ຜະລິດຕະພັນ

ການຈັດລໍາດັບ RNA ແກນດຽວ

ຮູບພາບທີ່ແນະນໍາການຈັດລໍາດັບ RNA nucleus ດຽວ

ຄວາມກ້າວຫນ້າຂອງການຈັບເຊນດຽວແລະເຕັກນິກການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດສ່ວນບຸກຄົນປະສົມປະສານກັບລໍາດັບທີ່ສົ່ງຜ່ານສູງຊ່ວຍໃຫ້ການສຶກສາການສະແດງອອກຂອງ gene ບົນພື້ນຖານຂອງເຊນຕໍ່ເຊນ.ມັນຊ່ວຍໃຫ້ການວິເຄາະລະບົບທີ່ເລິກເຊິ່ງແລະຄົບຖ້ວນກ່ຽວກັບປະຊາກອນຈຸລັງທີ່ສັບສົນ, ເຊິ່ງສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນຫຼີກເວັ້ນການຫນ້າກາກຂອງ heterogeneity ຂອງພວກມັນໂດຍການເອົາຄ່າສະເລ່ຍຂອງຈຸລັງທັງຫມົດ.

ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ບາງຈຸລັງບໍ່ເຫມາະສົມທີ່ຈະສ້າງເປັນ suspension ຈຸລັງດຽວ, ສະນັ້ນວິທີການກະກຽມຕົວຢ່າງອື່ນໆ - ການສະກັດເອົານິວເຄລຍຈາກເນື້ອເຍື່ອ, ນັ້ນແມ່ນ, ນິວເຄລຍໄດ້ຖືກສະກັດໂດຍກົງຈາກເນື້ອເຍື່ອຫຼືຈຸລັງແລະກະກຽມເຂົ້າໄປໃນ suspension ນິວເຄລຍດຽວສໍາລັບການດຽວ. ການຈັດລໍາດັບຈຸລັງ.

BMK ໃຫ້ບໍລິການຈັດລຽງລຳດັບ RNA ເຊລດຽວຕາມ 10× Genomics ChromiumTM.ການບໍລິການນີ້ໄດ້ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນການສຶກສາກ່ຽວກັບການສຶກສາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບພະຍາດ, ເຊັ່ນ: ຄວາມແຕກຕ່າງຂອງຈຸລັງພູມຕ້ານທານ, ການສ້າງເນື້ອງອກ, ການພັດທະນາເນື້ອເຍື່ອ, ແລະອື່ນໆ.

ຊິບຖອດຂໍ້ຄວາມຂະໜາດກວ້າງໃຫຍ່: 10× Genomics

ເວທີ: Illumina NovaSeq Platform

ຕິດຕໍ່ພວກເຮົາ

ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຊີວະວິທະຍາ

ຜົນການສາທິດ

ຫຼັກການດ້ານວິຊາການ

ການໂດດດ່ຽວຂອງນິວເຄລຍແມ່ນບັນລຸໄດ້ໂດຍ 10 × Genomics ChromiumTM, ເຊິ່ງປະກອບດ້ວຍລະບົບ microfluidics ແປດຊ່ອງທີ່ມີການຂ້າມສອງເທົ່າ.ໃນລະບົບນີ້, ລູກປັດເຈນທີ່ມີບາໂຄດແລະ primer, enzymes ແລະແກນດຽວແມ່ນ encapsulated ໃນການຫຼຸດລົງນ້ໍາມັນຂະຫນາດ nanoliter, ສ້າງ Gel Bead-in-Emulsion (GEM).ເມື່ອ GEM ຖືກສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນ, lysis ຈຸລັງແລະການປ່ອຍ barcodes ແມ່ນປະຕິບັດໃນແຕ່ລະ GEM.mRNA ຖືກຖອດຖອນຄືນເປັນໂມເລກຸນ cDNA ດ້ວຍ 10× barcodes ແລະ UMI, ເຊິ່ງຂຶ້ນກັບການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະໝຸດຕາມລຳດັບມາດຕະຖານ.

ເນື້ອເຍື່ອບໍ່ເໝາະສົມສຳລັບການກະກຽມການລະງັບເຊລດຽວ

ຈຸລັງ / ຈຸລັງ	ເຫດຜົນ
ເນື້ອເຍື່ອແຊ່ແຂງທີ່ບໍ່ສົດ	ບໍ່ສາມາດຮັບເອົາອົງການຈັດຕັ້ງທີ່ສົດໆ ຫຼື ປະຢັດມາດົນໄດ້
ຈຸລັງກ້າມເນື້ອ, ເມກາຄາຣີໂອໄຊ, ໄຂມັນ…	ເສັ້ນຜ່າສູນກາງຂອງເຊນໃຫຍ່ເກີນໄປທີ່ຈະເຂົ້າໄປໃນເຄື່ອງມື
ຕັບ…	ອ່ອນເພຍເກີນໄປທີ່ຈະແຕກ, ບໍ່ສາມາດຈໍາແນກຈຸລັງດຽວ
ເຊລ neuron, ສະໝອງ…	ມີຄວາມອ່ອນໄຫວຫຼາຍ, ງ່າຍຕໍ່ຄວາມກົດດັນ, ຈະປ່ຽນແປງຜົນການລໍາດັບ
ຕ່ອມໄທລອຍ...	ອຸດົມສົມບູນໃນ enzymes endogenous, ຜົນກະທົບຕໍ່ການຜະລິດຂອງ suspension ຈຸລັງດຽວ

Single-nucleus vs Single-cell

ແກນດ່ຽວ	ເຊລດຽວ
ເສັ້ນຜ່າສູນກາງຂອງເຊນບໍ່ຈໍາກັດ	ເສັ້ນຜ່າສູນກາງຂອງເຊນ: 10-40 μm
ວັດສະດຸສາມາດເປັນເນື້ອເຍື່ອ frozen	ວັດສະດຸຕ້ອງເປັນເນື້ອເຍື່ອສົດ
ຄວາມກົດດັນຕ່ໍາຂອງຈຸລັງແຊ່ແຂງ	ການປິ່ນປົວດ້ວຍເອນໄຊອາດເຮັດໃຫ້ເກີດປະຕິກິລິຍາຄວາມກົດດັນຂອງເຊນ
ບໍ່ ຈຳ ເປັນຕ້ອງເອົາເມັດເລືອດແດງອອກ	ເມັດເລືອດແດງຈໍາເປັນຕ້ອງຖືກໂຍກຍ້າຍ
ນິວເຄຼຍສະແດງໃຫ້ເຫັນຂໍ້ມູນຊີວະພາບ	ຈຸລັງທັງຫມົດສະແດງຂໍ້ມູນຊີວະພາບ