Өсүмдүктөрдүн/жаныбарлардын бүтүндөй геномунун тизилиши
1. Кызматтын артыкчылыктары
1000ден ашык түр үчүн геномду тизмелөө боюнча чоң тажрыйба.
Аккумулятордук импакт-фактор 4000ден ашкан 800дөн ашык жарыяланган иштер.
Вариацияларды чакыруу жана функцияларды талдоо боюнча комплекстүү биоинформатика анализи.
2. Кызматтын спецификациялары
| Платформа | Китепкана | Сунушталган катар тереңдик | |
| Illumina | PE 150 | SNP үчүн, InDel чалуу ≥ 10x SV үчүн CNY чалуу ≥ 30x
| |
| Nanopore
| 8 кб | SV үчүн CNY чалуу ≥ 20x | |
| Pacbio | CCS | 15 кб | SNP, InDel, SV, CNY үчүн ≥ 10x чалуу |
3. Үлгү талаптары
| Платформа | Конк.(ng/μL)
| Суммасы (нг)
| Тазалык
| Агароз гели
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. Таза негизги тилкеси жок же чектелгенгелде деградация байкалган. 2. РНКнын же белоктун булгануусу жок же чектелген
| ||||
| Illumina | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| Nanopore
| ≥30 | Маалыматтын түшүмдүүлүгүнө жараша болот 10мкг/клетка | 1.7-2.2 | ≥1,5 | ||
| Pacbio | CCS | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. Биоинформациялык анализ
5. Кызматтын иш агымы
Үлгү жеткирүү
ДНК экстракциясы
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Маалымат жеткирүү
1) Геном картасынын статистикасы
Таблица 1 Карталоонун натыйжасынын статистикасы
Сүрөт 1 Кыстарма өлчөмүн бөлүштүрүү жана камтууну окуйт.
2) Variate Detection
Сүрөт 2 Үлгүлөрдүн арасындагы SNP/INDEL/SV статистикасы жана аннотациясы
3-сүрөт Ватиациялардын геном боюнча бөлүштүрүлүшү
3) Вариациялардын функционалдык аннотациясы
| 2019 | Жаратылыш байланыштары | Бүтүндөй геномдун секвенциясы Brassica napus келип чыгышын жана аны жакшыртууга катышкан генетикалык локустарды ачып берет. |
| 2020 | PNAS | Алтын балыктын (Carassius auratus) эволюциялык келип чыгышы жана колго айлануу тарыхы |
| 2021 | Өсүмдүк биотехнологиясы журналы | Жуттун эки түрүнүн маалымдама геномдору |
| 2021 | Өсүмдүк биотехнологиясы журналы | Өсүмдүк жана май өсүмдүктөрүнүн аллополиплоиддик Brassicajuncea геномдук кол тамгалары жана глюкозинолаттардын топтолушун контролдоочу генетикалык локустар |
| 2019 | Молекулярдык өсүмдүк | Рапс кошулмаларынын бүткүл дүйнөлүк коллекциясын бүтүндөй геномдук ресеквенсациялоо алардын экотиптеринин дивергенциясынын генетикалык негизин ачып берет. |
| 2022 | Багбанчылык изилдөө | Геномдук ассоциациянын анализи дарбыз уруктарынын өлчөмүнүн табигый өзгөрүшүнө молекулярдык түшүнүктөрдү берет |
| 2021 | Эксперименталдык ботаника журналы | Геномдук ассоциациянын изилдөөсү пахтада суукка чыдамдуу GhSAD1 варианттарын аныктайт |
| 2021 | Эксперименталдык ботаника журналы | Геномдук ассоциацияны изилдөө жана транскриптомду салыштыруу рапс уругунда гүл гүлүнүн өлчөмүн көзөмөлдөгөн жаңы QTL жана талапкер гендерди ачып берет. |
