genome
ການປະກອບຂະໜາດຂອງໂຄໂມໂຊມ ແລະ ການວິເຄາະຂອງພືດຊີວະມວນ Miscanthus lutarioriparius genome
ລໍາດັບ Nanopore |ອິລູມີນາ |Hi-C |RNA-sequencing |Phylogeny
ໃນການສຶກສານີ້, Biomarker Technologies ໄດ້ສະຫນອງການສະຫນັບສະຫນູນດ້ານວິຊາການກ່ຽວກັບລໍາດັບ Nanopore, de novo genome assembly, Hi-C assisted assembling, ແລະອື່ນໆ.
ບົດຄັດຫຍໍ້
Miscanthusເປັນໄມ້ຢືນຕົ້ນ rhizomatous, ມີທ່າແຮງທີ່ດີສໍາລັບການຜະລິດພະລັງງານຊີວະພາບສໍາລັບຊີວະມວນສູງແລະຄວາມທົນທານຕໍ່ຄວາມກົດດັນ.ພວກເຮົາລາຍງານການປະກອບ chromosome-scale ຂອງMiscanthus lutarioripariusgenome ໂດຍການລວມເອົາລໍາດັບ Oxford Nanopore ແລະເຕັກໂນໂລຢີ Hi-C.ການປະກອບ 2.07-Gb ກວມເອົາ 96.64% ຂອງ genome, ມີ contig N50 ຂອງ 1.71 Mb.ລຳດັບ centromere ແລະ telomere ແມ່ນປະກອບເຂົ້າກັນສຳລັບທັງໝົດ 19 ໂຄໂມໂຊມ ແລະ ໂຄໂມໂຊມ 10, ຕາມລໍາດັບ.ຕົ້ນກຳເນີດຂອງ Allotetraploid ຂອງ M. lutarioriparius ໄດ້ຖືກຢືນຢັນໂດຍໃຊ້ດາວທຽມ centromeric repeats.ໂຄງສ້າງ genome tetraploid ແລະການຈັດລຽງ chromosomal ຫຼາຍອັນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ sorghum ແມ່ນສະແດງໃຫ້ເຫັນຢ່າງຊັດເຈນ.Tandem genes duplicate ຂອງM. lutarioripariusມີປະໂຫຍດບໍ່ພຽງແຕ່ໃນເງື່ອນໄຂທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕອບສະຫນອງຄວາມກົດດັນ, ແຕ່ການສັງເຄາະຂອງກໍາແພງເຊນ.ຄອບຄົວພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕໍ່ຕ້ານພະຍາດ, biosynthesis ກໍາແພງຫີນຂອງເຊນແລະການຂົນສົ່ງ ion ໂລຫະແມ່ນການຂະຫຍາຍຕົວຢ່າງຫຼວງຫຼາຍແລະພັດທະນາ.ການຂະຫຍາຍຕົວຂອງຄອບຄົວເຫຼົ່ານີ້ອາດຈະເປັນພື້ນຖານ genomic ທີ່ສໍາຄັນສໍາລັບການເສີມຂະຫຍາຍລັກສະນະທີ່ໂດດເດັ່ນຂອງM. lutarioriparius.
ສະຖິຕິທີ່ສໍາຄັນຂອງການປະກອບ genome
ຮູບ.ພາບລວມຂອງການປະກອບ genome M. lutarioriparius
ຂ່າວແລະຈຸດເດັ່ນ ມີຈຸດປະສົງເພື່ອແບ່ງປັນກໍລະນີທີ່ປະສົບຜົນສໍາເລັດຫລ້າສຸດກັບ Biomarker Technologies, ເກັບກໍາຜົນສໍາເລັດທາງວິທະຍາສາດໃຫມ່ເຊັ່ນດຽວກັນກັບເຕັກນິກທີ່ໂດດເດັ່ນທີ່ໃຊ້ໃນລະຫວ່າງການສຶກສາ.
ເວລາປະກາດ: 05-05-2022