-
Metagenomic Sequencing -NGS
Метагеном организмдердин аралаш коомчулугунун жалпы генетикалык материалдарынын жыйындысын билдирет, мисалы, айлана-чөйрөнүн метагеному, адамдын метагеному ж.б. Анда өстүрүлүүчү жана өстүрүлбөгөн микроорганизмдердин геномдору бар.Метагеномикалык секвенирлөө – бул экологиялык үлгүлөрдөн алынган аралаш геномдук материалдарды анализдөө үчүн колдонулган молекулярдык курал, ал түрлөрдүн көп түрдүүлүгү жана көптүгү, популяциянын түзүлүшү, филогенетикалык байланышы, функционалдык гендер жана экологиялык факторлор менен корреляция тармагы боюнча кеңири маалымат берет.
Платформа:Illumina NovaSeq платформасы
-
Метагеномикалык тизмектөө-Нанопур
Метагеномика – бул экологиялык үлгүлөрдөн алынган аралаш геномдук материалдарды талдоо үчүн колдонулган молекулярдык курал, ал түрлөрдүн көп түрдүүлүгү жана көптүгү, популяциянын түзүлүшү, филогенетикалык байланышы, функционалдык гендер жана айлана-чөйрөнүн факторлору менен корреляция тармагы боюнча кеңири маалымат берет. метагеномикалык изилдөөлөр үчүн.Окуу узундугу боюнча анын мыкты көрсөткүчтөрү ылдый агымдын метагеномдук анализин, айрыкча метагеномдун жыйындысын кыйла жакшыртты.Окуу узундугунун артыкчылыктарын колдонуп, Nanopore негизиндеги метагеномикалык изилдөө ок атуучу курал метагеномикасына салыштырмалуу үзгүлтүксүз чогулушка жетише алат.Nanopore негизиндеги метагеномика микробиомалардан толук жана жабык бактериялык геномдорду ийгиликтүү жаратканы жарыяланган (Moss, EL, et. al.,Жаратылыш биотехнологиясы, 2020)
Платформа:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S жана 18S рРНКдагы жогорку деңгээлде сакталган жана гипер өзгөрмөлүү аймактарды камтыган суббирдик прокариоттук жана эукариоттук организмдерди идентификациялоо үчүн идеалдуу молекулярдык манжа изи болуп саналат.Секвенирлөөнүн артыкчылыктарынан пайдаланып, бул ампликондорду консервацияланган бөлүктөрдүн негизинде бутага алса болот жана гипер-өзгөрмө аймактар микробдордун ар түрдүүлүгүн талдоо, таксономия, филогения ж.б. камтыган изилдөөлөргө салым кошкон микробдук идентификация үчүн толук мүнөздөлүшү мүмкүн. Бир молекулалуу реалдуу убакыт режими (SMRT) ) PacBio платформасын секвенирлөө толук узундуктагы ампликондорду (болжол менен 1,5 Кб) камтый турган өтө так узун окууларды алууга мүмкүндүк берет.Генетикалык талаанын кеңири көрүнүшү бактериялар же козу карындар коомчулугунда түрлөрдүн аннотациясынын чечилишине чоң өбөлгө түздү.
Платформа:PacBio уландысы II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS ампликонун секвенциясы микробдук коомчулуктун филогениясын, таксономиясын жана түрлөрдүн көптүгүн ачууга багытталган, аларда өтө сүйлөшүлгөн жана гипервариабилдүү бөлүктөрүн камтыган чарбалык генетикалык маркерлердин ПТР продуктуларын изилдөө.Бул кемчиликсиз молекулярдык манжа изи Woeses et al, (1977) тарабынан киргизилиши изоляциясыз микробиома профилин түзүүгө мүмкүнчүлүк берет.16S (бактериялар), 18S (грибоктор) жана ички транскрипцияланган спасердин (ITS, козу карындар) секвенциясы мол түрлөрдү да, сейрек кездешүүчү жана белгисиз түрлөрдү да идентификациялоого мүмкүндүк берет.Бул технология адамдын оозу, ичегиси, заңы ж.
Платформа:Illumina NovaSeq платформасы
-
Бактериялык жана грибоктук бүт геномду кайра секвенирлөө
Бактериялык жана козу карындардын бүт геномунун ре-секвенциясы белгилүү бактериялардын жана козу карындардын геномдорун бүтүрүү, ошондой эле бир нече геномдорду салыштыруу же жаңы организмдердин геномдорун картага түшүрүү үчүн маанилүү курал болуп саналат.Так маалымдама геномдорун түзүү, микробдорду идентификациялоо жана башка салыштырма геномдук изилдөөлөрдү жүргүзүү үчүн бактериялардын жана козу карындардын бүтүндөй геномдорун ырааттуулук менен түзүү чоң мааниге ээ.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Метатранскриптомдун ырааттуулугу
Метатранскриптомдун секвенциясы табигый чөйрөдө (мисалы, топурак, суу, деңиз, заң жана ичеги.) ичинде микробдордун ген экспрессиясын аныктайт (эукариоттор да, прокариоттор да) түрлөрдүн, ар кандай экспрессияланган гендердин функционалдык байытуу анализи жана башкалар.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Fungal геному
Biomarker Technologies конкреттүү изилдөө максатына жараша геномду изилдөөнү, майда геномду жана козу карындын толук геномун камсыз кылат.Геномду секвенирлөө, чогултуу жана функционалдык аннотациялоо геномдун жогорку деңгээлине жетишүү үчүн Кийинки муундагы секвенирлөө + Үчүнчү муундагы секвенирлөө айкалыштыруу аркылуу жетишүүгө болот.Hi-C технологиясын хромосома деңгээлинде геномду чогултууну жеңилдетүү үчүн да колдонсо болот.
Платформа:PacBio уландысы II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq платформасы
-
Бактериялардын толук геному
Biomarker Technologies нөл ажырымы бар бактериялардын толук геномун түзүү боюнча секвенирлөө кызматын көрсөтөт.Бактериялардын негизги иш агымы геномдун курулушун бүтүргөн үчүнчү муундун секвенирлөөсүн, монтаждоону, функциялык аннотацияны жана конкреттүү изилдөө максаттарына жооп берген өркүндөтүлгөн биоинформатикалык анализди камтыйт.Бактериялардын геномунун кеңири профили алардын биологиялык процесстеринин негизинде жаткан фундаменталдык механизмдерди ачууга мүмкүнчүлүк берет, бул жогорку эукариоттук түрлөрдөгү геномдук изилдөөлөр үчүн баалуу шилтеме боло алат.
Платформа:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq платформасы
PacBio уландысы II
