GENOME
Chromosomen-Skala Assemblée an Analyse vu Biomass Ernte Miscanthus lutarioriparius Genom
Nanopore Sequencing |Illumina |Hi-C |RNA-Sequenzéierung |Phylogenie
An dëser Etude huet Biomarker Technologies technesch Ënnerstëtzung iwwer Nanopore Sequenzéierung, de novo Genom Assemblée, Hi-C assistéiert Assemblée, etc.
Abstrakt
Miscanthus, eng rhizomatous méijähreg Planz, huet grouss Potenzial fir Bioenergie Produktioun fir seng héich Biomass a Stress Toleranz.Mir Rapport eng chromosome-Skala Assemblée vunMiscanthus lutarioripariusGenom duerch d'Kombinatioun vun Oxford Nanopore Sequenzéierung an Hi-C Technologien.D'2.07-Gb Versammlung deckt 96.64% vum Genom, mat contig N50 vun 1.71 Mb.D'Zentromer- an Telomer-Sequenze gi fir all 19 Chromosomen a Chromosom 10 resp.Allotetraploiden Hierkonft vum M. lutarioriparius gëtt mat centromeresche Satelliten-Wiederholungen bestätegt.D'tetraploid Genom Struktur a verschidde chromosomal Ëmännerunge relativ zu Sorghum si kloer bewisen.Tandem duplizéiert Genen vunM. lutarioripariussinn funktionell beräichert net nëmmen a Begrëffer am Zesummenhang mat der Stressreaktioun, mee Zellmauer Biosynthese.Genfamilljen am Zesummenhang mat Krankheetresistenz, Zellmauerbiosynthese a Metalliontransport si staark erweidert an evoluéiert.D'Expansioun vun dëse Famillen kann eng wichteg genomic Basis fir d'Verbesserung vun bemierkenswäert Spure vunM. lutarioriparius.
Schlëssel Statistike vun Genom Assemblée
Figur.Iwwersiicht vun der M. lutarioriparius Genom Assemblée
Neiegkeeten an Highlights zielt fir déi lescht erfollegräich Fäll mat Biomarker Technologies ze deelen, nei wëssenschaftlech Leeschtungen z'erfëllen souwéi prominent Techniken déi während der Studie applizéiert ginn.
Post Zäit: Jan-05-2022