● Galimos kelios sekos nustatymo strategijos skirtingiems tyrimo tikslams
● Visas bakterijų genomas su 0 Gap garantuotas.
● Didelė bakterijų genomo surinkimo patirtis, surinkta daugiau nei 10 000 viso genomo.
● Profesionali techninės pagalbos komanda po pardavimo, tenkinanti konkretesnius tyrimų poreikius.
Sekos nustatymasStrategija | biblioteka | Kokybė garantuota | Numatomas apsisukimo laikas |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanoporas 20K PE150 | 0 tarpas | 30 dienų |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● Neapdorotų duomenų kokybės kontrolė
● Genomo surinkimas
● Genomo komponentų analizė
● Genų funkcijos anotacija
● Lyginamoji genomo analizė
DėlDNR ekstraktai:
Mėginio tipas | Suma | Koncentracija | Grynumas |
DNR ekstraktai | > 2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Audinių mėginiams:
Mėginio tipas | Rekomenduojamas mėginio apdorojimas | Mėginių saugojimas ir siuntimas |
Bakterijos | Stebėkite bakterijas mikroskopu ir surinkite bakterijas jų eksponentinėje fazėje Bakterijų kultūrą (kuriame yra maždaug 3-4,5e9 ląstelės) perkelkite į 1,5 arba 2 ml eppendorf.(Laikykite ant ledo) Centrifuguokite mėgintuvėlį 1 minutę esant 14 000 g, kad surinktumėte bakterijas ir atsargiai pašalintumėte supernatantą Uždarykite mėgintuvėlį ir užšaldykite bakterijas skystame azote mažiausiai 30 min.Vamzdelį laikykite -80 ℃ šaldytuve. | Mėginius užšaldykite skystame azote 3-4 valandas ir laikykite skystame azote arba -80 laipsnių temperatūroje iki ilgalaikės rezervacijos.Būtinas pavyzdinis siuntimas su sausu ledu. |
1. Bakterijų genomo cirkas
2.Kodavimo genų numatymas
3. Lyginamoji genomikos analizė: filogenetinis medis