Produktai

DNR/RNR sekvenavimas – nanoporų sekvenavimo įrenginys

DNR/RNR sekos nustatymas – Nanopore Sequencer Featured vaizdas

ONT sekos nustatymas yra vienos molekulės realaus laiko elektrinių signalų sekos nustatymo technologija, pagrįsta nanoporomis, kiekvienos platformos sekos nustatymo principas yra vienodas.Dvigubos grandinės DNR/RNR prisijungs prie nanoporinio baltymo, įterpto į bioplėvelę ir išsivyniojančio po motorinio baltymo švinu, veikiant įtampos skirtumui iš abiejų bioplėvelės pusių, DNR/RNR grandinės pereina per nanoporinio kanalo baltymą tam tikru momentu. norma.Dėl skirtingų DNR/RNR grandinės bazių cheminių savybių skirtumų, kai viena bazė ar DNR molekulė praeina per nanoporų kanalą, tai sukels skirtingų elektrinių signalų pasikeitimą.Aptikus ir atitinkančius šiuos signalus, galima apskaičiuoti atitinkamus bazinius tipus ir užbaigti sekos aptikimą realiuoju laiku.

Susisiekite su mumis

Paslaugos informacija

Demo rezultatas

Paslaugos informacija Funkcijos

Platforma	Bibliotekos dydis	Teorinė duomenų išeiga (vienoje ląstelėje)	Vieno pagrindo tikslumas	Programos
Nanoporas	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNR-PGR	70-90 Gb / mobilusis	85–92 proc.	SV iškvietimas, de novo, viso ilgio sekos nustatymas, Iso-Seq, genų anotacija, DNR metilinimo aptikimas

Paslaugos privalumai

● Daugiau nei 5 metų patirtis naudojant PacBio sekos nustatymo platformą su tūkstančiais uždarytų projektų su įvairiomis rūšimis.
● BMKGENE yra oficialus Oxford Nanopore partneris, turintis dvigubos platformos RNR/DNR sertifikatą.
● Yra pagrindinių sekvencerių modelių su visa įranga ir pakankamu sekos pralaidumu.
● Remiantis Nanopore platforma, daugiau nei 10 gyvūnų ir augalų Denovo tyrimų buvo paskelbti tarptautiniu mastu žinomuose žurnaluose.

Pavyzdiniai reikalavimai

Mėginio tipas

Suma

Koncentracija (Qubit®)

Apimtis

Grynumas

Kiti

Genominė DNR

Priklauso nuo duomenų reikalavimų

≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Skaidri smailė ties 260 nm, nėra užteršimo

Koncentraciją reikia matuoti pagal Qubit ir Qubit/Nanopore ≤ 2

Bendra RNR

≥1,2 μg

≥100μg/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；jokio užteršimo

RIN reikšmė ≥7,5

Paslaugos darbo eiga

Mėginio paruošimas

Bibliotekos statyba

Sekos nustatymas

Duomenų analizė

Projekto pristatymas

Ankstesnis: DNR/RNR sekvenavimas – Illumina Sequencer

Kitas: Specifinio lokuso sustiprintų fragmentų seka (SLAF-Seq)

DNR mėginio duomenų kokybės įvertinimas

1 lentelė. Švarių duomenų statistika.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	CleanSumBase	švarusN50Len	švarusN90Len	cleanMeanLen	CleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1 218 239	26.37 val	1 121 736	25.90	28 014	15 764	23 090	143 181	9

RNR mėginio duomenų kokybės įvertinimas

1 lentelė. Švarių duomenų statistika.

Failo pavadinimas	Kliento ID	Skaitytas skaičius	Bazinis skaičius	N50	Vidutinis Ilgis	Didžiausias ilgis	Vidutinis Q balas
RNA_BMK001	C2	8 947 708	4 047 230 083	398	452	129 227	Q12