ການວິເຄາະ Eukaryotic mRNA (ມີເອກະສານອ້າງອີງ)
ອີງຕາມຂໍ້ມູນລໍາດັບ genome ແລະຄໍາບັນຍາຍທີ່ຮູ້ຈັກ, ການຜະລິດໃຫມ່ຂອງຂໍ້ມູນລໍາດັບ throughput ສູງ (RNA-Seq) ຖືກນໍາໃຊ້ເປັນການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ແລະສະຖານທີ່ການຖອດຂໍ້ຄວາມໃຫມ່ (gene ໃຫມ່) ແລະເຫດການ splicing ການປ່ຽນແປງໃຫມ່ໄດ້ຖືກລະບຸ.ການຈັດລໍາດັບການປະເມີນຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນ;sequencing ຂໍ້ມູນແລະການຈັດລໍາດັບຂອງ genome ອ້າງອິງທີ່ເລືອກ, ການກໍານົດຂອບເຂດຂອງ exon / intron, ການວິເຄາະ splicing variant ຂອງ gene, ການສໍາຫຼວດພາກພື້ນ gene ແລະ transcripts ໃຫມ່, ການກໍານົດສະຖານທີ່ SNP ຂອງພາກພື້ນ transcribed, ເຂດແດນລະຫວ່າງ 3' ແລະ 5. ' genes, ແລະຄໍາອະທິບາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດແລະການວິເຄາະຄວາມອຸດົມສົມບູນຂອງຕົວຢ່າງທີ່ແຕກຕ່າງກັນ (ກຸ່ມ).
RNAs ທີ່ບໍ່ໄດ້ເຂົ້າລະຫັດຍາວ
RNAs ທີ່ບໍ່ແມ່ນລະຫັດຍາວ (lncRNA) ແມ່ນປະເພດຂອງການຖອດຂໍ້ຄວາມທີ່ມີຄວາມຍາວຫຼາຍກວ່າ 200 nt, ເຊິ່ງບໍ່ສາມາດຂຽນລະຫັດໂປຣຕີນໄດ້.ຫຼັກຖານສະສົມຊີ້ໃຫ້ເຫັນວ່າສ່ວນໃຫຍ່ຂອງ lncRNAs ມີແນວໂນ້ມທີ່ຈະເປັນປະໂຫຍດຫຼາຍ.ເທກໂນໂລຍີການຈັດລໍາດັບທີ່ຜ່ານທາງຜ່ານສູງແລະເຄື່ອງມືການວິເຄາະທາງຊີວະພາບຊ່ວຍໃຫ້ພວກເຮົາເປີດເຜີຍລໍາດັບ lncRNA ແລະຂໍ້ມູນການຈັດຕໍາແຫນ່ງຢ່າງມີປະສິດທິພາບແລະນໍາພາພວກເຮົາໃຫ້ຄົ້ນພົບ lncRNAs ທີ່ມີຫນ້າທີ່ກົດລະບຽບທີ່ສໍາຄັນ.BMKCloud ມີຄວາມພູມໃຈທີ່ຈະໃຫ້ແພລະຕະຟອມການວິເຄາະລໍາດັບ lncRNA ຂອງລູກຄ້າຂອງພວກເຮົາເພື່ອບັນລຸການວິເຄາະ lncRNA ໄວ, ເຊື່ອຖືໄດ້ແລະມີຄວາມຍືດຫຍຸ່ນ.
ການຈັດລຳດັບ amplicon 16S/18S/ITS
ແພລະຕະຟອມການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີແມ່ນພັດທະນາໂດຍມີປະສົບການຫຼາຍປີໃນການວິເຄາະໂຄງການຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຈຸລິນຊີ, ເຊິ່ງປະກອບດ້ວຍການວິເຄາະພື້ນຖານມາດຕະຖານແລະການວິເຄາະສ່ວນບຸກຄົນ: ການວິເຄາະພື້ນຖານກວມເອົາເນື້ອໃນການວິເຄາະຕົ້ນຕໍຂອງການຄົ້ນຄວ້າຈຸລິນຊີໃນປະຈຸບັນ, ເນື້ອໃນການວິເຄາະແມ່ນອຸດົມສົມບູນແລະຄົບຖ້ວນ, ແລະຜົນໄດ້ຮັບການວິເຄາະໄດ້ຖືກນໍາສະເຫນີ. ໃນຮູບແບບຂອງບົດລາຍງານໂຄງການ;ເນື້ອໃນຂອງການວິເຄາະສ່ວນບຸກຄົນແມ່ນມີຄວາມຫລາກຫລາຍ.ຕົວຢ່າງສາມາດເລືອກໄດ້ແລະຕົວກໍານົດການສາມາດກໍານົດໄດ້ຕາມຄວາມຍືດຫຍຸ່ນຂອງບົດລາຍງານການວິເຄາະພື້ນຖານແລະຈຸດປະສົງການຄົ້ນຄວ້າ, ເພື່ອຮັບຮູ້ຄວາມຕ້ອງການສ່ວນບຸກຄົນ.ລະບົບປະຕິບັດການ Windows, ງ່າຍດາຍແລະໄວ.
Shotgun Metagenomics (NGS)
ຂໍ້ມູນ Metagenomic ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອວິເຄາະວັດສະດຸພັນທຸກໍາປະສົມທີ່ສະກັດຈາກຕົວຢ່າງສິ່ງແວດລ້ອມ, ເຊິ່ງໃຫ້ຂໍ້ມູນລະອຽດກ່ຽວກັບຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງຊະນິດພັນແລະຄວາມອຸດົມສົມບູນ, ໂຄງສ້າງປະຊາກອນ, ຄວາມສໍາພັນທາງ phylogenetic, genes ທີ່ເປັນປະໂຫຍດ, ແລະເຄືອຂ່າຍຄວາມສໍາພັນກັບປັດໃຈສິ່ງແວດລ້ອມ.
NGS-WGS(Illumina/BGI)
ທໍ່ການວິເຄາະປະສົມປະສານທີ່ສ້າງຂຶ້ນສໍາລັບຜູ້ຊ່ຽວຊານດ້ານການຄົ້ນຄວ້າໂດຍບໍ່ມີຄວາມຮູ້ທາງດ້ານຊີວະວິທະຍາກ່ອນແລະດໍາເນີນການຢູ່ໃນເຄື່ອງແມ່ຂ່າຍທີ່ມີປະສິດຕິພາບສູງ.ມັນອໍານວຍຄວາມສະດວກໃຫ້ສໍາເລັດຢ່າງໄວວາຂອງວຽກງານເຊັ່ນ: ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນ, ການຈັດລໍາດັບລໍາດັບ, ການກວດສອບການປ່ຽນແປງ SNP/InDel/SV, ຄໍາບັນຍາຍ, ແລະ gene mutation.
GWAS
ການນໍາໃຊ້ວິທີການສະຖິຕິສະເພາະ, ການວິເຄາະ GWAS ມີຈຸດປະສົງເພື່ອເປີດເຜີຍການປ່ຽນແປງຂອງ genome-wide nucleotide ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຄວາມແຕກຕ່າງ phenotypic.ມັນມີບົດບາດສໍາຄັນໃນການສໍາຫຼວດພັນທຸກໍາທີ່ມີປະໂຫຍດທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບພະຍາດຂອງມະນຸດທີ່ສັບສົນແລະລັກສະນະທີ່ສັບສົນໃນພືດແລະສັດ.
BSA
ແພລະຕະຟອມການວິເຄາະປະສົມປະສານສະຫນອງການໂຕ້ຕອບທີ່ເປັນມິດກັບຜູ້ໃຊ້ສໍາລັບການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍທີ່ເປັນມາດຕະຖານແລະສ່ວນບຸກຄົນ.ການວິເຄາະ BSA ກ່ຽວຂ້ອງກັບການລວມເອົາບຸກຄົນທີ່ມີລັກສະນະ phenotypic ຮ້າຍແຮງຈາກປະຊາກອນທີ່ແຍກກັນ.ໂດຍການປຽບທຽບຈຸດທີ່ແຕກຕ່າງລະຫວ່າງຕົວຢ່າງທີ່ລວມກັນ, ວິທີການນີ້ກໍານົດຕົວກໍານົດໂມເລກຸນທີ່ເຊື່ອມຕໍ່ຢ່າງໃກ້ຊິດທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບພັນທຸກໍາເປົ້າຫມາຍ.ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນການສ້າງແຜນທີ່ທາງພັນທຸກໍາຂອງພືດແລະສັດ, ມັນເປັນເຄື່ອງມືທີ່ມີຄຸນຄ່າສໍາລັບການປັບປຸງພັນທີ່ມີເຄື່ອງຫມາຍການຊ່ວຍເຫຼືອແລະຕໍາແຫນ່ງຂອງພັນທຸກໍາ.
ພັນທຸ ກຳ ວິວັດທະນາການ
ມັນເປັນຂັ້ນຕອນການວິເຄາະປະສົມປະສານທີ່ຖືກອອກແບບມາສໍາລັບຜູ້ຊ່ຽວຊານດ້ານການຄົ້ນຄວ້າທີ່ມີຄວາມຊໍານານດ້ານຊີວະວິທະຍາທີ່ຈໍາກັດ.ການໃຊ້ປະສົບການອັນກວ້າງຂວາງຂອງ BMKGENE ໃນໂຄງການວິວັດທະນາການທາງພັນທຸກໍາ, ເວທີນີ້ເຮັດວຽກຢູ່ໃນເຊີບເວີທີ່ມີປະສິດທິພາບສູງ, ຮັບປະກັນການປະຕິບັດການວິເຄາະສ່ວນບຸກຄົນຢ່າງໄວວາແລະຊັດເຈນ.ວຽກງານເຫຼົ່ານີ້ກວມເອົາວຽກງານເຊັ່ນ: ການກໍ່ສ້າງຕົ້ນໄມ້ phylogenetic, ການວິເຄາະຄວາມບໍ່ສົມດຸນຂອງການເຊື່ອມໂຍງ, ການປະເມີນຄວາມຫຼາກຫຼາຍທາງພັນທຸກໍາ, ການກໍານົດກວາດຄັດເລືອກ, ການວິເຄາະພີ່ນ້ອງ, ການວິເຄາະອົງປະກອບຕົ້ນຕໍ, ແລະລັກສະນະຂອງໂຄງສ້າງປະຊາກອນ.
