Summus throughput genotyping, praesertim in magna multitudine hominum, est gradus fundamentalis in studiis consociationis geneticae, quae praebet geneticam fundamentum inventionis geneticae, analysi evolutionis etc. Pro profundis totius genomae re- sequendae, reductae repraesentationis genome sequen- tionis (RRGS ) introducitur ad minuendum sumptus per sample sequendo, dum rationabilem efficientiam in figmento geneticae inventionis conservant.Hoc fere fit ut fragmentum restrictionis extra ambitus magnitudinis datae, quod redactum repraesentativum bibliothecae nominatur (RRL).Amplificatum fragmentum specifica-locum sequens (SLAF-Seq) consilium de novo SNP inventio auto-evoluta est et SNP genotypum magnarum populorum.
Technical workflow
SLAF nobis RRL modos Existens
commoda SLAF
Superioris figuli geneticae inventionis efficientiam- Cum summus per technologiam sequendi, SLAF-Seq centena milia tags inventa in toto genere ad petitionem variarum investigationum inceptarum implere potuit, sive cum genoma sive sine relatio.
Nativus & flexibilis experimentalis design- Pro diversis investigationis finis seu speciebus, variae concoctionis enzymaticae strategies praesto sunt inter singula enzyme, dual-enzyme et multi-enzyme digestio.Digestio militaris in silico praeaestimabitur ut optimalem enzyme consilium confirmet.
Maximum efficientiam in digestione enzymatica- Concoctio pre- designata enzymatica slafs in chromosomatum aequaliter distributa praebet.Fragmentum collectionis efficientis supra 95% consequi potest.
Vitare repetita serie– CENTESIMA sequentiarum repetitarum in notitia SLAF-Seq ad minus quam 5% reducitur, praesertim in speciebus elementis repetitis egregie, ut triticum, spelte, etc.
Auto-exculta bioinformatic workflow- BMK evolvit integrum bioinformaticum workflui applicabile ad technologiam SLAF-Seq ut firmitatem ac diligentiam finalis output curet.
Applicationem SLAF
Tabula geographica geneticae seriei
Alta densitas tabula genetica constructio et identificatio locorum continentium notarum florum in Chrysanthemo (Chrysanthemum x morifolium Ramat.)
Acta: Inquisitionis Horticulture Published: 2005.7
GWAS
Lepidium sativum generum candidatum cum isofavone contentum in seminibus soybeanis utentibus consociatione genome-lata et serie destinata.
Journal: Plant Journal Published: 2005.08
Genetics Evolutionis
Multitudo analysis genomica et de novo conventu originem evolutionis oryzae revelant sicut ludus evolutionis
Acta: Plantarum Molecularis Published: 2019.5
Mole Segregant Analysis (BSA)
GmST1, quae sulfotransferasin encodes, resistentiam ad virus musivum soybeani intendit G2 et G3 confert.
Journal: Plant, Cell&Environment Published: 2021.04
Reference
Sol X, Liu D, Zhang X, et al.SLAF-Seq: methodus efficiens magnarum de novo SNP inventionis et genotypi utendi summus throughput sequendi [J].Plos unum, 2013, 8(3): e58700
Song X, Xu Y, Gao K, et al.Alta densitas tabula genetica constructio et identificatio locorum continentium notarum florum in Chrysanthemo (Chrysanthemum morifolium Ramat.).Res Hortic.2020; 7:108.
Wu D, Li D, Zhao X, et al.Lepidium sativum generum candidatum cum isoflavone contentum in seminibus soybeanis utentibus consociatione genome-latae et nexu destinata.Plant J. 2020;104 (4): 950-963.
Sol J, Ma D, Tang L, et al.Populatio Genomic Analysis et De Novo Conventus Originem Weedy Rice tamquam Evolutionarium Ludus revela.Mol Plant.2019, 12(5): 632-647.Mol Plant.2018;11 (11): 1360-1376.
Zhao X, Jing Y, Luo Z, et al.GmST1, quae sulfotransferasin encodes, resistentiam ad virus musivum soybeani intendit G2, G3.Plant Cell Environ.2021; 10.1111/pce.14066
Post tempus: Jan-04-2022