Produktai

Vieno branduolio RNR sekos nustatymas

Vienos ląstelės fiksavimo ir individualios bibliotekos kūrimo technikos pažanga, derinant su didelio našumo sekos nustatymu, leidžia atlikti genų ekspresijos tyrimus kiekvienoje ląstelėje.Tai leidžia atlikti gilesnę ir išsamesnę sudėtingų ląstelių populiacijų sistemos analizę, kurioje iš esmės išvengiama jų heterogeniškumo maskavimo, atsižvelgiant į visų ląstelių vidurkį.

Tačiau kai kurios ląstelės nėra tinkamos gaminti vienaląstę suspensiją, todėl reikalingi kiti mėginio paruošimo būdai – branduolio ekstrahavimas iš audinių, tai yra, branduolys yra tiesiogiai ekstrahuojamas iš audinių ar ląstelės ir ruošiamas į vieno branduolio suspensiją, skirtą vienaląstelei. ląstelių sekos nustatymas.

BMK teikia 10× Genomics ChromiumTM pagrįstą vienos ląstelės RNR sekos nustatymo paslaugą.Ši paslauga buvo plačiai naudojama tiriant su ligomis susijusius tyrimus, tokius kaip imuninių ląstelių diferenciacija, naviko heterogeniškumas, audinių vystymasis ir kt.

Erdvinis transkripto lustas: 10 × genomika

Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma

Susisiekite su mumis

Paslaugos informacija

Bioinformatika

Demonstraciniai rezultatai

Techninis principas

Branduolius izoliuoja 10× Genomics ChromiumTM, susidedanti iš aštuonių kanalų mikroskysčių sistemos su dvigubomis kryžmėmis.Šioje sistemoje gelio granulės su brūkšniniais kodais ir gruntu, fermentais ir vienu branduoliu yra įdėtos į nanolitro dydžio aliejaus lašą, sukuriant gelio granules emulsijoje (GEM).Kai susidaro GEM, kiekviename GEM atliekama ląstelių lizė ir brūkšninių kodų išleidimas.mRNR yra atvirkštinis transkribavimas į cDNR molekules su 10 × brūkšniniais kodais ir UMI, kurioms toliau taikoma standartinė sekos bibliotekos konstrukcija.

Audinys netinka vienos ląstelės suspensijai ruošti

Ląstelė / audinys	Priežastis
Nešvieži šaldyti audiniai	Nepavyko gauti naujų arba ilgai išsaugotų organizacijų
Raumenų ląstelė, megakariocitai, riebalai…	Ląstelės skersmuo per didelis, kad būtų galima patekti į instrumentą
Kepenys…	Per trapus, kad sulaužytų, negali atskirti pavienių ląstelių
Neuroninė ląstelė, smegenys…	Jautresnis, lengvai įtempiamas, pakeis sekos rezultatus
Kasa, skydliaukė…	Gausu endogeninių fermentų, turinčių įtakos vienos ląstelės suspensijos gamybai

Vieno branduolio vs vienaląstė

Vienbranduolis	Vienaląstė
Neribotas ląstelės skersmuo	Ląstelės skersmuo: 10-40 μm
Medžiaga gali būti užšaldytas audinys	Medžiaga turi būti šviežių audinių
Mažas šaldytų ląstelių stresas	Gydymas fermentais gali sukelti ląstelių streso reakciją
Nereikia pašalinti raudonųjų kraujo kūnelių	Raudonieji kraujo kūneliai turi būti pašalinti
Branduolinė išreiškia bioinformaciją	Visa ląstelė išreiškia bioinformaciją