Жылуулук картасы суурмасы жылуулук картасын чийүү үчүн колдонулат, ал матрицалык маалыматтарды чыпкалап, нормалдаштырып жана кластерлей алат. Ал көбүнчө ар кандай үлгүлөрдүн ортосундагы ген экспрессия деңгээлин кластердик анализдөө үчүн колдонулат.
NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam сыяктуу тизмектерди маалымат базасына тегиздөө аркылуу FASTA файлындагы ырааттуулуктарга биологиялык функцияларды тиркөө.
BLAST (Негизги Local Alignment Search Tool) – бул окшош биологиялык ырааттуулугу бар аймактарды табуу үчүн алгоритм жана программа.Ал бул тизмектерди ырааттуу маалымат базаларына салыштырат жана статистикалык маанини эсептейт.BLAST ырааттуулугуна жараша төрт түрдүү куралдардан турат: blastn, lastp, blastx жана tblastn.