● Liela pieredze: BMK ir apstrādāti vairāk nekā 200 000 paraugu, kas aptver dažādus paraugu veidus, tostarp šūnu kultūru, audus, ķermeņa šķidrumu utt., un vairāk nekā 7000 mRNA-Seq projektu ir slēgti, aptverot dažādas pētniecības jomas.
● Stingra kvalitātes kontroles sistēma: galvenie kvalitātes kontroles punkti visos posmos, tostarp paraugu sagatavošana, bibliotēkas sagatavošana, sekvencēšana un bioinformātika, tiek rūpīgi uzraudzīti, lai nodrošinātu augstas kvalitātes rezultātus.
● Pieejamas vairākas datu bāzes funkciju anotācijas un bagātināšanas pētījumiem, lai sasniegtu dažādus pētniecības mērķus.
● Pēcpārdošanas pakalpojumi: pēcpārdošanas pakalpojumi, kas ir spēkā 3 mēnešus pēc projekta pabeigšanas, tostarp projekta uzraudzība, problēmu novēršana, rezultātu jautājumi un atbildes utt.
Bibliotēka | Sekvences stratēģija | Ieteicamie dati | Kvalitātes kontrole |
Poly A bagātināts | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nukleotīdi:
Konc. (ng/μl) | Daudzums (μg) | Tīrība | Integritāte |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Uz gēla parādīts ierobežots proteīnu vai DNS piesārņojums vai tā nav. | Augiem: RIN≥6,5; Dzīvniekiem: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; ierobežots vai vispār nav bāzes līmeņa pacēluma |
Audi: svars (sauss):≥1 g
*Audiem, kas ir mazāki par 5 mg, iesakām nosūtīt ātri sasaldētu (šķidrā slāpeklī) audu paraugu.
Šūnu suspensija:Šūnu skaits = 3 × 106- 1 × 107
* Mēs iesakām nosūtīt saldētu šūnu lizātu.Gadījumā, ja šūnu skaits ir mazāks par 5 × 105.
Asins paraugi:Tilpums≥1 ml
Mikroorganisms:Masa ≥ 1 g
Tvertne: 2 ml centrifūgas caurule (skārda folija nav ieteicama)
Marķējuma paraugs: grupa + atkārtojums, piemēram, A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Sūtījums:
Bioinformātika
Eikariotu mRNS sekvencēšanas analīzes darbplūsma
Bioinformātika
ØNeapstrādātu datu kvalitātes kontrole
ØAtsauces genoma izlīdzināšana
ØAtšifrējuma struktūras analīze
ØIzteiksmes kvantifikācija
ØDiferenciālās izteiksmes analīze
ØFunkciju anotācija un bagātināšana
1.mRNS datu piesātinājuma līkne
2.Diferenciālās izteiksmes analīze - Vulkāna grafiks
3.KEGG anotācija uz DEG
4.GO klasifikācija pēc DEG