-
Metagenomic Sequencing (NGS)
Metagenome bezitt sech op eng Sammlung vum ganzen genetesche Material vun enger gemëschter Gemeinschaft vun Organismen, wéi zum Beispill Ëmwelt-Metagenom, Mënsche-Metagenom, etc.. Et enthält Genome vu kultivéierbaren an onkultivéierbare Mikroorganismen.Metagenomesch Sequenzéierung ass e molekulare Tool dat benotzt gëtt fir déi gemëschte genomesch Materialien, déi aus Ëmweltproben extrahéiert ginn, ze analyséieren, déi detailléiert Informatioun iwwer Speziesdiversitéit an Heefegkeet, Bevëlkerungsstruktur, phylogenetesch Bezéiung, funktionell Genen a Korrelatiounsnetz mat Ëmweltfaktoren ubitt.
Plattform:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics ass e molekulare Tool dat benotzt gëtt fir déi gemëschte genomesch Materialien, déi aus Ëmweltproben extrahéiert ginn, ze analyséieren, déi detailléiert Informatioun iwwer Arten Diversitéit an Heefegkeet, Bevëlkerungsstruktur, phylogenetesch Bezéiung, funktionell Genen a Korrelatiounsnetz mat Ëmweltfaktoren, etc. zu metagenomesche Studien.Seng aussergewéinlech Leeschtung an der Lieslängt huet gréisstendeels downstream metagenomesch Analyse verbessert, besonnesch metagenome Assemblée.D'Virdeeler vun der Lieslängt ze huelen, Nanopore-baséiert metagenomesch Studie ass fäeg méi kontinuéierlech Versammlung z'erreechen am Verglach mat Shot-Piston-Metagenomics.Et gouf publizéiert datt Nanopore-baséiert Metagenomik erfollegräich komplett a zougemaach bakteriell Genome vu Mikrobiome generéiert huet (Moss, EL, et. al,Natur Biotech, 2020)
Plattform:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
D'Ënnerunitéit op 16S an 18S rRNA déi souwuel héich konservéiert wéi och hypervariabel Regiounen enthält ass e perfekte molekulare Fangerofdrock fir prokaryotesch an eukaryot Organismen Identifikatioun.Profitéiert vun der Sequenzéierung kënnen dës Amplikone gezielt ginn op Basis vun den konservéierten Deeler an déi hypervariabel Regioune kënne voll charakteriséiert ginn fir mikrobiell Identifikatioun, déi zu Studien bäidroen, déi mikrobiell Diversitéitsanalyse, Taxonomie, Phylogenie, etc. Single-Molekül Echtzäit (SMRT) ) Sequenzéierung vun der PacBio Plattform erméiglecht et héich präzis laang Liesungen ze kréien, déi voll Längt Amplikonen (ongeféier 1,5 Kb) decken kënnen.Déi erweidert Vue vum genetesche Feld huet d'Resolutioun an der Speziesannotatioun an Bakterien oder Pilzegemeinschaft staark verbessert.
Plattform:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S / 18S / ITS Amplicon Sequenzéierung zielt fir Phylogenie, Taxonomie an Arten Heefegkeet an enger mikrobieller Gemeinschaft z'entdecken andeems PCR Produkter vun Haushaltsgenetesch Marker ënnersicht ginn déi souwuel héich konverséiert an hypervariabel Deeler enthalen.D'Aféierung vun dëse perfekten molekulare Fangerofdrock vum Woeses et al., (1977) erméiglecht isoléiertfräi Mikrobiomeprofiléierung.Sequencing vun 16S (Bakterien), 18S (Pilze) an intern transkribéiert Spacer (ITS, Fungi) erlaabt Identifikatioun souwuel reichend Arten wéi och selten an onidentifizéierten Arten.Dës Technologie ass e wäit applizéiert a wichtegt Tool ginn fir differenziell mikrobial Zesummesetzung a verschiddenen Ëmfeld z'identifizéieren, sou wéi mënschleche Mond, Darm, Feeën, asw.
Plattform:Illumina NovaSeq6000
-
Bakteriell a Pilz Ganzen Genom Re-Sequencing
Bakteriell a Pilz ganz Genom Re-Sequencing ass e kritescht Tool fir d'Genome vu bekannte Bakterien a Pilze komplett ze maachen, wéi och fir verschidde Genome ze vergläichen oder Genome vun neien Organismen ze kartéieren.Et ass vu grousser Wichtegkeet fir ganz Genome vu Bakterien a Pilze ze sequenzéieren fir genee Referenzgenome ze generéieren, mikrobiell Identifikatioun an aner komparativ Genomstudien ze maachen.
Plattform: Illumina NovaSeq 6000
-
Pilz Genom
Biomarker Technologies bidden Genom Ëmfro, fein Genom a pene-komplett Genom vu Pilz ofhängeg vum spezifesche Fuerschungsziel.Genom Sequencing, Assemblée a funktionell Annotatioun kënnen erreecht ginn andeems d'nächst Generatioun Sequencing + Drëtt Generatioun Sequencing kombinéiert fir Héichniveau Genom Assemblée z'erreechen.Hi-C Technologie kann och benotzt ginn fir Genom Assemblée um Chromosomniveau ze erliichteren.
Plattform:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakterien Komplett Genom
Biomarker Technologies bitt Sequenzéierungsservice fir de komplette Genom vu Bakterien mat Null Spalt ze bauen.Main Workflow vu Bakterien komplette Genomkonstruktioun enthält Drëtt Generatioun Sequenzéierung, Assemblée, funktionell Annotatioun a fortgeschratt bioinformatesch Analyse déi spezifesch Fuerschungsziler erfëllen.Eng méi ëmfaassend Profiléierung vu Bakteriengenom erméiglecht d'Entdeckung vu fundamentale Mechanismen, déi hir biologesch Prozesser ënnersträichen, wat och e wäertvolle Referenz fir genomesch Fuerschungen a méi héije eukaryotesche Spezies kéint ubidden.
Plattform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
