-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq bitt genombreet Profiléierung vun DNA Ziler fir Histonmodifikatioun, Transkriptiounsfaktoren an aner DNA-assoziéiert Proteinen.Et kombinéiert d'Selektivitéit vu Chromatin-Immunausfäll (ChIP) fir spezifesch Protein-DNA-Komplexen ze recuperéieren, mat der Kraaft vun der nächster Generatioun Sequencing (NGS) fir High-Throughput-Sequenzéierung vun der erholl DNA.Zousätzlech, well d'Protein-DNA Komplexe vu liewegen Zellen erholl ginn, kënne Bindungsplazen a verschiddenen Zellarten a Stoffer vergläicht ginn, oder ënner verschiddene Konditiounen.Uwendungen reichen vun transkriptionaler Reguléierung bis Entwécklungsweeër bis Krankheetsmechanismen an doriwwer eraus.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
Metagenomic Sequencing -NGS
Metagenome bezitt sech op eng Sammlung vum ganzen genetesche Material vun enger gemëschter Gemeinschaft vun Organismen, wéi zum Beispill Ëmwelt-Metagenom, mënschlecht Metagenom, etc..Metagenomesch Sequenzéierung ass e molekulare Tool dat benotzt gëtt fir déi gemëschte genomesch Materialien aus Ëmweltproben extrahéiert ze analyséieren, déi detailléiert Informatioun iwwer Speziesdiversitéit an Heefegkeet, Bevëlkerungsstruktur, phylogenetesch Bezéiung, funktionell Genen a Korrelatiounsnetz mat Ëmweltfaktoren ubitt.
Plattform:Illumina NovaSeq Plattform
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics ass e molekulare Tool dat benotzt gëtt fir déi gemëschte genomesch Materialien aus Ëmweltproben ze analyséieren, déi detailléiert Informatioun iwwer Arten Diversitéit an Heefegkeet, Bevëlkerungsstruktur, phylogenetesch Bezéiung, funktionell Genen a Korrelatiounsnetz mat Ëmweltfaktoren, etc. zu metagenomesche Studien.Seng aussergewéinlech Leeschtung an der Lieslängt huet gréisstendeels downstream metagenomesch Analyse verbessert, besonnesch metagenome Assemblée.D'Virdeeler vun der Lieslängt ze huelen, Nanopore-baséiert metagenomesch Studie ass fäeg méi kontinuéierlech Assemblée ze erreechen am Verglach mat Shot-gun Metagenomics.Et gouf publizéiert datt Nanopore-baséiert Metagenomik erfollegräich komplett a zougemaach bakteriell Genome vu Mikrobiome generéiert huet (Moss, EL, et. al.Natur Biotech, 2020)
Plattform:Nanopore PromethION P48
-
Ganz Genom Bisulfit Sequenzéierung
DNA Methylatioun op der fënnefter Positioun am Zytosin (5-mC) huet e fundamentalen Afloss op Genausdrock an Zellaktivitéit.Abnormal Methylatiounsmuster si mat verschiddene Konditiounen a Krankheeten verbonne ginn, wéi Kriibs.WGBS ass de Goldstandard ginn fir Genom-breet Methylatioun bei enger eenzeger Basisopléisung ze studéieren.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
Assay fir Transposase-Accessible Chromatin mat High Throughput Sequencing (ATAC-seq)
ATAC-seq ass eng High-Throughput Sequenzéierungsmethod fir d'Analyse vun der Genom-breet Chromatin Accessibilitéit, wat wichteg ass fir déi global epigenetesch Kontroll vum Genausdrock.Sequencing Adapter ginn an oppe Chromatinregiounen duerch hyperaktiv Tn5 Transposase agebaut.No PCR Amplifikatioun gëtt eng Sequenzéierungsbibliothéik konstruéiert.All déi oppe Chromatinregiounen kënnen ënner engem spezifesche Raumzäitbedingung kritt ginn, net nëmmen op d'Bindungsplaze vun engem Transkriptiounsfaktor oder enger gewëssener Histon modifizéierter Regioun limitéiert.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
D'Ënnerunitéit op 16S an 18S rRNA déi souwuel héich konservéiert wéi och hypervariabel Regiounen enthält ass e perfekte molekulare Fangerofdrock fir prokaryotesch an eukaryot Organismen Identifikatioun.Profitéiert vun der Sequenzéierung, kënnen dës Amplikone gezielt ginn op Basis vun de konservéierten Deeler an déi hypervariabel Regioune kënne voll charakteriséiert ginn fir mikrobiell Identifikatioun, déi zu Studien bäidroen, déi mikrobiell Diversitéitsanalyse, Taxonomie, Phylogenie, etc. Single-Molekül Echtzäit (SMRT) ) Sequenzéierung vun der PacBio Plattform erméiglecht et héich präzis laang Liesungen ze kréien, déi voll Längt Amplikonen (ongeféier 1,5 Kb) decken kënnen.Déi erweidert Vue vum genetesche Feld huet d'Resolutioun an der Speziesannotatioun an der Bakterien oder der Pilzegemeinschaft staark verbessert.
Plattform:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S / 18S / ITS Amplicon Sequenzéierung zielt fir Phylogenie, Taxonomie an Arten Heefegkeet an enger mikrobieller Gemeinschaft z'entdecken andeems PCR Produkter vun Haushaltsgenetesch Marker ënnersicht ginn déi souwuel héich konverséiert an hypervariabel Deeler enthalen.D'Aféierung vun dëse perfekten molekulare Fangerofdrock vum Woeses et al., (1977) erméiglecht isoléierend Mikrobiomeprofiléierung.Sequencing vun 16S (Bakterien), 18S (Pilze) an intern transkribéiert Spacer (ITS, Fungi) erlaabt Identifikatioun souwuel reichend Arten wéi och selten an onidentifizéierten Arten.Dës Technologie ass e wäit ugewannt a wichtegt Tool ginn fir differenziell mikrobial Zesummesetzung a verschiddenen Ëmfeld z'identifizéieren, sou wéi mënschleche Mond, Darm, Feeën, etc.
Plattform:Illumina NovaSeq Plattform
-
Bakteriell a Pilz ganz Genom Re-Sequencing
Bakteriell a Pilz ganz Genom Re-Sequencing ass e kritescht Tool fir d'Genome vu bekannte Bakterien a Pilze komplett ze maachen, wéi och fir verschidde Genome ze vergläichen oder Genome vun neien Organismen ze kartéieren.Et ass vu grousser Wichtegkeet fir ganz Genome vu Bakterien a Pilze ze sequenzéieren fir präzis Referenzgenome ze generéieren, mikrobiell Identifikatioun an aner komparativ Genomstudien ze maachen.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
PacBio-Full-Length 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Amplicon (16S / 18S / ITS) Plattform ass mat Joeren Erfarung an der mikrobieller Diversitéitsprojetanalyse entwéckelt, déi standardiséierter Basisanalyse a personaliséierter Analyse enthält: Basisanalyse deckt den Mainstream Analyseinhalt vun der aktueller mikrobieller Fuerschung, den Analyseinhalt ass räich an ëmfaassend, an d'Analyseresultater ginn a Form vu Projetsberichter presentéiert;Den Inhalt vun der personaliséierter Analyse ass divers.Echantillon kënnen ausgewielt ginn a Parameteren kënne flexibel no dem Basisanalysebericht a Fuerschungszwecker festgeluecht ginn, fir personaliséiert Ufuerderungen ze realiséieren.Windows Betribssystem, einfach a séier.
-
PacBio-Voll-Längt Transkriptom (Non-Referenz)
Wann Dir Pacific Biosciences (PacBio) Isoform Sequenzéierungsdaten als Input hëlt, ass dës App fäeg Transkriptsequenzen vu voller Längt z'identifizéieren (ouni Versammlung).Andeems Dir voll Längt Sequenzen géint Referenzgenom kartéiert, kënne Transkriptiounen duerch bekannte Genen optimiséiert ginn, Transkriptiounen, Kodéierungsregiounen, asw.Gemeinsam Analyse mat NGS Transkriptom Sequenzéierungsdaten erméiglecht méi ëmfaassend Annotatioun a méi präzis Quantifikatioun am Ausdrock um Transkriptniveau, wat gréisstendeels downstream differentiell Ausdrock a funktionell Analyse profitéiert.
-
Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
DNA Methylatiounsfuerschung war ëmmer e waarmt Thema an der Krankheetsfuerschung, an ass enk verbonne mat Genausdrock a phänotypesche Charakteren.RRBS ass eng korrekt, effizient a wiertschaftlech Method fir DNA Methylatiounsfuerschung.D'Beräicherung vu Promoteur a CpG Inselregiounen duerch enzymatesch Spaltung (Msp I), kombinéiert mat Bisulfite Sequenzéierung, bitt héich Opléisung DNA Methylatiounserkennung.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
Prokaryotesch mRNA Sequenzéierung
mRNA Sequencing erméiglecht déi ëmfaassend Profiléierung vun all mRNA Transkriptiounen bannent Zellen ënner spezifesche Bedéngungen.Dës opzedeelen Technologie déngt als e mächtegt Tool, enthüllt komplizéiert Genausdrockprofiler, Genstrukturen a molekulare Mechanismen verbonne mat diverse biologesche Prozesser.Breet ugeholl a fundamental Fuerschung, klinescher Diagnostik, an Drogenentwécklung, mRNA Sequencing bitt Abléck an d'Intricacies vun der cellulärer Dynamik a genetescher Reguléierung.Eis prokaryotesch mRNA Probe Veraarbechtung ass fir prokaryotesch Transkriptomen ugepasst, involvéiert rRNA Ausarmung a Richtungsbibliothéik Virbereedung.
Plattform: Illumina NovaSeq X
