Ядролорду обочолонтуу 10 × Genomics ChromiumTM тарабынан ишке ашат, ал кош кайчылаштары бар сегиз каналдуу микрофлюидикалык системадан турат.Бул системада штрих-коддору жана праймери, ферменттери жана бир ядросу бар гель мончоктору нанолитр өлчөмүндөгү май тамчысына капсулдалып, гель мончокторунун эмульсиясын (GEM) пайда кылат.GEM пайда болгондон кийин, ар бир GEMде клетка лизиси жана штрих-коддорунун чыгарылышы жүргүзүлөт.mRNA 10 × штрих-коддор жана UMI менен cDNA молекулаларына тескери транскрипцияланат, алар андан ары стандарттуу секвенирлөө китепканасынын курулушуна дуушар болушат.
Клетка/ткань | Себеп |
Тоңдурулган кыртыштын жаңысын ачыңыз | Жаңы же көптөн бери сакталган уюмдарды алуу мүмкүн эмес |
Булчуң клеткасы, мегакариоцит, май… | Клетканын диаметри аспапка кирүү үчүн өтө чоң |
Боор… | Сынууга өтө морт, жалгыз клеткаларды ажырата албайт |
Нейрон клеткасы, мээ… | Көбүрөөк сезгич, басым жасоо оңой, ырааттуулуктун натыйжаларын өзгөртөт |
Панкреас, калкан… | Бир клетка суспензиясын өндүрүүгө таасир этүүчү эндогендик ферменттерге бай |
Бир ядролуу | Бир клеткалуу |
Чексиз клетка диаметри | Клетканын диаметри: 10-40 мкм |
Материал тоңдурулган кыртыш болушу мүмкүн | Материал жаңы кыртыш болушу керек |
Тоңдурулган клеткалардын төмөн стресси | Фермент менен дарылоо клетканын стресс реакциясын жаратышы мүмкүн |
Эч кандай кызыл кан клеткалары жок кылынышы керек | Кызыл кан клеткаларын алып салуу керек |
Ядролук биоинформацияны билдирет | Бүт клетка биоинформацияны билдирет |
Китепкана | Секвенирлөө стратегиясы | Маалыматтын көлөмү | Үлгү талаптары | Ткань |
10 × Геномикалык бир ядролук китепкана | 10x Genomics -Illumina PE150 | 100 000 окуу/уяча болжол менен.100-200 Гб | Уюлдук номер: >2×105 Клетка конц.700-1200 клетка/мкл | ≥ 200 мг |
Үлгү даярдоо боюнча көрсөтмөлөр жана кызматтын иш процесси боюнча кененирээк маалымат алуу үчүн аBMKGENE эксперти
1.Spot кластерлөө
2.Маркер туюнтмасы молчулук кластердик жылуулук картасы
3.Макер генинин ар кандай кластерлерде бөлүштүрүлүшү
4.Cell траекториясын талдоо/псевдоубакыт