Nanoporų pagrindu sukurta viso ilgio transkripto seka
Nanoporų sekos nustatymas iš kitų sekos nustatymo platformų išsiskiria tuo, kad nukleotidai nuskaitomi tiesiogiai be DNR sintezės ir generuoja ilgus nuskaitymus dešimčių kilobazių.Tai suteikia galimybę tiesiogiai nuskaityti viso ilgio nuorašus ir spręsti transkriptominių tyrimų iššūkius.
√ Mažas sekai būdingas poslinkis
√ Viso ilgio cDNR rodmenys genų struktūros tyrimams
√ Mažiau duomenų reikia tam pačiam nuorašų skaičiui
√ Vieno geno kelių izoformų identifikavimas
√ Išraiškos kiekybinis įvertinimas izoformų lygiu
Tipiškas bioinformatikos vamzdynas
Naujausi sėkmingi atvejai naudojant „Biomarker“ technologijas
1. Lyginamoji viso ilgio transkriptų analizė atskleidžia Gnetum luofuense stiebo vystymosi dinamiką
Žurnalas: Genetikos sienos
Paskelbta: 2021 m. kovo mėn
Raktiniai žodžiai: MinION |Alternatyvus sujungimas |APA |lncRNR |Skirtingai išreikšti nuorašai
Skaityti visą tekstą
2. Vienakryptis mažų RNR judėjimas nuo ūglių iki šaknų tarprūšiniuose heterotransplantuose
Žurnalas: Nature Plants
Paskelbta: 2021 m. sausio mėn
Raktiniai žodžiai: Nanoporas |Iliumina |viso ilgio mobiliojo mRNR aptikimas
3. Viso ilgio šparagų šaknų transkripto analizė atskleidžia arbuskulinių mikorizinių grybų sukeltos druskos tolerancijos molekulinį mechanizmą
Žurnalas: Environmental and Experimental Botany
Paskelbta: 2021 m. sausio mėn
Raktiniai žodžiai: MinION |Skirtingai išreikšti nuorašai |Transkripcijos faktoriai |Alternatyvus sujungimas
4. Rožių (Rosa chinensis) šaknų ir lapų fiziologiniai pokyčiai ir viso ilgio transkriptas, reaguojant į sausros stresą
Žurnalas: Augalų ir ląstelių fiziologija
Paskelbta: 2020 m. spalio mėn
Raktiniai žodžiai: PromethION |Skirtingai išreikšti nuorašai |Funkcinis numatymas |Sujungtos izoformos |TF ir lncRNR
5. Arabidopsis transkripto PacBio ir nanoporomis pagrįstos RNR sekos analizė ir išsamus palyginimas
Žurnalas: Augalų metodas
Paskelbta: 2020 m. balandžio mėn
Raktiniai žodžiai: GridION |PromethION |PacBio tęsinys |Illumina NovaSeq |Genomo derinimas |Nuorašo identifikavimas |Alternatyvus sujungimas |SSR |LncRNR |Izoformų kiekybinis nustatymas
Naujienos ir svarbiausi dalykai siekia pasidalyti naujausiais sėkmingais atvejais su „Biomarker Technologies“, užfiksuoti naujus mokslo laimėjimus ir svarbius tyrimo metu taikytus metodus.
Paskelbimo laikas: 2022-08-08