1) ຄວາມລະອຽດຂອງເຊນຍ່ອຍ: ແຕ່ລະບ່ອນທີ່ຈັບໄດ້ມີ >2 ລ້ານຈຸດທີ່ມີບາໂຄດທາງກວ້າງຂວາງທີ່ມີເສັ້ນຜ່າສູນກາງ 2.5 µm ແລະໄລຍະຫ່າງ 5 µm ລະຫວ່າງຈຸດສູນກາງ, ເຮັດໃຫ້ມີການວິເຄາະການຖອດຂໍ້ຄວາມທາງກວ້າງຂວາງດ້ວຍຄວາມລະອຽດຂອງຍ່ອຍ (5 µm).
2) ການວິເຄາະຄວາມລະອຽດຫຼາຍລະດັບ: ການວິເຄາະຫຼາຍລະດັບທີ່ມີຄວາມຍືດຫຍຸ່ນຕັ້ງແຕ່ 100 μm ຫາ 5 μm ເພື່ອແກ້ໄຂລັກສະນະຕ່າງໆຂອງເນື້ອເຍື່ອທີ່ມີຄວາມຫລາກຫລາຍໃນຄວາມລະອຽດທີ່ດີທີ່ສຸດ.
3) ຂໍ້ມູນການຖອດຂໍ້ຄວາມແບບຄົບວົງຈອນ: ການຖອດຂໍ້ຄວາມຈາກແຜ່ນສະໄລ້ເນື້ອເຍື່ອທັງໝົດສາມາດວິເຄາະໄດ້, ໂດຍບໍ່ຈຳກັດຈຳນວນຂອງພັນທຸກຳເປົ້າໝາຍ ແລະພື້ນທີ່ເປົ້າໝາຍ.
ຫໍສະໝຸດ | ຍຸດທະສາດການຈັດລໍາດັບ | ແນະນຳໃຫ້ສົ່ງຂໍ້ມູນອອກ |
S1000 cDNA ຫ້ອງສະຫມຸດ | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb / ຕົວຢ່າງ |
ຕົວຢ່າງ | ເລກ | ຂະໜາດ | ຄຸນະພາບ RNA |
ຕັນເນື້ອເຍື່ອຝັງ OCT | 2-3 ຕັນ / ຕົວຢ່າງ | ປະມານ.6.8x6.8x6.8 ມມ3 | RIN≥7 |
ສໍາລັບລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບການແນະນໍາການກະກຽມຕົວຢ່າງແລະຂະບວນການການບໍລິການ, ກະລຸນາສົນທະນາກັບ aຜູ້ຊ່ຽວຊານ BMKGENE
ຂໍ້ມູນທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍ BMKMANU S1000 ຖືກວິເຄາະໂດຍໃຊ້ຊອບແວ “BSTMatrix”, ເຊິ່ງຖືກອອກແບບເອກະລາດໂດຍ BMKGENE, ລວມທັງ:
1) gene expression matrix generation
2) HE ການປະມວນຜົນຮູບພາບ
3) ເຂົ້າກັນໄດ້ກັບ downstream ຊອບແວພາກສ່ວນທີສາມສໍາລັບການວິເຄາະ
4) "BSTViewer" ອອນໄລນ໌ຊ່ວຍໃຫ້ໄດ້ຮັບຜົນໄດ້ຮັບການເບິ່ງເຫັນໃນຄວາມລະອຽດທີ່ແຕກຕ່າງກັນ.
1.ການຈັດກຸ່ມຈຸດ
2.ການແຜ່ກະຈາຍທາງພື້ນທີ່
Note: ຄວາມລະອຽດລະດັບ=13 (100 µມ, ຊ້າຍ); 7 (50 µມ, ສິດ)
3.Marker ການສະແດງອອກ abundance clustering heatmap
4.Inter-sample ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ