Viso genomo asociacijos analizė
1. Paslaugos pranašumai
● Gausūs projektų atvejai: nuo pat įkūrimo 2009 m. BMKGENE įvykdė šimtus rūšių projektų populiacijos GWAS tyrimuose, padėjo mokslininkams paskelbti daugiau nei 100 straipsnių, o bendras poveikio koeficientas pasiekė 500.
● Profesionalūs analitikai.
● Trumpas analizės ciklas.
● Tikslus duomenų gavyba.
2. Paslaugos specifikacijos
| Tipas | Gyventojų skalė | Sekos nustatymo strategija ir gylis |
| SLAF-GWAS | Mėginio skaičius ≥200 | Genomo dydis < 400M, su ref-genomu, rekomenduojamas WGS |
| Genomo dydis ≤ 1G, 100K žymų ir 10X | ||
| 1G ≤ Genomo dydis ≤ 2G, 200K žymos ir 10X | ||
| Genomo dydis > 2G, 300K žymos ir 10X | ||
| WGS-GWAS | Mėginio skaičius ≥200 | 10X už kiekvieną mėginį |
3. Medžiagos parinkimas
Įvairios veislės, porūšiai, žemės rasės / genų bankai / mišrios šeimos / laukiniai ištekliai
Įvairios veislės, porūšiai, landrasai
Pusės brolio šeima / pilna brolio šeima / laukiniai ištekliai
4. Bioinformacijos analizė
● Viso genomo asociacijos analizė
● Reikšmingo SNP analizė ir atranka
● Kandidato geno funkcinė anotacija
5. Aptarnavimo darbų eiga
Eksperimento dizainas
Mėginio pristatymas
RNR ekstrahavimas
Bibliotekos statyba
Sekos nustatymas
Duomenų analizė
Paslaugos po pardavimo
a.QC fenotipas
Dažnio pasiskirstymo histograma
Fenotipo statistika
b.Asociacijos analizė (modelis: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ siužetas
Manheteno siužetas
| Metai | Žurnalas | IF | Pavadinimas |
| 2022 m | NC | 17.69 val | Medžio bijūno Paeonia ostii giga-chromosomų ir giga-genomo genominis pagrindas |
| 2015 m | NP | 7.43 | Prijaukinimo pėdsakai įtvirtina sojų pupelių agronominės svarbos genominius regionus |
| 2018 m | MP | 9.32 | Viso pasaulinio rapsų kolekcijos genomo pakartotinis sekvenavimas atskleidžia jų ekotipo skirtumų genetinį pagrindą |
| 2022 m | HR | 7.29 | Genomo masto asociacijos analizė suteikia molekulinių įžvalgų apie natūralų arbūzo sėklų dydžio kitimą |
