-
BSA
Masinės segregantinės analizės platformą sudaro vieno žingsnio standartinė analizė ir išplėstinė analizė su pritaikytu parametrų nustatymu.BSA yra metodas, naudojamas greitai nustatyti su fenotipu susijusius genetinius žymenis.Pagrindinę BSA darbo eigą sudaro: 1. atrenkamos dvi labai priešingų fenotipų individų grupės;2. visų individų DNR, RNR arba SLAF-seq (sukurta Biomarker) sujungimas, kad susidarytų dvi DNR dalys;3. diferencinių sekų nustatymas pagal etaloninį genomą arba tarp jų, 4. kandidatų susietų regionų numatymas pagal ED ir SNP indekso algoritmą;5. Funkcinė analizė ir genų sodrinimas regionuose kandidatuose ir tt Taip pat galimas pažangesnis duomenų, įskaitant genetinių žymenų patikrinimą ir pradmenų projektavimą, gavyba.
-
„Amplicon“ (16S / 18S / ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platforma sukurta su ilgamete mikrobų įvairovės projektų analizės patirtimi, kuri apima standartizuotą bazinę analizę ir personalizuotą analizę: pagrindinė analizė apima pagrindinį dabartinių mikrobų tyrimų analizės turinį, analizės turinys yra turtingas ir išsamus, ir analizės rezultatai pateikiami projektų ataskaitų forma;Personalizuotos analizės turinys yra įvairus.Mėginiai gali būti atrenkami ir parametrai gali būti lanksčiai nustatyti pagal pagrindinę analizės ataskaitą ir tyrimo tikslą, kad būtų galima realizuoti individualizuotus reikalavimus.Windows operacinė sistema, paprasta ir greita.
-
Evoliucinė genetika
Evoliucinė genetika yra supakuota sekos nustatymo paslauga, skirta pateikti išsamią tam tikrų medžiagų evoliucinės informacijos interpretaciją, pagrįstą genetiniais variantais, įskaitant SNP, InDels, SV ir CNV.Jame pateikiama visa esminė analizė, reikalinga populiacijų evoliuciniams pokyčiams ir genetiniams ypatumams apibūdinti, tokiems kaip populiacijų struktūra, genetinė įvairovė, filogeniniai ryšiai ir kt. Taip pat pateikiami genų srauto tyrimai, kurie leidžia įvertinti efektyvų populiacijos dydį, divergencijos laiką.
-
Lyginamoji genomika
Lyginamoji genomika pažodžiui reiškia visų skirtingų rūšių genomo sekų ir struktūrų palyginimą.Šios disciplinos tikslas – atskleisti rūšių evoliuciją, genų funkciją, genų reguliavimo mechanizmą genomo lygmeniu, nustatant sekos struktūras ir elementus, kurie išliko arba skiriasi skirtingose rūšyse.Tipiškas lyginamasis genomikos tyrimas apima genų šeimos, evoliucinio vystymosi, viso genomo dubliavimo, selektyvaus slėgio ir kt.
-
Evoliucinė genetika
Populiacijos ir evoliucinės genetinės analizės platforma sukurta remiantis ilgamete BMK MTEP komandoje sukaupta didžiule patirtimi.Tai patogus įrankis, ypač skirtas tyrėjams, kurių specialybė nėra bioinformatika.Ši platforma leidžia atlikti pagrindinę su evoliucine genetika susijusią bazinę analizę, įskaitant filogenetinių medžių konstravimą, jungčių pusiausvyros analizę, genetinės įvairovės vertinimą, selektyvų nuskaitymo analizę, giminystės analizę, PCA, populiacijos struktūros analizę ir kt.
-
Hi-C pagrįstas genomo surinkimas
Hi-C yra metodas, skirtas užfiksuoti chromosomų konfigūraciją, derinant zondavimo artumu pagrįstą sąveiką ir didelio našumo sekos nustatymą.Manoma, kad šių sąveikų intensyvumas neigiamai koreliuoja su fiziniu atstumu chromosomose.Todėl Hi-C duomenys galėtų padėti grupuoti, rūšiuoti ir orientuoti surinktas sekas juodraščio genome ir pritvirtinti jas prie tam tikro skaičiaus chromosomų.Ši technologija suteikia galimybę sudaryti chromosomų lygio genomą, jei nėra populiacijos genetinio žemėlapio.Kiekvienam genomui reikia Hi-C.
Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma / DNBSEQ
-
Augalų/gyvūnų de Novo genomo sekos nustatymas
De Novosekos nustatymas reiškia viso rūšies genomo kūrimą naudojant sekos nustatymo technologijas, pvz., PacBio, Nanopore, NGS ir kt., nesant etaloninio genomo.Nepaprastas trečios kartos sekos nustatymo technologijų skaitymo ilgio pagerėjimas suteikė naujų galimybių surinkti sudėtingus genomus, tokius kaip dideli heterozigotiniai genomai, didelis pasikartojančių regionų santykis, poliploidai ir kt. Kadangi skaitymo ilgis siekia dešimčių kilobazių, šie sekos nuskaitymai įgalina pasikartojančių elementų, nenormalaus GC turinio sričių ir kitų labai sudėtingų regionų išskyrimas.
Platforma: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq platforma
-
Žmogaus viso egzomo sekos nustatymas
Viso egzomo sekos nustatymas (WES) laikomas ekonomiškai efektyvia sekos nustatymo strategija ligas sukeliančių mutacijų nustatymui.Nors egzonai užima tik maždaug 1, 7% viso genomo, jie tiesiogiai atspindi visų baltymų funkcijų profilį.Žmogaus genome buvo pranešta, kad daugiau nei 85% su liga susijusių mutacijų atsiranda baltymus koduojančiame regione.
BMKGENE siūlo išsamias ir lanksčias žmogaus viso egzomo sekos nustatymo paslaugas su skirtingomis egzonų fiksavimo strategijomis, skirtomis įvairiems tyrimo tikslams pasiekti.
Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma
-
Specifinio lokuso sustiprintų fragmentų sekos nustatymas (SLAF-Seq)
Didelio našumo genotipų nustatymas, ypač didelio masto populiacijose, yra esminis genetinių asociacijų tyrimų žingsnis, suteikiantis genetinį pagrindą funkciniams genų atradimams, evoliucinei analizei ir kt. Vietoj gilaus viso genomo pakartotinio sekos nustatymo, sumažintas reprezentacinio genomo sekos nustatymas (RRGS) ).Paprastai tai pasiekiama ištraukiant restrikcijos fragmentą tam tikro dydžio diapazone, kuris vadinamas sumažinto reprezentavimo biblioteka (RRL).Specifinio lokuso amplifikuotų fragmentų sekos nustatymas (SLAF-Seq) yra savarankiškai sukurta SNP genotipų nustatymo strategija su etaloniniu genomu arba be jo.
Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma -
Illumina ir BGI
„Illumina“ sekos nustatymo technologija, pagrįsta Sequencing by Synthesis (SBS), yra visame pasaulyje taikoma NGS naujovė, atsakinga už daugiau nei 90 % pasaulio sekos nustatymo duomenų.SBS principas apima fluorescenciniu būdu pažymėtų grįžtamųjų terminatorių vaizdavimą, kai pridedamas kiekvienas dNTP, o vėliau suskaidomas, kad būtų galima įtraukti kitą bazę.Kai kiekviename sekos cikle yra visi keturi grįžtamieji su terminatoriumi susieti dNTP, natūrali konkurencija sumažina įtraukimo šališkumą.Ši universali technologija palaiko ir vieno skaitymo, ir suporuotas bibliotekas, tinkančias įvairioms genominėms programoms.Dėl didelio našumo ir tikslumo „Illumina“ sekos nustatymo jis yra genomikos tyrimų kertinis akmuo, suteikiantis mokslininkams galimybę atskleisti genomų sudėtingumą neprilygstamai detaliai ir efektyviai.
DNBSEQ, sukurta BGI, yra dar viena novatoriška NGS technologija, kuri sugebėjo dar labiau sumažinti sekos sąnaudas ir padidinti pralaidumą.DNBSEQ bibliotekų paruošimas apima DNR fragmentavimą, ssDNR paruošimą ir riedėjimo rato amplifikaciją, kad būtų gauti DNR nanokamuoliai (DNB).Tada jie įkeliami ant kieto paviršiaus ir sekvenuojami kombinatorine zondo-inkaro sinteze (cPAS).
Mūsų iš anksto sukurta bibliotekos sekos nustatymo paslauga palengvina klientams paruošti savo sekos nustatymo bibliotekas iš įvairių šaltinių (mRNR, viso genomo, amplikono ir kt.).Vėliau šios bibliotekos gali būti išsiųstos į mūsų sekos nustatymo centrus kokybės kontrolei ir sekos nustatymui Illumina arba BGI platformose.
