Nanopore-baséiert Volllängt Transkriptom Sequencing
Nanopore Sequenzéierung ënnerscheet sech vun anere Sequenzéierungsplattformen, an datt d'Nukleotiden direkt ouni DNA Synthese gelies ginn a laang Liesungen op zéng Kilobasen generéieren.Dëst erméiglecht direkt Ausliesen vu voller Längt Transkriptiounen an unzegoen d'Erausfuerderunge bei transkriptomesche Studien.
√ Niddereg Sequenzspezifesch Bias
√ Volllängt Liesung vu cDNA fir Genstrukturstudien
√ Manner Daten erfuerderlech fir déiselwecht Unzuel vun Transkriptiounen ze decken
√ Identifikatioun vu multiple Isoformen pro Gen
√ Ausdrockquantifikatioun op Isoformniveau
Typesch Bioinformatik Pipeline
Déi lescht erfollegräich Fäll mat Biomarker Technologien
1. Vergläichend Analyse vu Volllängt Transkriptome verroden Gnetum luofuense Stamm Entwécklungsdynamik
Journal: Frontiers in Genetics
Verëffentlecht: Mäerz 2021
Schlësselwieder: MinION |Alternativ Splicing |APA |lncRNA |Differenziell ausgedréckt Transkriptiounen
Voll Text liesen
2. Unidirektional Bewegung vu klenge RNAs vu Schéissen op Wuerzelen an interspezifesche Heterograften
Journal: Natur Planzen
Verëffentlecht: Januar 2021
Schlësselwieder: Nanopore |Illumina |Volllängt mobil mRNA Detektioun
3. Volllängt Transkriptom Analyse vu Spargelwurzelen weist de molekulare Mechanismus vun der Salztoleranz, déi duerch arbuskulär Mykorrhizal Pilze induzéiert gëtt
Journal: Ëmwelt- an Experimentell Botanik
Verëffentlecht: Januar 2021
Schlësselwieder: MinION |Differenziell ausgedréckte Transkriptiounen |Transkriptiounsfaktoren |Alternativ Splicing
4. Physiologesch charakteristesch Verännerungen a Volllängt Transkriptom vu Rose (Rosa chinensis) Wuerzelen a Blieder als Äntwert op Dréchent Stress
Journal: Plant and Cell Physiology
Verëffentlecht: Okt. 2020
Schlësselwieder: PromethION |Differenziell ausgedréckte Transkriptiounen |Funktionell Viraussoen |Splitter Isoformen |TF an lncRNA
5. Analyse an ëmfaassend Verglach vu PacBio an nanopore-baséiert RNA Sequenzéierung vum Arabidopsis Transkriptom
Journal: Plant Method
Verëffentlecht: Abrëll 2020
Schlësselwieder: GridION |Promethion |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Genom Ausrichtung |Transkript Identifikatioun |Alternativ Splicing |SSR |LncRNA |Isoform Quantifikatioun
Neiegkeeten an Highlights zielt fir déi lescht erfollegräich Fäll mat Biomarker Technologies ze deelen, nei wëssenschaftlech Leeschtungen z'erfëllen souwéi prominent Techniken déi während der Studie applizéiert ginn.
Post Zäit: Jan-08-2022