Heatmap stalčius naudojamas šilumos žemėlapio braižymui, kuris gali filtruoti, normalizuoti ir klasterizuoti matricos duomenis. Jis dažniausiai naudojamas genų ekspresijos lygio tarp skirtingų mėginių klasterinei analizei.
Biologinių funkcijų prijungimas prie FASTA failo sekų suderinant sekas su duomenų baze, įskaitant NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) – tai algoritmas ir programa, skirta rasti regionus su panašiomis biologinėmis sekomis.Jis lygina šias sekas su sekų duomenų bazėmis ir apskaičiuoja statistinį reikšmingumą.BLAST sudaro keturių tipų įrankiai, pagrįsti sekos tipu: blastn, lastp, blastx ir tblastn.