●ເວທີ:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten ແລະ BGI-DNB-T7
●ຮູບແບບການຈັດລໍາດັບ:PE50, PE100, PE150, PE250
●ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງຫ້ອງສະຫມຸດກ່ອນທີ່ຈະຈັດລໍາດັບ
●ການຈັດລໍາດັບການຈັດສົ່ງຂໍ້ມູນແລະ QC:ການຈັດສົ່ງບົດລາຍງານ QC ແລະຂໍ້ມູນດິບໃນຮູບແບບ fastq ຫຼັງຈາກ demultiplexing ແລະການກັ່ນຕອງ Q30 ອ່ານ.
●Versatility ຂອງການບໍລິການ Sequencing:ລູກຄ້າອາດຈະເລືອກທີ່ຈະຈັດລໍາດັບໂດຍເສັ້ນທາງ, flow cell ຫຼືຈໍານວນຂອງຂໍ້ມູນ.
●ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງເວທີ:ຫ້ອງສະຫມຸດ DNB ສາມາດຖືກໂອນໄປຫາເວທີ Illumina
●ປະສົບການຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນເວທີການຈັດລໍາດັບ Illumina:ກັບຫລາຍພັນໂຄງການປິດທີ່ມີຊະນິດຕ່າງໆ.
●ການຈັດສົ່ງບົດລາຍງານ QC ລໍາດັບ:ມີ metrics ຄຸນະພາບ, ຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງຂໍ້ມູນແລະການປະຕິບັດໂດຍລວມຂອງໂຄງການລໍາດັບ.
●ຂະບວນການຈັດລໍາດັບຜູ້ໃຫຍ່:ດ້ວຍເວລາທີ່ສັ້ນ.
●ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຢ່າງເຂັ້ມງວດ: ພວກເຮົາປະຕິບັດຄວາມຕ້ອງການ QC ທີ່ເຄັ່ງຄັດເພື່ອຮັບປະກັນການຈັດສົ່ງຜົນໄດ້ຮັບທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ.
ຈຳນວນຂໍ້ມູນ (X) | ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ (qPCR/nM) | ປະລິມານ |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 ມລ |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 ມລ |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 ມລ |
ເວທີ | ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ (qPCR/nM) | ປະລິມານ |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 ມລ |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 ມລ |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 ມລ |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 ມລ |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 ມລ |
ນອກເຫນືອໄປຈາກຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນແລະຈໍານວນທັງຫມົດ, ຮູບແບບສູງສຸດທີ່ເຫມາະສົມແມ່ນຍັງຕ້ອງການ.
ບົດລາຍງານກ່ຽວກັບຄຸນນະພາບຂອງຫ້ອງສະຫມຸດແມ່ນສະຫນອງໃຫ້ກ່ອນທີ່ຈະຈັດລໍາດັບ, ການປະເມີນຈໍານວນຫ້ອງສະຫມຸດ, ແລະການແບ່ງແຍກ.
ຕາຕະລາງ 1. ສະຖິຕິກ່ຽວກັບຂໍ້ມູນລໍາດັບ.
ID ຕົວຢ່າງ | BMKID | ອ່ານດິບ | ຂໍ້ມູນດິບ (bp) | ການອ່ານທີ່ສະອາດ (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
ຮູບ 1. ການແຈກຢາຍຄຸນນະພາບຕາມການອ່ານໃນແຕ່ລະຕົວຢ່າງ
ຮູບທີ 2. ການແຈກຢາຍເນື້ອຫາພື້ນຖານ
ຮູບ 3. ການແຜ່ກະຈາຍຂອງເນື້ອໃນທີ່ອ່ານຢູ່ໃນລໍາດັບຂໍ້ມູນ