● Héich Experienz: Iwwer 200.000 Echantillon goufen am BMK veraarbecht, déi verschidde Probetypen iwwerdeckt, dorënner Zellkultur, Tissu, Kierperflëssegkeet, etc.. an iwwer 7.000 mRNA-Seq Projeten zougemaach iwwer verschidde Fuerschungsberäicher.
● Strikt Qualitéitskontrollsystem: Core Qualitéitskontrollpunkten duerch all Schrëtt inklusiv Probepräparatioun, Bibliothéikpräparatioun, Sequenzéierung a Bioinformatik sinn ënner enker Iwwerwaachung fir qualitativ héichwäerteg Resultater ze liwweren.
● Multiple Datenbanken verfügbar fir Funktiounsannotatioun a Beräicherungsstudien fir verschidde Fuerschungsziler ze erfëllen.
● After-Sale-Servicer: After-Sale-Servicer gëlteg fir 3 Méint nom Ofschloss vum Projet, inklusiv Projete Suivi, Troubleshooting, Resultater Q&A, etc.
Bibliothéik | Sequenzéierungsstrategie | Daten recommandéiert | Qualitéitskontroll |
Poly A beräichert | Illumina PE150 | 6 gbg | Q30≥85% |
Nukleotiden:
Konzentratioun (ng/μl) | Betrag (μg) | Rengheet | Integritéit |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limitéiert oder keng Protein oder DNA Kontaminatioun op Gel gewisen. | Fir Planzen: RIN≥6,5; Fir Déieren: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitéiert oder keng Basislinn Héicht |
Tissue: Gewiicht (dréchen):≥1 g
* Fir Tissue méi kleng wéi 5 mg, empfeelen mir Flash gefruerene (a flëssege Stickstoff) Tissueprobe ze schécken.
Zell Suspension:Zellzuel = 3×106- 1 × 107
* Mir recommandéieren gefruer Zell lysate ze Schëff.Am Fall wou dës Zell méi kleng zielt wéi 5 × 105.
Bluttprouwen:Volume ≥1 ml
Mikroorganismen:Mass ≥ 1 g
Behälter: 2 ml Zentrifuge Röhre (Zinnfolie ass net recommandéiert)
Probe Etikettéierung: Grupp + replizéieren zB A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Sendung:
Bioinformatik
Eukaryotesch mRNA Sequenzéierungsanalyse Workflow
Bioinformatik
ØMatière Daten Qualitéitskontroll
ØReferenz Genom Ausrichtung
ØTranskript Struktur Analyse
ØAusdrock Quantifikatioun
ØDifferential Ausdrock Analyse
ØFunktioun Annotatioun a Beräicherung
1.mRNA Daten Saturatiounskurve
2.Differential Ausdrock Analyse-Vulkan Komplott
3.KEGG Annotatioun op DEGs
4.GO Klassifikatioun op DEGs