BMKCloud Log in
条形ປ້າຍໂຄສະນາ-03

ຜະລິດຕະພັນ

Illumina ແລະ BGI

ເທກໂນໂລຍີການຈັດລໍາດັບ Illumina, ອີງໃສ່ Sequencing ໂດຍ Synthesis (SBS), ເປັນນະວັດຕະກໍາ NGS ທີ່ໄດ້ຮັບການຍອມຮັບໃນທົ່ວໂລກ, ຮັບຜິດຊອບສໍາລັບການສ້າງຫຼາຍກວ່າ 90% ຂອງຂໍ້ມູນລໍາດັບຂອງໂລກ.ຫຼັກການຂອງ SBS ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຖ່າຍຮູບ fluorescently labeled reversible terminators ຍ້ອນວ່າແຕ່ລະ dNTP ໄດ້ຖືກເພີ່ມ, ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນ cleaved ເພື່ອອະນຸຍາດໃຫ້ການລວມຕົວຂອງຖານຕໍ່ໄປ.ດ້ວຍ dNTPs terminator-bound ທີ່ປີ້ນກັບກັນທັງສີ່ທີ່ມີຢູ່ໃນແຕ່ລະຮອບວຽນລໍາດັບ, ການແຂ່ງຂັນແບບທໍາມະຊາດຈະຫຼຸດຜ່ອນຄວາມລໍາອຽງໃນການປະກອບ.ເທັກໂນໂລຍີອະເນກປະສົງນີ້ສະໜັບສະໜຸນທັງຫ້ອງສະໝຸດແບບອ່ານດຽວ ແລະແບບຄູ່, ສະໜອງໃຫ້ຫຼາຍຊະນິດຂອງແອັບພລິເຄຊັນ genomic.ຄວາມສາມາດໃນການສົ່ງຂໍ້ມູນສູງຂອງ Illumina sequencing ແລະຄວາມແມ່ນຍໍາຂອງການຈັດວາງມັນເປັນພື້ນຖານສໍາຄັນໃນການຄົ້ນຄວ້າ genomics, ການສ້າງຄວາມເຂັ້ມແຂງໃຫ້ນັກວິທະຍາສາດເພື່ອແກ້ໄຂຄວາມຊັບຊ້ອນຂອງ genomes ດ້ວຍລາຍລະອຽດແລະປະສິດທິພາບທີ່ບໍ່ກົງກັນ.

DNBSEQ, ພັດທະນາໂດຍ BGI, ແມ່ນເຕັກໂນໂລຢີ NGS ທີ່ມີນະວັດຕະກໍາອີກອັນຫນຶ່ງທີ່ໄດ້ຄຸ້ມຄອງເພື່ອຫຼຸດຜ່ອນຄ່າໃຊ້ຈ່າຍໃນລໍາດັບແລະເພີ່ມການສົ່ງຕໍ່.ການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ DNBSEQ ກ່ຽວຂ້ອງກັບການແບ່ງແຍກ DNA, ການກະກຽມ ssDNA ແລະການຂະຫຍາຍວົງມົນເພື່ອໃຫ້ໄດ້ DNA nanoballs (DNB).ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ສິ່ງເຫຼົ່ານີ້ຖືກໂຫຼດໃສ່ພື້ນຜິວແຂງ ແລະຖືກຈັດລຽງຕາມລຳດັບໂດຍການສັງເຄາະ Probe-Anchor ປະສົມປະສານ (cPAS).

ບໍລິການຈັດລຽງລຳດັບຫ້ອງສະໝຸດທີ່ສ້າງຂຶ້ນກ່ອນຂອງພວກເຮົາໄດ້ອຳນວຍຄວາມສະດວກໃຫ້ແກ່ລູກຄ້າໃນການກະກຽມຫ້ອງສະໝຸດການຈັດລຳດັບຂອງເຂົາເຈົ້າຈາກແຫຼ່ງຕ່າງໆ (mRNA, genome ທັງໝົດ, amplicon, ແລະອື່ນໆ).ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ຫ້ອງສະຫມຸດເຫຼົ່ານີ້ສາມາດຖືກສົ່ງໄປຫາສູນລໍາດັບຂອງພວກເຮົາສໍາລັບການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບແລະການຈັດລໍາດັບໃນເວທີ Illumina ຫຼື BGI.


ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຜົນການສາທິດ

ຄຸນ​ລັກ​ສະ​ນະ

ເວທີ:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten ແລະ BGI-DNB-T7

ຮູບແບບການຈັດລໍາດັບ:PE50, PE100, PE150, PE250

ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງຫ້ອງສະຫມຸດກ່ອນທີ່ຈະຈັດລໍາດັບ

ການຈັດລໍາດັບການຈັດສົ່ງຂໍ້ມູນແລະ QC:ການຈັດສົ່ງບົດລາຍງານ QC ແລະຂໍ້ມູນດິບໃນຮູບແບບ fastq ຫຼັງຈາກ demultiplexing ແລະການກັ່ນຕອງ Q30 ອ່ານ.

 

ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ

Versatility ຂອງ​ການ​ບໍ​ລິ​ການ Sequencing​:ລູກ​ຄ້າ​ອາດ​ຈະ​ເລືອກ​ທີ່​ຈະ​ຈັດ​ລໍາ​ດັບ​ໂດຍ​ເສັ້ນ​ທາງ​, flow cell ຫຼື​ຈໍາ​ນວນ​ຂອງ​ຂໍ້​ມູນ​.

ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງເວທີ:ຫ້ອງສະຫມຸດ DNB ສາມາດຖືກໂອນໄປຫາເວທີ Illumina

ປະ​ສົບ​ການ​ຢ່າງ​ກວ້າງ​ຂວາງ​ໃນ​ເວ​ທີ​ການ​ຈັດ​ລໍາ​ດັບ Illumina​:ກັບຫລາຍພັນໂຄງການປິດທີ່ມີຊະນິດຕ່າງໆ. 

ການຈັດສົ່ງບົດລາຍງານ QC ລໍາດັບ:ມີ metrics ຄຸນະພາບ, ຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງຂໍ້ມູນແລະການປະຕິບັດໂດຍລວມຂອງໂຄງການລໍາດັບ.

ຂະບວນການຈັດລໍາດັບຜູ້ໃຫຍ່:ດ້ວຍ​ເວ​ລາ​ທີ່​ສັ້ນ​.

ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຢ່າງເຂັ້ມງວດ: ພວກເຮົາປະຕິບັດຄວາມຕ້ອງການ QC ທີ່ເຄັ່ງຄັດເພື່ອຮັບປະກັນການຈັດສົ່ງຜົນໄດ້ຮັບທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ.

ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ*

ການຈັດລຳດັບເສັ້ນທາງບາງສ່ວນ

ຈຳນວນຂໍ້ມູນ (X)

ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ (qPCR/nM)

ປະລິມານ

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 ມລ

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 ມລ

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 ມລ

ເສັ້ນທາງດຽວ (Illumina)

ເວທີ

ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ (qPCR/nM)

ປະລິມານ

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 ມລ

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 ມລ

NovaSeq 6000 S4

≥ 1.5 nM

≥ 25 ມລ

NovaSeq X

≥ 1.5 nM

≥ 25 ມລ

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1.5 nM

≥ 25 ມລ

 ນອກເຫນືອໄປຈາກຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນແລະຈໍານວນທັງຫມົດ, ຮູບແບບສູງສຸດທີ່ເຫມາະສົມແມ່ນຍັງຕ້ອງການ.

 

ກະລຸນາຕິດຕໍ່ພວກເຮົາຖ້າຕົວຢ່າງຂອງທ່ານບໍ່ກົງກັບຄວາມຕ້ອງການວັດສະດຸເລີ່ມຕົ້ນ.

ຂະບວນການບໍລິການ

ການກະກຽມຕົວຢ່າງ

ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຫ້ອງສະຫມຸດ

ການຈັດລໍາດັບ

ການຈັດລໍາດັບ

ການ​ວິ​ເຄາະ​ຂໍ້​ມູນ

ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນ

ຕົວຢ່າງ QC

ການຈັດສົ່ງໂຄງການ


  • ທີ່ຜ່ານມາ:
  • ຕໍ່ໄປ:

  • ບົດລາຍງານ QC ຂອງຫ້ອງສະຫມຸດ

    ບົດ​ລາຍ​ງານ​ກ່ຽວ​ກັບ​ຄຸນ​ນະ​ພາບ​ຂອງ​ຫ້ອງ​ສະ​ຫມຸດ​ແມ່ນ​ສະ​ຫນອງ​ໃຫ້​ກ່ອນ​ທີ່​ຈະ​ຈັດ​ລໍາ​ດັບ​, ການ​ປະ​ເມີນ​ຈໍາ​ນວນ​ຫ້ອງ​ສະ​ຫມຸດ​, ແລະ​ການ​ແບ່ງ​ແຍກ​.

     

    ການຈັດລໍາດັບບົດລາຍງານ QC

     

    ຕາຕະລາງ 1. ສະຖິຕິກ່ຽວກັບຂໍ້ມູນລໍາດັບ.

    ID ຕົວຢ່າງ

    BMKID

    ອ່ານດິບ

    ຂໍ້ມູນດິບ (bp)

    ການອ່ານທີ່ສະອາດ (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    ຮູບ 1. ການແຈກຢາຍຄຸນນະພາບຕາມການອ່ານໃນແຕ່ລະຕົວຢ່າງ

    A9

    ຮູບທີ 2. ການແຈກຢາຍເນື້ອຫາພື້ນຖານ

    A10

    ຮູບ 3. ການແຜ່ກະຈາຍຂອງເນື້ອໃນທີ່ອ່ານຢູ່ໃນລໍາດັບຂໍ້ມູນ

    A11

     

    ໄດ້ຮັບໃບສະເໜີລາຄາ

    ຂຽນຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານທີ່ນີ້ແລະສົ່ງໃຫ້ພວກເຮົາ

    ສົ່ງຂໍ້ຄວາມຂອງເຈົ້າຫາພວກເຮົາ: