Neiegkeeten

Transposéierbar Element (TE) Verstäerkung ass unerkannt ginn als dreiwend Kraaft, déi d'Genomgréisst Expansioun an d'Evolutioun vermëttelt, awer d'Konsequenze fir d'Gestaltung vun 3D genomesch Architektur bleiwen gréisstendeels onbekannt a Planzen.Hei berichte mir Referenzgrad Genom Versammlungen fir dräi Aarte vu Koteng, déi dräifach an der Genomgréisst variéieren, nämlechGossypium rotundifolium(K2),G. Arboreum(A2), anG. raimondii(D5), benotzt Oxford Nanopore Technologies.Vergläichend Genom Analysen dokumentéieren d'Detailer vun der Lineage-spezifescher TE Amplifikatioun, déi zu de grousse Genomgréisst Differenzen bäidroen (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), a weisen relativ konservéiert Geninhalt a Synteny Bezéiungen tëscht Genomen.Mir hunn erausfonnt datt ongeféier 17% vun syntenesche Genen de Chromatinstatus änneren tëscht aktiven ("A") an inaktiven ("B") Kompartimenter weisen, an TE-Verstäerkung ass mat der Erhéijung vum Undeel vun A-Kompartiment an Genregiounen verbonnen (~ 7.000 Genen). ) an K2 an A2 par rapport zu D5.Nëmmen 42% vun topologesch assoziéierende Domain (TAD) Grenze goufen ënner den dräi Genome konservéiert.Eis Donnéeë implizéiere rezent Amplifikatioun vun TEs no der Bildung vu Lineage-spezifesche TAD Grenzen.Dës Etude beliicht d'Roll vun transposon-mediéierten Genom Expansioun an der Evolutioun vu méi héijer Uerdnung Chromatin Struktur a Planzen.