BMKMANU S1000 erdvinis transkriptas
BMKMANU S1000 erdvinio transkripto techninė schema
BMKMANU S1000 privalumai
1) Ląstelinė skiriamoji geba: kiekvienoje fiksavimo srityje buvo daugiau nei 2 milijonai erdvinių brūkšninio kodo dėmių, kurių skersmuo buvo 2,5 µm, o atstumas tarp dėmių centrų buvo 5 µm, todėl buvo galima atlikti erdvinę transkripto analizę su tarpląsteline skiriamąja geba (5 µm).
2) Kelių lygių skyros analizė: lanksti kelių lygių analizė, svyruojanti nuo 100 μm iki 5 μm, siekiant nustatyti įvairias audinių savybes esant optimaliai skyrai.
3) Išsamus transkripto profiliavimas: nuorašai, užfiksuoti iš viso audinio skaidrės, gali būti analizuojami, neribojant tikslinių genų skaičiaus ir tikslinės srities.
Paslaugos specifikacijos
| biblioteka | Sekos nustatymo strategija | Rekomenduojama duomenų išvestis |
| S1000 cDNR biblioteka | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/pavyzdys |
Pavyzdiniai reikalavimai
| Pavyzdys | Skaičius | Dydis | RNR kokybė |
| UŠT įterptųjų audinių blokada | 2-3 blokai/ mėginys | apytiksliai6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
Norėdami gauti daugiau informacijos apie pavyzdžių paruošimo gaires ir aptarnavimo darbo eigą, nedvejodami kreipkitės į aBMKGENE ekspertas
Aptarnavimo darbų eiga
Eksperimento dizainas
Mėginio pristatymas
Išankstinis eksperimentas
Erdvinis brūkšninis kodavimas
Bibliotekos statyba
Sekos nustatymas
Duomenų analizė
Paslaugos po pardavimo
BMKMANU S1000 sugeneruoti duomenys analizuojami naudojant BMKGENE savarankiškai sukurtą programinę įrangą „BSTMatrix“, įskaitant:
1) Genų ekspresijos matricos generavimas
2) HE vaizdo apdorojimas
3) Suderinamas su paskesne trečiųjų šalių programine įranga analizei
4) Internetinis „BSTViewer“ padeda gauti vizualizacijos rezultatus skirtingomis raiškomis.
1.Taškų grupavimas
2.Erdvinis pasiskirstymas
Npastaba: Rezoliucijalygis=13 (100 µm, paliko); 7 (50 µm, teisingai)
3. Žymeklio išraiškos gausos klasterizacijos šilumos žemėlapis
4.Tarp imčių duomenų analizė
