BMKMANU S1000 Spatial Transkriptom
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome Technesch Schema
Virdeeler vun BMKMANU S1000
1) Subzellulär Opléisung: All Erfaassungsberäich enthält> 2 Millioune raimlech Barcoded Flecken mat engem Duerchmiesser vun 2,5 µm an engem Abstand vun 5 µm tëscht Fleckzentren, wat raimlech Transkriptomanalyse mat sub-zellulärer Opléisung (5 µm) erméiglecht.
2) Multi-Level Resolutioun Analyse: Flexibel Multi-Level Analyse rangéiert vun 100 μm bis 5 μm fir verschidde Tissuefunktiounen op optimal Opléisung ze léisen.
3) Comprehensive Transcriptome Profiling: Transkriptiounen, déi aus dem ganze Tissue Rutsch gefaange sinn, kënnen analyséiert ginn, ouni Restriktioun op d'Zuel vun den Zilgenen an den Zilgebitt.
Service Spezifikatioune
| Bibliothéik | Sequenzéierungsstrategie | Donnéeën Output recommandéiert |
| S1000 cDNA Bibliothéik | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb / Echantillon |
Prouf Ufuerderunge
| Prouf | Zuel | Gréisst | RNA Qualitéit |
| OCT Embedded Tissueblock | 2-3 Blocks / Prouf | ca.6,8 x 6,8 x 6,8 mm3 | RIN≥7 |
Fir méi Detailer iwwer Probevirbereedungsleitung a Service Workflow, fillt Iech gratis mat engem ze schwätzenBMKGENE Expert
Service Work Flow
Experimenter Design
Echantillon Liwwerung
Pre-Experiment
Raumbarcoding
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
D'Daten generéiert vum BMKMANU S1000 ginn analyséiert mat der Software "BSTMatrix", déi onofhängeg vum BMKGENE entworf ass, dorënner:
1) Genausdrock Matrix Generatioun
2) HE Bildveraarbechtung
3) Kompatibel mat Downstream Drëtt Partei Software fir Analyse
4) Online "BSTViewer" hëlleft Visualiséierungsresultater bei verschiddene Resolutiounen ze kréien.
1.Spot Clustering
2.Raumverdeelung
Nott: ResolutiounNiveau = 13 (100 µm, lénks); 7 (50 µm, riets)
3.Marker Ausdrock Heefegkeet clustering heatmap
4.Inter-Probe Daten Analyse
