Кыскартылган өкүлчүлүктүү бисульфит ырааттуулугу (RRBS)
Кызмат спецификациялары
Платформа: NovaSeq платформасы, PE150
Китепкана түрү: 200-400bp кыстаруу bisulfite мамиле ДНК китепкана
Ырааттуулук стратегиясы: Paired-End 150 bp
Сунушталган маалымат чыгаруу: 10 Гб чийки маалымат/үлгү
Үлгү талаптары
ДНК саны: ≥ 2ug
ДНК концентрациясы: ≥ 20нг/мкл.
Тазалык: OD260/280 = 1,8 ден 2,0 деградациясы же РНК булгануусу жок
Биоинформатика анализи
Кызматтын иш агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
a.Геномду тегиздөө статистикасына шилтеме
Карта түзүүнүн статистикасы окулат
SС сайтынын секвенирлөө тереңдигинин жана камтуусунун статистикасы
Aтоптолгон камтуу
Dар бир үлгүнүн сиңирүү натыйжалуулугу
b.Метилденген жерди аныктоо
C сайтында метилденүү деңгээлдердин тизмеси
BS конверсиясы
Mэтилленген цитозин
Метилдөө деңгээлин бөлүштүрүү
c.Метилизация картасы
Gэномдук
Gэном элементи
d.Үлгүлөрдүн ортосундагы метилдөө деңгээлин салыштыруу
Pairwise CG метилляциясынын корреляциясы
PCA-CG метилдөө
CCG метилизациясынын жылтылдашы
d.Дифференциалдуу метилденүү анализи
SDMR статистикасы
DMR узундугун бөлүштүрүү
Hкарта жегиле
DМаксаттуу аймакта MR бөлүштүрүү
