-
BSA
Көптөгөн Segregant Analysis платформасы бир кадамдуу стандарттык анализден жана жекелештирилген параметр жөндөөлөрү менен өркүндөтүлгөн анализден турат.BSA тез фенотип менен байланышкан генетикалык маркерлерди аныктоо үчүн колдонулган ыкма болуп саналат.BSAнын негизги иш процесси төмөнкүлөрдү камтыйт: 1. фенотиптери өтө карама-каршы келген инсандардын эки тобун тандоо;2. ДНКнын эки негизги бөлүгүн түзүү үчүн бардык инсандардын ДНКсын, РНКсын же SLAF-секвын (Биомаркер тарабынан иштелип чыккан) бириктирүү;3. шилтеме геномуна каршы же алардын ортосундагы дифференциалдык ырааттуулуктарды аныктоо, 4. ED жана SNP-индекс алгоритми боюнча талапкерге байланышкан аймактарды болжолдоо;5. Талапкер региондордо гендерди функционалдык талдоо жана байытуу, ж.б.. Генетикалык маркердик скрининг жана праймердик дизайн, анын ичинде маалыматтарда дагы өркүндөтүлгөн казып алуу да бар.
-
Ампликон (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) платформасы стандартташтырылган негизги анализди жана жекелештирилген анализди камтыган микробдук ар түрдүүлүк долбоорун талдоодо көп жылдык тажрыйбасы менен иштелип чыккан: негизги анализ учурдагы микробдук изилдөөлөрдүн негизги талдоо мазмунун камтыйт, талдоо мазмуну бай жана ар тараптуу, жана талдоо натыйжалары долбоордун отчеттору түрүндө берилет;Жекелештирилген анализдин мазмуну ар түрдүү.Үлгүлөр тандалып алынышы мүмкүн жана параметрлер жекелештирилген талаптарды ишке ашыруу үчүн негизги талдоо отчетуна жана изилдөө максатына ылайык ийкемдүү белгилениши мүмкүн.Windows операциялык системасы, жөнөкөй жана тез.
-
Эволюциялык генетика
Эволюциялык генетика – бул SNPs, InDels, SVs жана CNVs сыяктуу генетикалык вариациялардын негизинде берилген материалдардын эволюциялык маалыматы боюнча комплекстүү чечмелөөнү камсыз кылуу үчүн иштелип чыккан жыйылган секвенирлөө кызматы.Ал эволюциялык өзгөрүүлөрдү жана популяциялардын генетикалык өзгөчөлүктөрүн, мисалы, популяциянын структурасы, генетикалык көп түрдүүлүк, филогениялык байланыштар ж.б.б.с. сүрөттөө үчүн зарыл болгон бардык фундаменталдык анализди камтыйт. Ошондой эле гендердин агымы боюнча изилдөөлөрдү камтыйт, бул популяциянын эффективдүү санын, дивергенция убактысын баалоого мүмкүнчүлүк берет.
-
Салыштырмалуу геномика
Салыштырмалуу геномика түзмө-түз ар кандай түрлөрдүн толук геном тизмегин жана структураларын салыштырууну билдирет.Бул дисциплина түрлөрдүн эволюциясын, гендин функциясын, гендик жөнгө салуу механизмин геномдун деңгээлинде ар кандай түрлөр боюнча сакталган же дифференцияланган ырааттуулук структураларын жана элементтерин аныктоого багытталган.Салыштырмалуу геномиканын типтүү изилдөөсү гендердин үй-бүлөсүндө, эволюциялык өнүгүүдө, бүт геномдун кайталанышында, тандалма басымда ж.б.
-
Эволюциялык генетика
Популяциялык жана эволюциялык генетикалык анализ платформасы BMK R&D тобунда жылдар бою топтолгон чоң тажрыйбанын негизинде түзүлгөн.Бул өзгөчө биоинформатика боюнча адистиги жок изилдөөчүлөр үчүн колдонуучуга ыңгайлуу курал.Бул платформа эволюциялык генетика менен байланышкан негизги анализди, анын ичинде филогенетикалык дарактарды курууну, байланыштын тең салмаксыздыгын талдоону, генетикалык ар түрдүүлүктү баалоону, тандалма шыпыруу анализин, туугандык анализди, PCA, популяциянын структурасын талдоо ж.
-
Hi-C негизделген Геном Ассамблеясы
Hi-C - жакындыкка негизделген өз ара аракеттешүүнү жана жогорку өтүмдүүлүк секвенирлөөсүн айкалыштыруу аркылуу хромосома конфигурациясын алуу үчүн иштелип чыккан ыкма.Бул өз ара аракеттенүүлөрдүн интенсивдүүлүгү хромосомалардагы физикалык аралыкка терс байланышта деп эсептелет.Ошондуктан, Hi-C маалыматтары чогулган ырааттуулуктарды геномдун долбоорунда топтоого, иретке келтирүүгө жана багыттоого жана аларды белгилүү бир сандагы хромосомаларга бекитүүгө жардам бере алат.Бул технология популяцияга негизделген генетикалык карта жок болгон учурда хромосома деңгээлиндеги геномду түзүүгө мүмкүнчүлүк берет.Ар бир геномго Hi-C керек.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы / DNBSEQ
-
Өсүмдүк/жаныбар De Novo геномунун тизилиши
De Novoсеквенирлөө секвенирлөө технологияларын, мисалы, PacBio, Nanopore, NGS ж.б. колдонуу менен түрдүн бүт геномунун түзүлүшүн билдирет.Үчүнчү муундагы секвенирлөө технологияларынын окуу узундугунун укмуштуудай жакшырышы татаал геномдорду чогултууда жаңы мүмкүнчүлүктөрдү алып келди, мисалы, гетерозиготалуулугу жогору, кайталануучу аймактардын жогорку катышы, полиплоиддер ж.б. кайталануучу элементтерди, анормалдуу GC мазмуну бар аймактарды жана башка өтө татаал аймактарды чечүү.
Платформа: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq Platform
-
Адамдын бүтүндөй экзомасын ырааттуулугу
Бүтүндөй экзома секвенциясы (WES) ооруну пайда кылуучу мутацияларды аныктоо үчүн экономикалык жактан натыйжалуу секвенирлөө стратегиясы катары каралат.Экзондор бүт геномдун болжол менен 1,7% гана ээлегени менен, ал түздөн-түз жалпы протеин функцияларынын профилин билдирет.Адамдын геномунда ооруга байланыштуу мутациялардын 85% дан ашыгы белок коддоочу аймакта кездешет.
BMKGENE ар кандай изилдөө максаттарына жетүү үчүн ар кандай экзон басып алуу стратегиялары менен комплекстүү жана ийкемдүү адамдын бүт экзомасын секвенирлөө кызматтарын сунуш кылат.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Өзгөчө локустун күчөтүлгөн фрагменттеринин тизилиши (SLAF-Seq)
Айрыкча ири масштабдуу популяцияда жогорку өтүмдүү генотиптөө генетикалык ассоциацияны изилдөөдө фундаменталдуу кадам болуп саналат, ал гендердин функционалдык ачылышы, эволюциялык анализ жана башкалар үчүн генетикалык негизди камсыз кылат. ) генетикалык маркерди ачууда акылга сыярлык эффективдүүлүктү сактоо менен бирге, бир үлгүдөгү секвенирлөө наркын минималдаштыруу үчүн киргизилген.Бул, адатта, кыскартылган өкүлчүлүк китепканасы (RRL) деп аталган берилген өлчөмдөр диапазонунда чектөө фрагментин алуу аркылуу жетишилет.Спецификалык локустун күчөтүлгөн фрагменттеринин секвенциясы (SLAF-Seq) бул шилтеме геному бар же болбосо SNP генотиптөө үчүн өз алдынча иштелип чыккан стратегия.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы -
Illumina жана BGI
Синтез боюнча ырааттуулукка (SBS) негизделген Illumina секвенирлөө технологиясы - бул глобалдуу NGS инновациясы, ал дүйнөдөгү секвенирлөө маалыматтарынын 90% ашуунун түзүүгө жооптуу.SBS принциби ар бир dNTP кошулган сайын флуоресценттик белгиленген реверсивдүү терминаторлорду сүрөткө тартууну камтыйт жана андан кийин кийинки базаны кошууга мүмкүндүк берүү үчүн бөлүнөт.Ар бир секвенирлөө циклинде бар болгон бардык төрт кайтуучу терминатор менен байланышкан dNTP менен, табигый атаандаштык инкорпорациянын кыйшаюусун азайтат.Бул универсалдуу технология геномдук колдонмолордун спектрин канааттандыруу үчүн бир окулуучу жана жупташкан китепканаларды да колдойт.Illumina секвенсациясынын жогорку өтүмдүү мүмкүнчүлүктөрү жана тактыгы аны геномикалык изилдөөлөрдүн негизги ташы катары жайгаштырып, илимпоздорго геномдордун татаалдыктарын теңдешсиз детальдар жана эффективдүүлүк менен ачууга мүмкүнчүлүк берет.
BGI тарабынан иштелип чыккан DNBSEQ дагы бир инновациялык NGS технологиясы болуп саналат, ал секвенирлөө чыгымдарын андан ары төмөндөтүүгө жана өткөрүү жөндөмдүүлүгүн жогорулатууга жетишкен.DNBSEQ китепканаларын даярдоо ДНКнын фрагментациясын, ssDNA даярдоону жана ДНК наношарларын (DNB) алуу үчүн айланма чөйрөнү күчөтүүнү камтыйт.Андан кийин булар катуу бетке жүктөлөт жана андан кийин комбинатордук зонд-анкер синтези (cPAS) аркылуу ырааттуулукка келтирилет.
Биздин алдын ала жасалган китепкана секвенирлөө кызматы кардарларга ар түрдүү булактардан (мРНК, бүт геном, ампликон жана башкалар) секвенирлөө китепканаларын даярдоого жардам берет.Кийинчерээк, бул китепканаларды Illumina же BGI платформаларында сапатты көзөмөлдөө жана секвенирлөө үчүн секвенирлөө борборлорубузга жөнөтсө болот.
