-
Vieno branduolio RNR sekos nustatymas
Vienos ląstelės fiksavimo ir individualios bibliotekos kūrimo technikos pažanga, derinant su didelio našumo sekos nustatymu, leidžia atlikti genų ekspresijos tyrimus kiekvienoje ląstelėje.Tai leidžia atlikti gilesnę ir išsamesnę sudėtingų ląstelių populiacijų sistemos analizę, kurioje iš esmės išvengiama jų heterogeniškumo maskavimo, atsižvelgiant į visų ląstelių vidurkį.
Tačiau kai kurios ląstelės nėra tinkamos gaminti vienaląstę suspensiją, todėl reikalingi kiti mėginio paruošimo būdai – branduolio ekstrahavimas iš audinių, tai yra, branduolys yra tiesiogiai ekstrahuojamas iš audinių ar ląstelės ir ruošiamas į vieno branduolio suspensiją, skirtą vienaląstelei. ląstelių sekos nustatymas.
BMK teikia 10× Genomics ChromiumTM pagrįstą vienos ląstelės RNR sekos nustatymo paslaugą.Ši paslauga buvo plačiai naudojama tiriant su ligomis susijusius tyrimus, tokius kaip imuninių ląstelių diferenciacija, naviko heterogeniškumas, audinių vystymasis ir kt.
Erdvinis transkripto lustas: 10 × genomika
Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma
-
BMKMANU S1000 erdvinis transkriptas
Erdvinė transkriptomika yra mokslo naujovių priešakyje, suteikianti tyrėjams galimybę gilintis į sudėtingus genų ekspresijos modelius audiniuose, išsaugant jų erdvinį kontekstą.Tarp įvairių platformų BMKGene sukūrė BMKManu S1000 erdvinį transkripto lustą, turintįpadidinta raiška5 µM, pasiekiant tarpląstelinį diapazoną ir įgalinantkelių lygių raiškos nustatymai.S1000 lustas, turintis maždaug 2 milijonus dėmių, naudoja mikrošulinėlius, sluoksniuotus rutuliukais, užpildytais erdviniu brūkšniniu kodu užfiksuotais fiksavimo zondais.cDNR biblioteka, praturtinta erdviniais brūkšniniais kodais, paruošiama iš S1000 lusto ir vėliau sekvenuojama Illumina NovaSeq platformoje.Erdvinio brūkšninio kodo pavyzdžių ir UMI derinys užtikrina generuojamų duomenų tikslumą ir specifiškumą.Unikali BMKManu S1000 lusto savybė yra jo universalumas, siūlantis kelių lygių raiškos nustatymus, kuriuos galima tiksliai suderinti su įvairiais audiniais ir detalumo lygiais.Dėl šio pritaikomumo lustas yra puikus pasirinkimas įvairiems erdvinės transkriptomikos tyrimams, užtikrinant tikslų erdvinį grupavimą su minimaliu triukšmu.
Naudodami BMKManu S1000 lustą ir kitas erdvinės transkriptomikos technologijas, mokslininkai gali geriau suprasti erdvinį ląstelių organizavimą ir sudėtingas molekulines sąveikas, vykstančias audiniuose, suteikdami neįkainojamų įžvalgų apie mechanizmus, kuriais grindžiami biologiniai procesai įvairiose srityse, įskaitant onkologijos, neurologijos, vystymosi biologijos, imunologijos ir botanikos studijos.
Platforma: BMKManu S1000 lustas ir Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium erdvinis transkriptas
Erdvinė transkriptomika yra pažangiausia technologija, leidžianti tyrėjams ištirti genų ekspresijos modelius audiniuose, išsaugant jų erdvinį kontekstą.Viena galinga platforma šioje srityje yra 10x Genomics Visium kartu su Illumina sekos nustatymu.10X Visium principas slypi specializuotame mikroschemoje su nustatyta fiksavimo zona, kurioje dedamos audinių sekcijos.Šioje fiksavimo srityje yra brūkšniniu kodu pažymėtų dėmių, kurių kiekviena atitinka unikalią erdvinę vietą audinyje.Atvirkštinės transkripcijos proceso metu iš audinio užfiksuotos RNR molekulės yra paženklintos unikaliais molekuliniais identifikatoriais (UMI).Šios brūkšninio kodo dėmės ir UMI leidžia tiksliai sudaryti erdvinius žemėlapius ir kiekybiškai įvertinti genų ekspresiją vienos ląstelės skiriamąja geba.Erdvinio brūkšninio kodo pavyzdžių ir UMI derinys užtikrina generuojamų duomenų tikslumą ir specifiškumą.Naudodami šią erdvinės transkriptomikos technologiją, mokslininkai gali įgyti gilesnį supratimą apie erdvinį ląstelių organizavimą ir sudėtingas molekulines sąveikas, vykstančias audiniuose, suteikdami neįkainojamų įžvalgų apie mechanizmus, kuriais grindžiami biologiniai procesai įvairiose srityse, įskaitant onkologiją, neuromokslą, vystymosi biologiją, imunologiją. , ir botanikos studijos.
Platforma: 10X Genomics Visium ir Illumina NovaSeq
