmēm.Tā ir rentabla stratēģija, lai identificētu sarežģītas iezīmes, kas saistītas ar ģenētiskajām variācijām.