ຜະລິດຕະພັນ

DNA/RNA Sequencing – ລໍາດັບ Nanopore

DNA/RNA Sequencing – ຮູບພາບທີ່ແນະນໍາ Nanopor Sequencer

ONT sequencing ເປັນໂມເລກຸນດຽວ ເຕັກໂນໂລຊີການຈັດລໍາດັບສັນຍານໄຟຟ້າໃນເວລາຈິງໂດຍອີງໃສ່ nanopores, ຫຼັກການລໍາດັບຂອງແຕ່ລະເວທີແມ່ນຄືກັນ.DNA/RNA ສອງສາຍຈະຜູກມັດກັບທາດໂປຼຕີນຈາກ nanoporous ທີ່ຝັງຢູ່ໃນ biofilm ແລະ unwinding ພາຍໃຕ້ການນໍາພາຂອງທາດໂປຼຕີນຈາກມໍເຕີ, ພາຍໃຕ້ການປະຕິບັດຂອງຄວາມແຕກຕ່າງກັນແຮງດັນຈາກທັງສອງດ້ານຂອງ biofilm, ສາຍ DNA / RNA ຈະຜ່ານທາດໂປຼຕີນຈາກຊ່ອງ nanopore ໃນສະເພາະໃດຫນຶ່ງ. ອັດຕາ.ເນື່ອງຈາກຄວາມແຕກຕ່າງຂອງຄຸນສົມບັດທາງເຄມີຂອງພື້ນຖານທີ່ແຕກຕ່າງກັນກ່ຽວກັບສາຍ DNA / RNA, ເມື່ອຖານດຽວຫຼືໂມເລກຸນ DNA ຜ່ານຊ່ອງທາງ nanopore, ມັນຈະເຮັດໃຫ້ເກີດການປ່ຽນແປງຂອງສັນຍານໄຟຟ້າທີ່ແຕກຕ່າງກັນ.ໂດຍການກວດສອບແລະສອດຄ້ອງກັບສັນຍານເຫຼົ່ານີ້, ປະເພດພື້ນຖານທີ່ສອດຄ້ອງກັນສາມາດຄິດໄລ່ໄດ້, ແລະການກວດພົບໃນເວລາທີ່ແທ້ຈິງຂອງລໍາດັບສາມາດສໍາເລັດ.

ຕິດຕໍ່ພວກເຮົາ

ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຜົນການສາທິດ

ຄຸນນະສົມບັດລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ເວທີ	ຂະໜາດຫໍສະໝຸດ	ຜົນຜະລິດຂໍ້ມູນທາງທິດສະດີ (ຕໍ່ເຊລ)	ຄວາມຖືກຕ້ອງພື້ນຖານດຽວ	ຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ
ນາໂນປໍ	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Cell	85-92%	ການໂທ SV, De novo, ການຈັດລໍາດັບຄວາມຍາວເຕັມ, Iso-Seq, ຄໍາອະທິບາຍກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາ, ການກວດຫາ DNA methylation

ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ

● ປະສົບການຫຼາຍກວ່າ 5 ປີໃນເວທີການຈັດລໍາດັບ PacBio ກັບໂຄງການປິດຫຼາຍພັນໂຄງການທີ່ມີຊະນິດຕ່າງໆ.
● BMKGENE ເປັນຄູ່ຮ່ວມງານຢ່າງເປັນທາງການຂອງ Oxford Nanopore, ດ້ວຍການຢັ້ງຢືນ RNA/DNA ສອງແພລດຟອມ.
● ມີຕົວແບບຫຼັກຂອງເຄື່ອງລຳດັບທີ່ມີອຸປະກອນຄົບຊຸດ ແລະ ລຳດັບທີ່ພຽງພໍ.
●ໂດຍອີງໃສ່ເວທີ Nanopore, ຫຼາຍກວ່າ 10 ການຄົ້ນຄວ້າສັດແລະພືດ Denovo ໄດ້ຖືກຈັດພີມມາຢູ່ໃນວາລະສານທີ່ມີຊື່ສຽງລະດັບສາກົນ.

ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ

ປະເພດຕົວຢ່າງ

ຈໍານວນ

ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ(Qubit ®)

ປະລິມານ

ຄວາມບໍລິສຸດ

ອື່ນໆ

DNA ພັນທຸ ກຳ

ຂຶ້ນກັບຄວາມຕ້ອງການຂໍ້ມູນ

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5

ສູງສຸດທີ່ຊັດເຈນຢູ່ທີ່ 260 nm, ບໍ່ມີການປົນເປື້ອນ

ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຕ້ອງຖືກວັດແທກດ້ວຍ Qubit ແລະ Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA ທັງໝົດ

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5；ບໍ່ມີການປົນເປື້ອນ

ຄ່າ RIN ≥7.5

ຂະບວນການບໍລິການ

ການກະກຽມຕົວຢ່າງ

ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ

ການຈັດລໍາດັບ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

ການຈັດສົ່ງໂຄງການ

ທີ່ຜ່ານມາ: ການຈັດລໍາດັບ DNA/RNA – ລໍາດັບ Illumina

ຕໍ່ໄປ: ການຈັດລຳດັບ Fragment Amplified Specific-Locus (SLAF-Seq)

ການປະເມີນຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນຂອງຕົວຢ່າງ DNA

ຕາຕະລາງ 1. ສະຖິຕິຂໍ້ມູນສະອາດ.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	CleanSeqNum	CleanSumBase	CleanN50Len	CleanN90Len	CleanMeanLen	CleanMaxLen	CleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

ການປະເມີນຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນຂອງຕົວຢ່າງ RNA

ຕາຕະລາງ 1. ສະຖິຕິຂໍ້ມູນສະອາດ.

ຊື່ເອກະສານ	ClientID	ອ່ານເລກ	ເລກຖານ	N50	ຄວາມຍາວສະເລ່ຍ	ຄວາມຍາວສູງສຸດ	ຄະແນນ MeanQ
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	ຄໍາຖາມທີ 12