BMKGENE sniedza telpiskās transkripta sekvencēšanas pakalpojumus pētījumam “STEEL ļauj augstas izšķirtspējas norobežot spatiotemporālos transkriptomiskos datus”, kas tika publicēts izdevumā “Bioinformatics”.
Šajā pētījumā tika piedāvāts neuzraudzīts un daudzveidīgs uz mācībām balstīts algoritms, telpiskā transkripta šūnu tipa klasterēšana (STEEL), kas identificē domēnus no telpiskā transkripta, sagrupējot lodītes, kurām ir gan ļoti līdzīgi gēnu ekspresijas profili, gan tuvu telpiskais attālums grafiku veidā.
Visaptverošs STEEL novērtējums telpiskajās transkriptomiskās datu kopās no platformas 10X Visium parāda, ka tas ne tikai nodrošina augstu izšķirtspēju, lai raksturotu peles smadzeņu smalkās struktūras, bet arī ļauj integrēt vairākus audu slaidus, kas atsevišķi analizēti lielākā.
Attīstoties telpiskās transkripta tehnoloģijām, mūsu metode būs lieliski pielietojama domēna identificēšanā un gēnu ekspresijas atlanta rekonstrukcijā.
Klikšķisšeitlai uzzinātu vairāk par šo pētījumu.
Izlikšanas laiks: 20.-20.2023