Чакан РНК секвенциясы-Илюмина
Өзгөчөлүктөрү
● Китепкананы даярдоого чейин РНКнын өлчөмүн тандоо
● Биоинформатикалык анализ миРНКны болжолдоо жана алардын максаттарына негизделген
Кызматтын артыкчылыктары
●Комплекстүү биоинформатика анализи:Белгилүү жана жаңы miRNAларды идентификациялоого, miRNAs максаттарын идентификациялоого жана тиешелүү функционалдык аннотацияга жана бир нече маалымат базалары менен байытууга мүмкүндүк берүүчү (KEGG, GO)
●Катуу сапатты көзөмөлдөө: биз үлгүлөрдү жана китепкананы даярдоодон секвенирлөө жана биоинформатикага чейин бардык этаптарда негизги контролдук пункттарды ишке ашырабыз.Бул кылдат мониторинг ырааттуу жогорку сапаттагы натыйжаларды берүүнү камсыз кылат.
●Сатуудан кийинки колдоо: Биздин милдеттенмебиз 3 айлык сатуудан кийинки тейлөө мөөнөтү менен долбоордун аяктоосунан ашат.Бул убакыттын ичинде, биз натыйжаларга байланыштуу бардык суроолорду чечүү үчүн долбоорлорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү аныктоо боюнча жардам жана суроо-жооп сессияларын сунуштайбыз.
●Extensive Expertise: ар кандай изилдөө чөйрөлөрүндө 100дөн ашык түрдү камтыган бир нече sRNA долбоорлорун ийгиликтүү жабуунун тажрыйбасы менен биздин команда ар бир долбоорго бай тажрыйбаны алып келет.
Үлгү талаптары жана жеткирүү
| Китепкана | Платформа | Сунушталган маалыматтар | Маалымат QC |
| Өлчөм тандалды | Illumina SE50 | 10M-20M окуу | Q30≥85% |
Үлгү талаптары:
Нуклеотиддер:
| Конц.(нг/мкл) | Суммасы (мкг) | Тазалык | актык |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Чектелген же жок белок же ДНК булганышы гелде көрсөтүлгөн. | RIN≥6,5; 5.0≥28S/18S≥1.0; чектелген же негизги бийиктиги жок |
● Өсүмдүктөр:
Тамыр, сабагы же желекчеси: 450 мг
Жалбырак же үрөн: 300 мг
жемиш: 1,2 г
● Жаныбар:
Жүрөк же ичеги: 450 мг
Viscera же мээ: 240 мг
Булчуң: 600 мг
Сөөк, чач же тери: 1,5 г
● муунак буттуулар:
Курт-кумурскалар: 9г
Crustacea: 450 мг
● Толук кан: 2 түтүк
● Клеткалар: 106 клеткалар
● Сыворотка жана плазма:6 мл
Сунушталган үлгү жеткирүү
Контейнер:
2 мл центрифуга түтүгү (калай фольга сунушталбайт)
Үлгү этикеткалоо: Топ+репликация, мисалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Жөнөтүү:
1.Кургак муз: Үлгүлөрдү баштыктарга салып, кургак музга көмүү керек.
2.RNAstable түтүктөр: РНК үлгүлөрүн РНК стабилдештирүү түтүкчөсүндө (мисалы, RNAstable®) кургатып, бөлмө температурасында жөнөтүүгө болот.
Кызматтын иш агымы
Эксперимент дизайны
Үлгү жеткирүү
РНК экстракциясы
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
Биоинформатика
miRNA идентификациясы: түзүлүшү жана тереңдиги
miRNA дифференциалдык экспрессиясы – иеархиялык кластерлөө
Дифференциалдуу экспрессияланган миРНКлардын максаттуу функционалдык аннотациясы
Басылмалардын тандалып алынган жыйнагы аркылуу BMKGene' sRNA секвенирлөө кызматтары көмөк көрсөткөн илимий жетишкендиктерди изилдеңиз.
Чен, H. жана башкалар.(2023) 'Вирустук инфекциялар Panax notoginsengде сапонин биосинтезин жана фотосинтезин ингибирлейт', Өсүмдүктөрдүн физиологиясы жана биохимиясы, 203, б.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Ли, H. жана башкалар.(2023) "FYVE доменин камтыган протеин FREE1 өсүмдүктөрү miRNA биогенезин басуу үчүн микропроцессордук компоненттер менен байланышат", EMBO отчеттору, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Ю, J. жана башкалар.(2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p бир нече эпидермалдык өсүү факторуна окшош домендердин 8-генин (megf8) бал аарысында, Apis mellifera', Эл аралык Молекулярдык илимдер журналы, 24(6), б. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Чжан, М. жана башкалар.(2018) 'МиРНКнын жана эттин сапаты менен байланышкан гендердин комплекстүү анализи Gga-MiR-140-5p тооктун булчуң ичине майдын түшүшүнө таасир этээрин аныктайт', Клеткалык физиология жана биохимия, 46(6), 2421–2433-беттер.doi: 10.1159/000489649.
