● Didelė patirtis: BMK buvo apdorota daugiau nei 200 000 mėginių, apimančių įvairius mėginių tipus, įskaitant ląstelių kultūrą, audinius, kūno skysčius ir kt., o uždaryta daugiau nei 7 000 mRNA-Seq projektų, apimančių įvairias tyrimų sritis.
● Griežta kokybės kontrolės sistema: norint gauti aukštos kokybės rezultatus, pagrindiniai kokybės kontrolės taškai, atliekant visus etapus, įskaitant mėginių paruošimą, bibliotekos paruošimą, sekos nustatymą ir bioinformatiką, yra atidžiai stebimi.
● Galimos kelios duomenų bazės funkcijų anotavimo ir praturtinimo tyrimams, kad būtų pasiekti įvairūs tyrimo tikslai.
● Paslaugos po pardavimo: Po pardavimo paslaugos galioja 3 mėnesius po projekto užbaigimo, įskaitant projekto stebėjimą, trikčių šalinimą, rezultatų klausimus ir atsakymus ir kt.
biblioteka | Sekos nustatymo strategija | Rekomenduojami duomenys | Kokybės kontrolė |
Poli A praturtintas | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85 % |
Nukleotidai:
Konc. (ng/μl) | Kiekis (μg) | Grynumas | Sąžiningumas |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ant gelio rodomas ribotas baltymų ar DNR užterštumas arba jo nėra. | Augalams: RIN≥6,5; Gyvūnams: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; ribotas arba jo nėra |
Audinys: Svoris (sausas):≥1 g
*Audiniams, kurių svoris mažesnis nei 5 mg, rekomenduojame siųsti greitai užšaldytą (skystame azotu) audinių mėginį.
Ląstelių suspensija:Ląstelių skaičius = 3×106- 1 × 107
*Rekomenduojame siųsti šaldytą ląstelių lizatą.Jei tų ląstelių skaičius mažesnis nei 5×105.
Kraujo mėginiai:Tūris≥1 ml
Mikroorganizmas:Masė ≥ 1 g
Talpykla: 2 ml centrifugos mėgintuvėlis (Alavo folija nerekomenduojama)
Mėginio ženklinimas: Grupė+pakartojimas pvz. A1, A2, A3;B1, B2, B3.....
Siuntimas:
Bioinformatika
Eukariotas mRNR sekos analizės darbo eiga
Bioinformatika
ØNeapdorotų duomenų kokybės kontrolė
ØEtaloninis genomo derinimas
ØNuorašo struktūros analizė
ØIšraiškos kiekybinis įvertinimas
ØDiferencialinės išraiškos analizė
ØFunkcijų anotacija ir praturtinimas
1.mRNR duomenų prisotinimo kreivė
2.Diferencialinės išraiškos analizė-Vulkano brėžinys
3.KEGG anotacija ant DEG
4.GO klasifikacija pagal DEG