BMKCloud Log in
条形banner-03

Neiegkeeten

Nanopore-baséiert Volllängt Transkriptom Sequencing

Nanopore Sequenzéierung ënnerscheet sech vun anere Sequenzéierungsplattformen, an datt d'Nukleotiden direkt ouni DNA Synthese gelies ginn a laang Liesungen op zéng Kilobasen generéieren.Dëst erméiglecht direkt Ausliesen vu voller Längt Transkriptiounen an unzegoen d'Erausfuerderunge bei transkriptomesche Studien.

√ Niddereg Sequenzspezifesch Bias

√ Volllängt Liesung vu cDNA fir Genstrukturstudien

√ Manner Daten erfuerderlech fir déiselwecht Unzuel vun Transkriptiounen ze decken

√ Identifikatioun vu multiple Isoformen pro Gen

√ Ausdrockquantifikatioun op Isoformniveau

nanopore-1

Typesch Bioinformatik Pipeline

Volllängt-trans-bix-1024x254

Déi lescht erfollegräich Fäll mat Biomarker Technologien

1. Vergläichend Analyse vu Volllängt Transkriptome verroden Gnetum luofuense Stamm Entwécklungsdynamik

Journal: Frontiers in Genetics

Verëffentlecht: Mäerz 2021

Schlësselwieder: MinION |Alternativ Splicing |APA |lncRNA |Differenziell ausgedréckt Transkriptiounen

Voll Text liesen

2. Unidirektional Bewegung vu klenge RNAs vu Schéissen op Wuerzelen an interspezifesche Heterograften

Journal: Natur Planzen

Verëffentlecht: Januar 2021

Schlësselwieder: Nanopore |Illumina |Volllängt mobil mRNA Detektioun

3. Volllängt Transkriptom Analyse vu Spargelwurzelen weist de molekulare Mechanismus vun der Salztoleranz, déi duerch arbuskulär Mykorrhizal Pilze induzéiert gëtt

Journal: Ëmwelt- an Experimentell Botanik

Verëffentlecht: Januar 2021

Schlësselwieder: MinION |Differenziell ausgedréckte Transkriptiounen |Transkriptiounsfaktoren |Alternativ Splicing

4. Physiologesch charakteristesch Verännerungen a Volllängt Transkriptom vu Rose (Rosa chinensis) Wuerzelen a Blieder als Äntwert op Dréchent Stress

Journal: Plant and Cell Physiology

Verëffentlecht: Okt. 2020

Schlësselwieder: PromethION |Differenziell ausgedréckte Transkriptiounen |Funktionell Viraussoen |Splitter Isoformen |TF an lncRNA

5. Analyse an ëmfaassend Verglach vu PacBio an nanopore-baséiert RNA Sequenzéierung vum Arabidopsis Transkriptom

Journal: Plant Method

Verëffentlecht: Abrëll 2020

Schlësselwieder: GridION |Promethion |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Genom Ausrichtung |Transkript Identifikatioun |Alternativ Splicing |SSR |LncRNA |Isoform Quantifikatioun

Neiegkeeten an Highlights zielt fir déi lescht erfollegräich Fäll mat Biomarker Technologies ze deelen, nei wëssenschaftlech Leeschtungen z'erfëllen souwéi prominent Techniken déi während der Studie applizéiert ginn.


Post Zäit: Jan-08-2022

Schéckt eis Äre Message: