Anno 2021, BMKGENE testatum est 31 De novo genome inquisitione feliciter edita in ephemerides altae incussus cum factores summa impulsus super 320. XV articulorum co-auctoribus 4 ex illis coaetati fuerunt ut primi auctores BMKGENE.
Post initium anni 2022, iam duo articuli investigationis in ephemeride "Genetices" et "Molecular" respective editi sunt.Sunt, "Duo haplotypa divergentia ex lychee lychee valde heterozygoia res domesticas independentes suggerunt pro cultoribus veterum et sero maturitatis" (Investigationes genome lychee, quae per Collegium Horticulturae, Universitatis Agriculturae Australis Sinarum, et cooperatores scientifici, in geneticis naturalibus editi. ) et "genome sequentia quinque sitopsis specierum Aegilopis et origo triticum polyploidis B-subgenome" (Sitopsis species genome quinque, quae a Professore Bao Liu inquisitionis quadrigae Universitatis septentrionalis Normalis.).Hos duos articulos etiam recensebimus et cum lectoribus communicabimus.
Nunc inspiciamus ad praeclaras investigationes articulos in 2021 editis a BMK co-auctoribus, et facultates nostras collaboratas.
Plant Genome — Breakthroughs on multi-species.
1.A summus qualitas genome conventus elucidat secale indoles genomica et agronomically magni momenti genes
Collaboravit Facility: Universitas Agricultural Henan
Acta: Naturalis Genetics
Impact Factor: 38.31
In hoc incepto, genome Weining siliginis, electae Sinicae siliginis varietas, secuta est.Conglobata contigs (7.74 Gb) pro 98.47% magnitudine genome aestimatae (7.86 Gb), cum 93.67% contigorum (7.25 Gb) septem chromosomatum assignata.Repetita elementa 90,31% conglobatae genomae constituuntur.Praeterea analyses Weiningensis conventus novam lucem dabant in duplicatione gene- latis geneticae eorumque impulsum in genes amyli biosynthesis, organisationis physicae complexi loci prolaminarum, lineamenta gene expressiones quae praematurae notae et putativae domesticationis chromosomalis associatae regiones et loci in siligine.Sequentia haec genome promittit se genomica et generandi studia in siligine et segetibus cerealibus accelerare promittit.
2. Rosa sine aculeo: perceptos genomic coniunctum ad humorem adaptationem
Collaborata facilius: Kunming Institutum botanicum, Academia Scientiarum Sinensis
Acta: Scientiae Nationalis Review
Impact Factor: 17.273
In hoc incepto exemplaria 'Basye's Thornless' (BT, aculeo-liberi cultoris Rosae wichuraianae), 'Vetus Blush' (OB, fundator genotypi domestici rosae), collecti sunt eorum F1 bigeneri et BCF1.Et summus qualitas conventus genome referens generatus est ad elementa genetica recognoscenda pertinentia ad aculeos evolutionis derivandos.Magnitudo genome est de 530.6 Mb.Ad comprobandum qualitatem genome conglobatae, analysis sicut tabula genetica comparationis, BUSCO, NGS legit contionem, comparatio cum OB haplotypo, sequens basis errorum rate moderatio et genome-latum LTR Conventus Index valorem perscriptio (LAI=0.03) deductae sunt.Haec investigatio incomplexam hereditatem exemplar et regulatory mechanismum aculei aculei patefacit et fundamentis novisque facultatibus ad studium biologiae rosae et meae figendi hypotheticas cum magnis notis associatis.
3. Whole-Genome Sequence of Synthesized Allopolyploids in Cucumis Reveals Insights into the Genome Evolution of Allopolyploidizationis
Collaboravit Facility: Universitas Agricultural Nanjing
Acta: Scientiae Provectae
Impact Factor: 16.801
Hoc studium rettulit summus qualitas genoma syntheticae allotetraploidis consecutus utens hybridizationis interspecificae inter cucumeris (C. sativus, 2n = 14) et species relativa silvestris (C. hystrix, 2n = 24) et chromosomatum subsequentem duplicationem, quae prima est. plene sequenced synthetica allopolyploid.Synagoga genome applicavit profluvium "PacBio+BioNano+Hi-C+Illuminae" sequentis, quae consecuta est in magnitudine genome 530.8Mb et contiguum N50 = 6.5Mb.Legit 19 pseudochromosomata et subgenomes assignata.Eventus significavit hybridizationem, potius quam duplicationem genome, maiorem genomicarum mutationum tam nuclei quam cp genomes causare.Suadet ut fixam heterozygositatem C.×hytivus auctam accommodationem accentus praebet.Eventus novas perceptiones in evolutionem plantarum polyploidiam praebent et consilium fetum futurum praebent futurum.
4.Comparative Genome Analyses Highlight Transposon Mediatae Genome Expansionis et Architecturae Evolutionis 3D Genomic Folding in Cotton.
Collaboravit facilius: Huazhong University agriculturae
Acta: Biologiae Molecular et Evolutionis
Impact Factor: 16.242
Hoc consilium usus est Nanopore Sequencing ad congregandum genoma trium specierum bombycarum, nempe: Gossypium rotundifolium (K2, magnitudo genome = 2.44Gb, contigN50 = 5.33Mb), G. arboreum (A2, magnitudo genome = 1.62Gb, contigN50 = 11.69Mb), et G. raimondii (D5, genome size = 0.75Gb, contigN50 = 17.04 Gb).Plus 99% omnium trium genomerum per Hi-C convenerunt.Eventus analysis BUSCO sunt 92,5%, 93,9% et 95,4% respective.Omnes hi numeri indicant tres genomes conventus -gradus referuntur.Genome comparativum analyses documenta sunt singula generum specialium TE amplificationis conferens ad magnas differentias genome magnitudinis.Hoc studium in lucem ponit munus expansionis genome transposon mediatae in evolutione chromatinorum structurae altioris ordinis in plantis.
5.Chromosome-scalae conventus et analysis segetis taeterae Miscanthus lutarioriparius genome
Collaboravit Facility: CAS Centre pro Excellence in Plantarum hypotheticarum Scientiarum
Acta: Natura Communicationum
Impact Factor: 14.912
Hoc consilium chromosomaticum conventum Miscanthi lutarioriparii genome retulit, coniungendo Oxoniae Nanopore sequencas et technologias Hi-C.2.07Gb conventus tegit 96.64% genome, cum contig N50 of 1.71 Mb.Circa 94.30% summarum sequentiarum in pseudochromosomata 19 fixa sunt.Per comparationem cum BAC serie, LAI aestimatio, BUSCO aestimatio, re-contio cum NGS data, re-contio transcriptorum notitiarum, genoma aestimabatur ut summus qualitas et continuitas.Allotetraploid origo M. lutarioriparius confirmata est utens satellite centromeric repetit.Tandem gena duplicata M. lutarioriparii functionis locupletata sunt non solum in terminis ad responsionem accentus pertinentibus, sed ad murum cellulae biosynthesis.Gene duplicata probabiliter partes in C4 photosynthesi agunt et cum Miscantho C4 photosynthesi ad frigiditatem temperatam conferunt.Investigatio magni momenti praebuit referentiam ad studium perennium plantarum.
6.A Camptotheca chromosomatum chromosomatum genomatis collecta perspicientia praebet originem evolutionis camptothecini biosynthesis.
Collaboravit Facility: Universitas Sichuan
Acta: Natura Communicationum
Impact Factor: 14.912
Hoc project quale chromoso-gradum C. acuminata genome conventum rettulit, cum magnitudine genome 414.95Mb et contingN50 1.47Mb.Invenimus C. acuminatam experientiam duplicationem toti-genome independentis et numerosam generum ex eo devenire ad biosynthesin camptothecin.Distinctio functionis geneis LAMT et evolutionis positivae duorum SLAS genes, uterque multum contulit ad biosynthesin camptothecin in C. acuminata.Eventus momentum praecipui genome conventus in edendis mutationibus geneticae originis metabolitae secundae evolutionis illustravit.
7.Allele definitae genome ostendit differentiationem biallelic in evolutione cassava
Collaboravit Facility: Seres Academia Scientiarum Agricultural Tropical
Acta: Planta hypothetica
Impact Factor: 13.162
Hoc consilium convenerunt referentiam genome pro cassava cum contigN50 1.1Mb utens Pacifici Biosciences (PacBio) sequens suggestum.Post aestimationem per BUSCO, LAI indicem et tabulam geneticam summus densitatis, genome collectum confirmatur ut gradus referentiae.Regiones redundantes identificatae sunt et contiguae in 18 pseudochromosomata fixa nexus Hi-C utentes.Haec summus qualitas et allelae definitae relatio genomae pro cassava valet ad distinguendos bi-alleles divergentes in chromosomatum homologum, permittens explorare differentiam et expressionem dominatum bi-allelarum earumque evolutionis impulsus vires subiectae.In cassava et aliis fructibus valde heterozygois innovandis facilior fuit.
8.Genomic indagatio celeriter incrementum paulowniarum et formatio scoparum maleficarum paulowniae
Collaboravit Facility: Henan Agricultural university
Acta: Planta hypothetica
Impact Factor: 13.162
Hoc project genus genomae nuclei Paulowniae fortunaei, 511.6 Mb in magnitudine, cum 93.2% sequentium ad 20 pseudochromosomata ancoris convenerunt.Superioris efficientiae photosyntheticae effectum est per C3 photosynthesin integrationem et per iter metabolismi acidum crassulaceanum, quod ad habitum incrementi paulowniae arborum valde celeriter contribuere potest.Additional genome sequens phytoplasma PaWB, cum analysibus functionibus coniuncta, significavit effectorem PaWB-SAP54 directe inter se cohaerere cum Paulownia PfSPLa, quae vicissim degradationem PfSPLa per semitam ubiquitin mediatam facit et ad scoparum maleficarum formationem ducit.Notulae significantes pervestigationes in biologiam paulowniarum ac mechanismum regulatorium formationis PaWB praebebant.
Animal genome - Investigationes altae specierum evolutionis
1. Genus Nautili pompilius evolutionem oculum et biomineralizationem illuminat
Collaborata Facility: Mare Meridionale Sinarum Institutum Oceanologiae, CAS
Acta: Ecologiae Naturalis & evolutionis
Impact Factor: 15.462
Hoc consilium Nautio Pompilio integram genom obtulit.Habet genoma minimalist inter cephalopodas sequentias, quod est 730.58Mb cum contigN50 = 1.1Mb.BUSCO aestimatio evenit 91,31%.Composita cum transcriptomo, proteome, gene familia et phylogenetica analysi, hoc genome fundamentalem comparationem praebebat in novationibus cephalopodis, sicut oculus pinholi et biomineralizationis.Investigatio significavit damnum in botrum gene Hox complementi posse cum putamine evanescenti Molluscorum referri.Importanter, multiplices innovationes genomicas inter damna gene, contractionem independentem et expansionem familiarum generum specialium eorumque retiacula regulatoria adiuncta verisimile evolutionem oculi nautili pinholi formavit.Genome nautilus magnum auxilium constituit ad missiones evolutionis et innovationes genomicas reficiendas quae extant cephalopodas effingunt.
2. Analysis genome Seadragon perspicientia praebet in phaenotypo et sex determinatione loci
Collaborata Facility: Mare Meridionale Sinarum Institutum Oceanologiae, CAS
Acta: Scientiae Provectae
Impact Factor: 14.132
Proiectum hoc de novo-sequente genomes mas et femina communis seadragonis (phyllopteryx taeniolatus) eiusque species propinqua, pipefish alligator (Syngnathoides biaculeatus).Magnitudo genoma Phyllopteryx taeniolatus est ~659 Mb（♂）and ~663 Mb（♀）, cum contigN50 of 10.0Mb et 12.1mb.magnitudo genome pro Phyllopteryx taeniolatus est 637 Mb（♂）and ~648 Mb（♀）, cum contigN50 of 18.0Mb et 21.0Mb.Per analysin phylogeneticam, communis seadragon et alligator pipefish sunt soror genus Syngnathinae, et circa 27.3 Ma olim diverguntur.Profiles transcriptionis ex novitate evolutionis, appendicibus folium similia, ostendunt copia genesis typice in fin evolutionis implicata cooptatas fuisse necnon locupletationem transcriptorum ad textus potentialem reparationem et immunem genesis defensionem.Locus putativus sexus-determinans modum describit gene amhr2y specificae masculinum commune marinum commune et alligator pipefish idem est.Hoc consilium criticum argumentum praebebat studiis evolutionis adaptivae.
Post tempus: Sep-19-2022