Genome-breet Association Analyse
1.Service Virdeeler
● Abundant Project Cases: Zënter senger Grënnung am 2009 huet BMKGENE Honnerte vun Artenprojeten an der Populatioun GWAS Fuerschung ofgeschloss, Fuerscher assistéiert fir méi wéi 100 Artikelen ze publizéieren, an de kumulative Impaktfaktor erreecht 500.
● Berufflech Analysten.
● Kuerz Analyse Zyklus.
● Genau Daten Mining.
2. Service Spezifikatioune
| Typ | Populatioun Skala | Sequenzéierungsstrategie an Déift |
| SLAF-GWAS | Prouf Zuel ≥200 | Genom Gréisst <400M, mat Ref-Genom, WGS gëtt recommandéiert |
| Genom Gréisst ≤ 1G, 100K Tags an 10X | ||
| 1G ≤ Genomgréisst ≤ 2G, 200K Tags an 10X | ||
| Genom Gréisst> 2G, 300K Tags an 10X | ||
| WGS-GWAS | Prouf Zuel ≥200 | 10X fir all Prouf |
3. Material Auswiel
Verschidde Varietéiten, Ënnerarten, Landrassen/Genebanken/gemëschte Famillen/wëll Ressourcen
Verschidde Varietéiten, Ënnerarten, Landrassen
Hallefschwëster Famill / Vollschwëster Famill / wëll Ressourcen
4. Bioinformation Analyse
● Genom-breet Associatioun Analyse
● Analyse an Duerchmusterung vun bedeitend SNP
● Funktionell Annotatioun vum Kandidat Gen
5. Service Work Flow
Experimenter Design
Echantillon Liwwerung
RNA Extraktioun
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
a.Phenotyp QC
Frequenzverdeelungshistogramm
Phenotype Statistiken
b.Associatiounsanalyse (Modell: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ Komplott
Manhattan Komplott
| Joer | Journal | IF | Titel |
| 2022 | NC | 17.69 | Genomesch Basis vun de Giga-Chromosomen a Giga-Genom vun der Baumpeonie Paeonia ostii |
| 2015 | NP | 7.43 | Domesticatiounsfootprints verankeren genomesch Regioune vun agronomescher Wichtegkeet a Sojabounen |
| 2018 | MP | 9.32 | Ganz-Genom Resequencing vun enger weltwäiter Sammlung vu Raps-Bäitrëtter weist d'genetesch Basis vun hirer Ökotyp Divergenz |
| 2022 | HR | 7.29 | Genom-breet Associatiounsanalyse bitt molekulare Abléck an déi natierlech Variatioun vun der Waassermeloun Som Gréisst |
